MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_000916	AG	3	6	1614486	1614491	50 %	0 %	50 %	0 %	15679750
32503	NC_000916	CAT	2	6	1614494	1614499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679750
32504	NC_000916	TCA	2	6	1614553	1614558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679750
32505	NC_000916	CCT	2	6	1614644	1614649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679750
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32509	NC_000916	CCA	2	6	1614983	1614988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679750
32510	NC_000916	GTCT	2	8	1615031	1615038	0 %	50 %	25 %	25 %	15679750
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32514	NC_000916	CAT	2	6	1615197	1615202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679750
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32517	NC_000916	GAG	2	6	1615362	1615367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679750
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32534	NC_000916	CACC	3	12	1616197	1616208	25 %	0 %	0 %	75 %	15679751
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32601	NC_000916	AAT	2	6	1619439	1619444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32602	NC_000916	TCC	2	6	1619473	1619478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32603	NC_000916	GGA	2	6	1619482	1619487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32604	NC_000916	T	7	7	1619542	1619548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32605	NC_000916	CAT	2	6	1619569	1619574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679753
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32618	NC_000916	TTA	2	6	1620195	1620200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32620	NC_000916	TC	3	6	1620244	1620249	0 %	50 %	0 %	50 %	15679754
32621	NC_000916	TCC	2	6	1620290	1620295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679754
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32859	NC_000916	ATC	2	6	1633079	1633084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679772
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32977	NC_000916	GGAT	2	8	1639990	1639997	25 %	25 %	50 %	0 %	15679780
32978	NC_000916	CT	3	6	1640067	1640072	0 %	50 %	0 %	50 %	15679780
32979	NC_000916	GAG	2	6	1640138	1640143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679780
32980	NC_000916	CT	4	8	1640278	1640285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32981	NC_000916	ATC	2	6	1640385	1640390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679781
32982	NC_000916	CATCAA	2	12	1640442	1640453	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15679781
32983	NC_000916	CGGC	2	8	1640549	1640556	0 %	0 %	50 %	50 %	15679781
32984	NC_000916	GT	3	6	1640571	1640576	0 %	50 %	50 %	0 %	15679781
32985	NC_000916	CTG	2	6	1640660	1640665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679781
32986	NC_000916	TAT	2	6	1640829	1640834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679781
32987	NC_000916	TCC	2	6	1640880	1640885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679781
32988	NC_000916	TCA	2	6	1640897	1640902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679781
32989	NC_000916	CAG	2	6	1640919	1640924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679781
32990	NC_000916	ACATCA	2	12	1640984	1640995	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15679781
32991	NC_000916	AGG	2	6	1641050	1641055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679781
32992	NC_000916	ATG	2	6	1641074	1641079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679781
32993	NC_000916	AATTC	2	10	1641122	1641131	40 %	40 %	0 %	20 %	15679782
32994	NC_000916	T	6	6	1641141	1641146	0 %	100 %	0 %	0 %	15679782
32995	NC_000916	ATA	2	6	1641170	1641175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679782
32996	NC_000916	TAA	2	6	1641190	1641195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679782
32997	NC_000916	TCA	2	6	1641213	1641218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679782
32998	NC_000916	CTCA	2	8	1641248	1641255	25 %	25 %	0 %	50 %	15679782
32999	NC_000916	CTGTA	2	10	1641286	1641295	20 %	40 %	20 %	20 %	15679782
33000	NC_000916	CTC	2	6	1641302	1641307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679782

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