MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_000916	CCA	2	6	1563665	1563670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31502	NC_000916	TTA	2	6	1563672	1563677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31503	NC_000916	TA	4	8	1563722	1563729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31504	NC_000916	CAT	2	6	1563749	1563754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31505	NC_000916	TAA	2	6	1563765	1563770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31506	NC_000916	A	7	7	1563820	1563826	100 %	0 %	0 %	0 %	15679702
31507	NC_000916	ATA	2	6	1563887	1563892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679702
31508	NC_000916	CCT	2	6	1563905	1563910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679702
31509	NC_000916	TGAC	2	8	1563948	1563955	25 %	25 %	25 %	25 %	15679702
31510	NC_000916	GAA	2	6	1564060	1564065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679702
31511	NC_000916	CA	3	6	1564090	1564095	50 %	0 %	0 %	50 %	15679702
31512	NC_000916	TGC	2	6	1564110	1564115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31513	NC_000916	GCC	2	6	1564136	1564141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679702
31514	NC_000916	TGG	2	6	1564164	1564169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679702
31515	NC_000916	ACC	2	6	1564170	1564175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679702
31516	NC_000916	AG	3	6	1564180	1564185	50 %	0 %	50 %	0 %	15679702
31517	NC_000916	GCA	2	6	1564215	1564220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31518	NC_000916	ACGG	2	8	1564246	1564253	25 %	0 %	50 %	25 %	15679702
31519	NC_000916	GAGG	2	8	1564288	1564295	25 %	0 %	75 %	0 %	15679702
31520	NC_000916	CCT	2	6	1564327	1564332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679702
31521	NC_000916	AGG	2	6	1564353	1564358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31522	NC_000916	GTT	2	6	1564526	1564531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679702
31523	NC_000916	TGC	2	6	1564551	1564556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31524	NC_000916	TGA	2	6	1564582	1564587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679702
31525	NC_000916	GGA	2	6	1564597	1564602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31526	NC_000916	CTG	2	6	1564624	1564629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31527	NC_000916	GCA	2	6	1564631	1564636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31528	NC_000916	GCA	2	6	1564661	1564666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31529	NC_000916	AAG	2	6	1564705	1564710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679702
31530	NC_000916	GGA	2	6	1564765	1564770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31531	NC_000916	GGTG	2	8	1564918	1564925	0 %	25 %	75 %	0 %	15679702
31532	NC_000916	TGA	2	6	1564993	1564998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679702
31533	NC_000916	GAA	2	6	1565083	1565088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679702
31534	NC_000916	GAG	2	6	1565117	1565122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31535	NC_000916	GAG	2	6	1565132	1565137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31536	NC_000916	AGG	2	6	1565285	1565290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31537	NC_000916	GTG	2	6	1565327	1565332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679702
31538	NC_000916	GCT	2	6	1565343	1565348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31539	NC_000916	AAC	2	6	1565422	1565427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679702
31540	NC_000916	TGG	2	6	1565494	1565499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679702
31541	NC_000916	AGC	2	6	1565563	1565568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31542	NC_000916	GAG	2	6	1565618	1565623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31543	NC_000916	GGC	2	6	1565689	1565694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679702
31544	NC_000916	CGT	2	6	1565731	1565736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31545	NC_000916	GAT	2	6	1565786	1565791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679702
31546	NC_000916	GAG	2	6	1565792	1565797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31547	NC_000916	CCT	2	6	1565860	1565865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679702
31548	NC_000916	GCA	2	6	1565870	1565875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679702
31549	NC_000916	GAG	2	6	1565885	1565890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31550	NC_000916	AC	3	6	1565931	1565936	50 %	0 %	0 %	50 %	15679702
31551	NC_000916	GAG	2	6	1566080	1566085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679702
31552	NC_000916	AAT	2	6	1566156	1566161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679703
31553	NC_000916	ATG	2	6	1566229	1566234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679703
31554	NC_000916	A	6	6	1566237	1566242	100 %	0 %	0 %	0 %	15679703
31555	NC_000916	AGG	2	6	1566247	1566252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679703
31556	NC_000916	GGT	2	6	1566336	1566341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679703
31557	NC_000916	TGAG	2	8	1566368	1566375	25 %	25 %	50 %	0 %	15679703
31558	NC_000916	CCT	2	6	1566420	1566425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679703
31559	NC_000916	CCT	2	6	1566434	1566439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679703
31560	NC_000916	TAC	2	6	1566496	1566501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679703
31561	NC_000916	CAC	2	6	1566539	1566544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679703
31562	NC_000916	CAT	2	6	1566593	1566598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679703
31563	NC_000916	GAT	3	9	1566610	1566618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679703
31564	NC_000916	GGA	2	6	1566668	1566673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31565	NC_000916	CATG	2	8	1566711	1566718	25 %	25 %	25 %	25 %	15679704
31566	NC_000916	GAG	2	6	1566913	1566918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31567	NC_000916	GAG	2	6	1566939	1566944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31568	NC_000916	GAG	2	6	1567087	1567092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31569	NC_000916	CAAGGG	2	12	1567193	1567204	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15679704
31570	NC_000916	TCT	2	6	1567229	1567234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679704
31571	NC_000916	CA	3	6	1567266	1567271	50 %	0 %	0 %	50 %	15679704
31572	NC_000916	GACAG	2	10	1567291	1567300	40 %	0 %	40 %	20 %	15679704
31573	NC_000916	GCG	2	6	1567307	1567312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679704
31574	NC_000916	GCA	2	6	1567336	1567341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679704
31575	NC_000916	AGA	2	6	1567437	1567442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679704
31576	NC_000916	CA	4	8	1567496	1567503	50 %	0 %	0 %	50 %	15679704
31577	NC_000916	AGG	2	6	1567632	1567637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31578	NC_000916	TCC	2	6	1567694	1567699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679704
31579	NC_000916	GGA	2	6	1567708	1567713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31580	NC_000916	GGA	3	9	1567800	1567808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
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31582	NC_000916	GGC	2	6	1567872	1567877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679704
31583	NC_000916	GAA	2	6	1567882	1567887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679704
31584	NC_000916	GAA	2	6	1567897	1567902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679704
31585	NC_000916	GAG	2	6	1567903	1567908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31586	NC_000916	GAG	2	6	1567912	1567917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31587	NC_000916	GAG	2	6	1567927	1567932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31588	NC_000916	GCA	2	6	1567963	1567968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679704
31589	NC_000916	CCCT	2	8	1567979	1567986	0 %	25 %	0 %	75 %	15679704
31590	NC_000916	GGA	2	6	1567993	1567998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679704
31591	NC_000916	TAA	3	9	1568042	1568050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679704
31592	NC_000916	ATA	2	6	1568084	1568089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679705
31593	NC_000916	GGC	2	6	1568105	1568110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679705
31594	NC_000916	GCAG	2	8	1568279	1568286	25 %	0 %	50 %	25 %	15679705
31595	NC_000916	CCT	2	6	1568365	1568370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679705
31596	NC_000916	GCC	2	6	1568379	1568384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679705
31597	NC_000916	GCT	2	6	1568397	1568402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679705
31598	NC_000916	TGC	2	6	1568421	1568426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679705
31599	NC_000916	GGCC	2	8	1568482	1568489	0 %	0 %	50 %	50 %	15679705
31600	NC_000916	CAG	2	6	1568500	1568505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679705
31601	NC_000916	AGG	2	6	1568576	1568581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679705
31602	NC_000916	AAG	2	6	1568618	1568623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679705
31603	NC_000916	AGGG	2	8	1568648	1568655	25 %	0 %	75 %	0 %	15679705
31604	NC_000916	GAT	2	6	1568678	1568683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679705
31605	NC_000916	A	6	6	1568794	1568799	100 %	0 %	0 %	0 %	15679705
31606	NC_000916	AGA	2	6	1568808	1568813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679705
31607	NC_000916	ACT	2	6	1568864	1568869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679706
31608	NC_000916	GGAT	2	8	1568905	1568912	25 %	25 %	50 %	0 %	15679706
31609	NC_000916	GGAACT	2	12	1568918	1568929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15679706
31610	NC_000916	CAG	2	6	1568949	1568954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679706
31611	NC_000916	TGAGG	2	10	1568972	1568981	20 %	20 %	60 %	0 %	15679706
31612	NC_000916	GGA	2	6	1569005	1569010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679706
31613	NC_000916	ACCC	2	8	1569016	1569023	25 %	0 %	0 %	75 %	15679706
31614	NC_000916	G	6	6	1569093	1569098	0 %	0 %	100 %	0 %	15679706
31615	NC_000916	GAG	2	6	1569120	1569125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679706
31616	NC_000916	CCG	2	6	1569138	1569143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679706
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31618	NC_000916	GAG	2	6	1569348	1569353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679706
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31971	NC_000916	A	6	6	1586608	1586613	100 %	0 %	0 %	0 %	15679726
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31973	NC_000916	AGC	2	6	1586671	1586676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679726
31974	NC_000916	AAC	2	6	1586679	1586684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679726
31975	NC_000916	GGC	2	6	1586758	1586763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679726
31976	NC_000916	GAT	2	6	1586854	1586859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679726
31977	NC_000916	ATG	3	9	1586922	1586930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679726
31978	NC_000916	AAG	2	6	1586974	1586979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679726
31979	NC_000916	AATC	2	8	1586997	1587004	50 %	25 %	0 %	25 %	15679726
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31982	NC_000916	CAT	2	6	1587205	1587210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31983	NC_000916	TTATTC	2	12	1587222	1587233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31984	NC_000916	GATG	2	8	1587289	1587296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31985	NC_000916	GAAAAA	2	12	1587305	1587316	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31986	NC_000916	T	6	6	1587353	1587358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31987	NC_000916	TC	3	6	1587388	1587393	0 %	50 %	0 %	50 %	15679727
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