MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_000916	AAC	2	6	118962	118967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678202
2502	NC_000916	CCA	2	6	118988	118993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678202
2503	NC_000916	TCA	2	6	119066	119071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678202
2504	NC_000916	CAT	2	6	119085	119090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678202
2505	NC_000916	CCT	2	6	119148	119153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678202
2506	NC_000916	GGCG	2	8	119178	119185	0 %	0 %	75 %	25 %	15678202
2507	NC_000916	TCC	2	6	119201	119206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678202
2508	NC_000916	TCAC	2	8	119230	119237	25 %	25 %	0 %	50 %	15678202
2509	NC_000916	CAT	2	6	119265	119270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678202
2510	NC_000916	CCTT	2	8	119351	119358	0 %	50 %	0 %	50 %	15678202
2511	NC_000916	GTC	2	6	119420	119425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678202
2512	NC_000916	CAGG	2	8	119441	119448	25 %	0 %	50 %	25 %	15678202
2513	NC_000916	CAT	2	6	119493	119498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678202
2514	NC_000916	CGG	2	6	119546	119551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678202
2515	NC_000916	GGA	2	6	119628	119633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2516	NC_000916	GAG	3	9	119640	119648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2517	NC_000916	GGA	2	6	119649	119654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2518	NC_000916	ACTTCA	2	12	119711	119722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678202
2519	NC_000916	GAA	2	6	119742	119747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678202
2520	NC_000916	GGA	2	6	119826	119831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2521	NC_000916	G	6	6	119855	119860	0 %	0 %	100 %	0 %	15678202
2522	NC_000916	AAG	2	6	119886	119891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678202
2523	NC_000916	GGTG	2	8	119909	119916	0 %	25 %	75 %	0 %	15678202
2524	NC_000916	AGG	2	6	120005	120010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2525	NC_000916	GAG	2	6	120057	120062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2526	NC_000916	GCC	2	6	120151	120156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678202
2527	NC_000916	AGG	2	6	120176	120181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2528	NC_000916	AGG	2	6	120211	120216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2529	NC_000916	CCAT	2	8	120248	120255	25 %	25 %	0 %	50 %	15678202
2530	NC_000916	GGGA	2	8	120275	120282	25 %	0 %	75 %	0 %	15678202
2531	NC_000916	CCA	2	6	120300	120305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678202
2532	NC_000916	GGT	2	6	120321	120326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678202
2533	NC_000916	CAT	2	6	120327	120332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678202
2534	NC_000916	AGG	2	6	120395	120400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2535	NC_000916	CTC	2	6	120403	120408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678202
2536	NC_000916	CAC	2	6	120418	120423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678202
2537	NC_000916	AAC	2	6	120433	120438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678202
2538	NC_000916	GAT	2	6	120475	120480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678202
2539	NC_000916	AG	3	6	120597	120602	50 %	0 %	50 %	0 %	15678202
2540	NC_000916	CCT	2	6	120608	120613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678202
2541	NC_000916	CCA	2	6	120627	120632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678202
2542	NC_000916	GGTG	2	8	120660	120667	0 %	25 %	75 %	0 %	15678202
2543	NC_000916	TCA	3	9	120707	120715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678202
2544	NC_000916	GGA	2	6	120780	120785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2545	NC_000916	TGG	2	6	120881	120886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678202
2546	NC_000916	GGA	2	6	120930	120935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678202
2547	NC_000916	CAGGTT	2	12	120942	120953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15678202
2548	NC_000916	GTT	2	6	120964	120969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678202
2549	NC_000916	TGA	2	6	120988	120993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678202
2550	NC_000916	TGA	2	6	121047	121052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_000916	AGG	2	6	121200	121205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678203
2552	NC_000916	CCT	2	6	121412	121417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678203
2553	NC_000916	TGG	2	6	121453	121458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678203
2554	NC_000916	CAG	2	6	121465	121470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678203
2555	NC_000916	ACCTC	2	10	121578	121587	20 %	20 %	0 %	60 %	15678203
2556	NC_000916	CTT	2	6	121647	121652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678203
2557	NC_000916	CTC	2	6	121737	121742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678203
2558	NC_000916	GAA	2	6	121754	121759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678203
2559	NC_000916	AAT	2	6	121994	121999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678203
2560	NC_000916	ATC	2	6	122048	122053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678203
2561	NC_000916	CAG	2	6	122129	122134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678203
2562	NC_000916	GATG	2	8	122189	122196	25 %	25 %	50 %	0 %	15678203
2563	NC_000916	GGA	2	6	122216	122221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678203
2564	NC_000916	CCAG	2	8	122226	122233	25 %	0 %	25 %	50 %	15678203
2565	NC_000916	GAG	3	9	122258	122266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678203
2566	NC_000916	GGA	2	6	122364	122369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_000916	ATC	2	6	122401	122406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_000916	GTA	2	6	122431	122436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_000916	TGG	2	6	122439	122444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_000916	CAG	2	6	122498	122503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678204
2571	NC_000916	GGA	2	6	122531	122536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2572	NC_000916	CATA	2	8	122698	122705	50 %	25 %	0 %	25 %	15678204
2573	NC_000916	ATA	2	6	122847	122852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678204
2574	NC_000916	ACC	2	6	122906	122911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678204
2575	NC_000916	AGG	2	6	122925	122930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2576	NC_000916	AGG	2	6	122938	122943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2577	NC_000916	GA	3	6	122988	122993	50 %	0 %	50 %	0 %	15678204
2578	NC_000916	ATG	2	6	122994	122999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678204
2579	NC_000916	AC	3	6	123024	123029	50 %	0 %	0 %	50 %	15678204
2580	NC_000916	CCTGA	2	10	123030	123039	20 %	20 %	20 %	40 %	15678204
2581	NC_000916	TCG	2	6	123136	123141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678204
2582	NC_000916	CAAGGC	2	12	123178	123189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678204
2583	NC_000916	CCT	2	6	123293	123298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678204
2584	NC_000916	AC	3	6	123370	123375	50 %	0 %	0 %	50 %	15678204
2585	NC_000916	GAG	2	6	123402	123407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2586	NC_000916	GGA	2	6	123409	123414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2587	NC_000916	AAGG	2	8	123458	123465	50 %	0 %	50 %	0 %	15678204
2588	NC_000916	ACG	2	6	123481	123486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678204
2589	NC_000916	CCT	2	6	123533	123538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678204
2590	NC_000916	CTT	2	6	123611	123616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678204
2591	NC_000916	AGG	2	6	123717	123722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2592	NC_000916	GTG	3	9	123801	123809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678204
2593	NC_000916	GAG	2	6	123900	123905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2594	NC_000916	ATGG	2	8	123933	123940	25 %	25 %	50 %	0 %	15678204
2595	NC_000916	ACC	2	6	124017	124022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678204
2596	NC_000916	TGA	2	6	124025	124030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678204
2597	NC_000916	TGG	2	6	124048	124053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678204
2598	NC_000916	CTC	2	6	124086	124091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678204
2599	NC_000916	GAT	2	6	124098	124103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678204
2600	NC_000916	GAG	2	6	124115	124120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2601	NC_000916	AT	3	6	124146	124151	50 %	50 %	0 %	0 %	15678204
2602	NC_000916	CCTG	2	8	124248	124255	0 %	25 %	25 %	50 %	15678204
2603	NC_000916	GAG	2	6	124272	124277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2604	NC_000916	AAGG	2	8	124292	124299	50 %	0 %	50 %	0 %	15678204
2605	NC_000916	AAT	2	6	124338	124343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678204
2606	NC_000916	TGA	3	9	124379	124387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678204
2607	NC_000916	AGGCA	2	10	124400	124409	40 %	0 %	40 %	20 %	15678204
2608	NC_000916	CTC	2	6	124410	124415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678204
2609	NC_000916	GAG	2	6	124422	124427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2610	NC_000916	ATG	2	6	124428	124433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678204
2611	NC_000916	AGG	2	6	124469	124474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678204
2612	NC_000916	AGC	2	6	124510	124515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678205
2613	NC_000916	GTT	2	6	124584	124589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678205
2614	NC_000916	AGGA	2	8	124602	124609	50 %	0 %	50 %	0 %	15678205
2615	NC_000916	ATA	2	6	124614	124619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678205
2616	NC_000916	A	6	6	124619	124624	100 %	0 %	0 %	0 %	15678205
2617	NC_000916	AGA	2	6	124657	124662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678205
2618	NC_000916	GGA	2	6	124766	124771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678205
2619	NC_000916	G	7	7	124797	124803	0 %	0 %	100 %	0 %	15678205
2620	NC_000916	GCTGA	2	10	124826	124835	20 %	20 %	40 %	20 %	15678205
2621	NC_000916	AGG	2	6	124887	124892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678206
2622	NC_000916	CAA	2	6	124921	124926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678206
2623	NC_000916	CTA	2	6	124975	124980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678206
2624	NC_000916	GCA	2	6	124997	125002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678206
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2997	NC_000916	GAA	2	6	143981	143986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678228
2998	NC_000916	CAG	2	6	144035	144040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678228
2999	NC_000916	GAA	2	6	144062	144067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678228
3000	NC_000916	GGA	2	6	144104	144109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678228

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