MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_000916	CAT	2	6	1412708	1412713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28502	NC_000916	TC	3	6	1412826	1412831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28503	NC_000916	TA	3	6	1412875	1412880	50 %	50 %	0 %	0 %	15679543
28504	NC_000916	GCA	2	6	1412932	1412937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679543
28505	NC_000916	GCG	2	6	1412959	1412964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679543
28506	NC_000916	GAC	2	6	1412994	1412999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679543
28507	NC_000916	CT	4	8	1413046	1413053	0 %	50 %	0 %	50 %	15679543
28508	NC_000916	CCAT	2	8	1413064	1413071	25 %	25 %	0 %	50 %	15679543
28509	NC_000916	TCA	2	6	1413136	1413141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679543
28510	NC_000916	TCC	2	6	1413179	1413184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679543
28511	NC_000916	AT	3	6	1413224	1413229	50 %	50 %	0 %	0 %	15679543
28512	NC_000916	CCA	2	6	1413266	1413271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679543
28513	NC_000916	ATTAT	2	10	1413364	1413373	40 %	60 %	0 %	0 %	15679543
28514	NC_000916	CCA	2	6	1413410	1413415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679543
28515	NC_000916	AGG	2	6	1413427	1413432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679543
28516	NC_000916	CTC	2	6	1413447	1413452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679543
28517	NC_000916	GCT	2	6	1413479	1413484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679543
28518	NC_000916	ACC	2	6	1413489	1413494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679543
28519	NC_000916	TCA	2	6	1413553	1413558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679543
28520	NC_000916	CT	3	6	1413579	1413584	0 %	50 %	0 %	50 %	15679543
28521	NC_000916	CAC	2	6	1413602	1413607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28522	NC_000916	AT	3	6	1413623	1413628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28523	NC_000916	AT	3	6	1413675	1413680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28524	NC_000916	GGA	2	6	1413828	1413833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679544
28525	NC_000916	CATGT	2	10	1413950	1413959	20 %	40 %	20 %	20 %	15679544
28526	NC_000916	AGCGG	2	10	1413961	1413970	20 %	0 %	60 %	20 %	15679544
28527	NC_000916	AGG	2	6	1414010	1414015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679544
28528	NC_000916	TGC	2	6	1414069	1414074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679544
28529	NC_000916	GGTA	2	8	1414134	1414141	25 %	25 %	50 %	0 %	15679544
28530	NC_000916	A	6	6	1414152	1414157	100 %	0 %	0 %	0 %	15679544
28531	NC_000916	A	6	6	1414182	1414187	100 %	0 %	0 %	0 %	15679545
28532	NC_000916	AGA	2	6	1414284	1414289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679545
28533	NC_000916	GAT	2	6	1414339	1414344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679545
28534	NC_000916	AC	3	6	1414345	1414350	50 %	0 %	0 %	50 %	15679545
28535	NC_000916	TGG	2	6	1414383	1414388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679545
28536	NC_000916	AGG	2	6	1414574	1414579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679545
28537	NC_000916	GAG	2	6	1414691	1414696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679545
28538	NC_000916	AGG	2	6	1414770	1414775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679545
28539	NC_000916	ATCTG	2	10	1414975	1414984	20 %	40 %	20 %	20 %	15679545
28540	NC_000916	ATAAAG	2	12	1415039	1415050	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15679545
28541	NC_000916	CAA	2	6	1415145	1415150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679545
28542	NC_000916	GCA	2	6	1415221	1415226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679545
28543	NC_000916	ACT	2	6	1415235	1415240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679545
28544	NC_000916	AGG	2	6	1415303	1415308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679545
28545	NC_000916	GAGG	2	8	1415344	1415351	25 %	0 %	75 %	0 %	15679545
28546	NC_000916	G	7	7	1415369	1415375	0 %	0 %	100 %	0 %	15679545
28547	NC_000916	TGGA	2	8	1415379	1415386	25 %	25 %	50 %	0 %	15679545
28548	NC_000916	CTG	2	6	1415433	1415438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679545
28549	NC_000916	AAT	2	6	1415488	1415493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679545
28550	NC_000916	GGC	2	6	1415501	1415506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679545
28551	NC_000916	TTG	2	6	1415508	1415513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679545
28552	NC_000916	CATG	2	8	1415529	1415536	25 %	25 %	25 %	25 %	15679545
28553	NC_000916	CA	3	6	1415566	1415571	50 %	0 %	0 %	50 %	15679545
28554	NC_000916	GAC	2	6	1415755	1415760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679545
28555	NC_000916	GCA	2	6	1415816	1415821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679545
28556	NC_000916	GATG	2	8	1415864	1415871	25 %	25 %	50 %	0 %	15679545
28557	NC_000916	GCAT	2	8	1415876	1415883	25 %	25 %	25 %	25 %	15679545
28558	NC_000916	CGG	2	6	1415895	1415900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679545
28559	NC_000916	AT	3	6	1415976	1415981	50 %	50 %	0 %	0 %	15679545
28560	NC_000916	AGG	2	6	1415999	1416004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679545
28561	NC_000916	GGT	2	6	1416060	1416065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679545
28562	NC_000916	CGG	2	6	1416098	1416103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28563	NC_000916	GAT	2	6	1416136	1416141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28564	NC_000916	GTA	2	6	1416185	1416190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679546
28565	NC_000916	CTT	2	6	1416201	1416206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679546
28566	NC_000916	GAG	2	6	1416290	1416295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679546
28567	NC_000916	TGT	2	6	1416358	1416363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679546
28568	NC_000916	TA	3	6	1416398	1416403	50 %	50 %	0 %	0 %	15679546
28569	NC_000916	CTT	2	6	1416407	1416412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679546
28570	NC_000916	TCA	2	6	1416510	1416515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679546
28571	NC_000916	GAG	2	6	1416533	1416538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679546
28572	NC_000916	GTG	2	6	1416599	1416604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679546
28573	NC_000916	AGG	2	6	1416801	1416806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679546
28574	NC_000916	GTTG	2	8	1416812	1416819	0 %	50 %	50 %	0 %	15679546
28575	NC_000916	TGT	2	6	1416844	1416849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679546
28576	NC_000916	ATC	2	6	1416875	1416880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679546
28577	NC_000916	GA	3	6	1416903	1416908	50 %	0 %	50 %	0 %	15679546
28578	NC_000916	ATG	2	6	1417174	1417179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679547
28579	NC_000916	ATCA	2	8	1417221	1417228	50 %	25 %	0 %	25 %	15679547
28580	NC_000916	ATC	2	6	1417335	1417340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679547
28581	NC_000916	CT	3	6	1417362	1417367	0 %	50 %	0 %	50 %	15679547
28582	NC_000916	CT	3	6	1417371	1417376	0 %	50 %	0 %	50 %	15679547
28583	NC_000916	TGAAC	2	10	1417380	1417389	40 %	20 %	20 %	20 %	15679547
28584	NC_000916	T	6	6	1417395	1417400	0 %	100 %	0 %	0 %	15679547
28585	NC_000916	CTC	2	6	1417429	1417434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679547
28586	NC_000916	T	6	6	1417435	1417440	0 %	100 %	0 %	0 %	15679547
28587	NC_000916	TCC	2	6	1417465	1417470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679547
28588	NC_000916	CAA	2	6	1417484	1417489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679547
28589	NC_000916	TCA	2	6	1417576	1417581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679547
28590	NC_000916	AGG	2	6	1417630	1417635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679547
28591	NC_000916	AAG	2	6	1417636	1417641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679547
28592	NC_000916	CCT	2	6	1417680	1417685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679547
28593	NC_000916	GGTATG	2	12	1417722	1417733	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15679547
28594	NC_000916	GGT	2	6	1417794	1417799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679547
28595	NC_000916	CT	3	6	1417855	1417860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28596	NC_000916	CAT	2	6	1417881	1417886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28597	NC_000916	GGC	2	6	1417995	1418000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679548
28598	NC_000916	AGGG	2	8	1418038	1418045	25 %	0 %	75 %	0 %	15679548
28599	NC_000916	TGG	2	6	1418078	1418083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679548
28600	NC_000916	AG	3	6	1418157	1418162	50 %	0 %	50 %	0 %	15679548
28601	NC_000916	ATAA	2	8	1418164	1418171	75 %	25 %	0 %	0 %	15679548
28602	NC_000916	GGA	2	6	1418177	1418182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
28603	NC_000916	CCT	2	6	1418193	1418198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679548
28604	NC_000916	CAG	2	6	1418211	1418216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679548
28605	NC_000916	AGG	2	6	1418258	1418263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
28606	NC_000916	TG	3	6	1418518	1418523	0 %	50 %	50 %	0 %	15679548
28607	NC_000916	GCTG	2	8	1418605	1418612	0 %	25 %	50 %	25 %	15679548
28608	NC_000916	G	6	6	1418633	1418638	0 %	0 %	100 %	0 %	15679548
28609	NC_000916	GTT	2	6	1418644	1418649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679548
28610	NC_000916	GTG	2	6	1418837	1418842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679548
28611	NC_000916	TGC	2	6	1418850	1418855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679548
28612	NC_000916	GAG	2	6	1418881	1418886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
28613	NC_000916	TCC	2	6	1418894	1418899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679548
28614	NC_000916	GCAT	2	8	1419040	1419047	25 %	25 %	25 %	25 %	15679548
28615	NC_000916	AC	3	6	1419076	1419081	50 %	0 %	0 %	50 %	15679548
28616	NC_000916	TCAGG	2	10	1419113	1419122	20 %	20 %	40 %	20 %	15679548
28617	NC_000916	TGG	2	6	1419131	1419136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679548
28618	NC_000916	GAG	2	6	1419147	1419152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
28619	NC_000916	TCA	2	6	1419236	1419241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679548
28620	NC_000916	GAG	2	6	1419244	1419249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
28621	NC_000916	TGA	2	6	1419294	1419299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679548
28622	NC_000916	GAG	2	6	1419331	1419336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
28623	NC_000916	GAG	2	6	1419372	1419377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
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28650	NC_000916	TA	5	10	1420588	1420597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28651	NC_000916	ATT	2	6	1420623	1420628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28733	NC_000916	CGG	2	6	1425155	1425160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679554
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28977	NC_000916	CAT	2	6	1438223	1438228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679565
28978	NC_000916	TGGT	2	8	1438233	1438240	0 %	50 %	50 %	0 %	15679565
28979	NC_000916	TCA	2	6	1438242	1438247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679565
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