MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_000916	CGTC	2	8	1387739	1387746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28002	NC_000916	T	6	6	1387800	1387805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28003	NC_000916	ATC	2	6	1387836	1387841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28004	NC_000916	GAC	2	6	1387861	1387866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28005	NC_000916	TGG	2	6	1387884	1387889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679524
28006	NC_000916	AGAGG	2	10	1387957	1387966	40 %	0 %	60 %	0 %	15679524
28007	NC_000916	TAA	2	6	1388085	1388090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679524
28008	NC_000916	GAG	2	6	1388159	1388164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679524
28009	NC_000916	CCAT	2	8	1388172	1388179	25 %	25 %	0 %	50 %	15679524
28010	NC_000916	CTT	2	6	1388212	1388217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679524
28011	NC_000916	G	6	6	1388226	1388231	0 %	0 %	100 %	0 %	15679524
28012	NC_000916	GTC	2	6	1388300	1388305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679524
28013	NC_000916	GCA	2	6	1388354	1388359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679524
28014	NC_000916	AGA	2	6	1388361	1388366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679524
28015	NC_000916	AAT	2	6	1388377	1388382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679524
28016	NC_000916	CTG	2	6	1388462	1388467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679524
28017	NC_000916	TGG	2	6	1388529	1388534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679524
28018	NC_000916	TGG	2	6	1388536	1388541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679524
28019	NC_000916	ACA	2	6	1388601	1388606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679524
28020	NC_000916	TG	3	6	1388631	1388636	0 %	50 %	50 %	0 %	15679524
28021	NC_000916	AGG	2	6	1388652	1388657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679524
28022	NC_000916	TGA	2	6	1388722	1388727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679524
28023	NC_000916	ACA	2	6	1388753	1388758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679524
28024	NC_000916	CTT	2	6	1389106	1389111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679524
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28026	NC_000916	ATA	2	6	1389161	1389166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679524
28027	NC_000916	CAT	3	9	1389273	1389281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28028	NC_000916	CCTT	2	8	1389307	1389314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28029	NC_000916	TA	3	6	1389330	1389335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28032	NC_000916	ATGGAT	2	12	1389523	1389534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679525
28033	NC_000916	AGG	2	6	1389540	1389545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679525
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28035	NC_000916	TG	3	6	1389659	1389664	0 %	50 %	50 %	0 %	15679525
28036	NC_000916	GAA	2	6	1389745	1389750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679525
28037	NC_000916	TGGC	2	8	1389880	1389887	0 %	25 %	50 %	25 %	15679525
28038	NC_000916	TTG	2	6	1389921	1389926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679525
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28040	NC_000916	GAG	2	6	1390046	1390051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679525
28041	NC_000916	CAT	2	6	1390068	1390073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679525
28042	NC_000916	GAT	2	6	1390090	1390095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679525
28043	NC_000916	CCAT	2	8	1390158	1390165	25 %	25 %	0 %	50 %	15679525
28044	NC_000916	GGC	2	6	1390243	1390248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679525
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28053	NC_000916	GGA	2	6	1390812	1390817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679526
28054	NC_000916	AGGG	2	8	1390832	1390839	25 %	0 %	75 %	0 %	15679526
28055	NC_000916	CGG	2	6	1390901	1390906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679526
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28057	NC_000916	ATA	2	6	1390974	1390979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679526
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28068	NC_000916	CGG	2	6	1391275	1391280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679527
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28083	NC_000916	GAT	2	6	1391664	1391669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679528
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28089	NC_000916	TGG	2	6	1391932	1391937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679528
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28091	NC_000916	A	6	6	1391973	1391978	100 %	0 %	0 %	0 %	15679528
28092	NC_000916	CTA	2	6	1392062	1392067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679528
28093	NC_000916	CTG	2	6	1392076	1392081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679528
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28102	NC_000916	TA	3	6	1392570	1392575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28103	NC_000916	TA	3	6	1392578	1392583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28104	NC_000916	TA	4	8	1392594	1392601	50 %	50 %	0 %	0 %	15679530
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28111	NC_000916	CACTCT	2	12	1392874	1392885	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15679530
28112	NC_000916	CAGG	2	8	1392924	1392931	25 %	0 %	50 %	25 %	15679530
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28115	NC_000916	G	7	7	1393046	1393052	0 %	0 %	100 %	0 %	15679530
28116	NC_000916	CA	3	6	1393065	1393070	50 %	0 %	0 %	50 %	15679530
28117	NC_000916	GAGG	2	8	1393154	1393161	25 %	0 %	75 %	0 %	15679530
28118	NC_000916	TGT	2	6	1393181	1393186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679530
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28479	NC_000916	TCA	2	6	1411452	1411457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679541
28480	NC_000916	AC	3	6	1411480	1411485	50 %	0 %	0 %	50 %	15679541
28481	NC_000916	GGC	2	6	1411499	1411504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679541
28482	NC_000916	CAG	2	6	1411531	1411536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679541
28483	NC_000916	ATC	2	6	1411539	1411544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679541
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28491	NC_000916	GAT	2	6	1412095	1412100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679542
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28495	NC_000916	CAT	2	6	1412430	1412435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679542
28496	NC_000916	AGGA	2	8	1412485	1412492	50 %	0 %	50 %	0 %	15679542
28497	NC_000916	CAT	2	6	1412605	1412610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679542
28498	NC_000916	GAG	2	6	1412642	1412647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679542
28499	NC_000916	CAC	2	6	1412654	1412659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679542
28500	NC_000916	CAT	2	6	1412682	1412687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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