MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_000916	CTG	2	6	1335811	1335816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679475
27003	NC_000916	AGG	2	6	1335841	1335846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679475
27004	NC_000916	ACTC	2	8	1335860	1335867	25 %	25 %	0 %	50 %	15679475
27005	NC_000916	ATA	2	6	1335912	1335917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679475
27006	NC_000916	TGA	2	6	1336141	1336146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679476
27007	NC_000916	CAG	2	6	1336182	1336187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679476
27008	NC_000916	CCACTC	2	12	1336199	1336210	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15679476
27009	NC_000916	GAGG	2	8	1336216	1336223	25 %	0 %	75 %	0 %	15679476
27010	NC_000916	GCA	2	6	1336287	1336292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27011	NC_000916	TTC	2	6	1336325	1336330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27012	NC_000916	TCA	2	6	1336356	1336361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27013	NC_000916	GACA	2	8	1336379	1336386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27014	NC_000916	CCT	2	6	1336389	1336394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27015	NC_000916	ATC	2	6	1336424	1336429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679477
27016	NC_000916	CTT	2	6	1336447	1336452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679477
27017	NC_000916	AC	3	6	1336470	1336475	50 %	0 %	0 %	50 %	15679477
27018	NC_000916	ATA	2	6	1336523	1336528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679477
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27020	NC_000916	AC	3	6	1336646	1336651	50 %	0 %	0 %	50 %	15679477
27021	NC_000916	GAG	2	6	1336727	1336732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679477
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27024	NC_000916	CAG	2	6	1336863	1336868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679477
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27027	NC_000916	TA	3	6	1336985	1336990	50 %	50 %	0 %	0 %	15679477
27028	NC_000916	AGC	2	6	1336992	1336997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679477
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27032	NC_000916	TG	3	6	1337274	1337279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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27102	NC_000916	CT	3	6	1341226	1341231	0 %	50 %	0 %	50 %	15679481
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27119	NC_000916	TGA	2	6	1342197	1342202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679482
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27122	NC_000916	TGA	2	6	1342317	1342322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679482
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27187	NC_000916	AT	3	6	1345496	1345501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27359	NC_000916	GAA	2	6	1354609	1354614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679494
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27361	NC_000916	CTC	2	6	1354767	1354772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679495
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27390	NC_000916	ATTC	2	8	1356202	1356209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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27476	NC_000916	CTG	2	6	1360231	1360236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679500
27477	NC_000916	TCATG	2	10	1360276	1360285	20 %	40 %	20 %	20 %	15679500
27478	NC_000916	CCG	2	6	1360392	1360397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679500
27479	NC_000916	CTC	2	6	1360510	1360515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679501
27480	NC_000916	TATGT	2	10	1360549	1360558	20 %	60 %	20 %	0 %	15679501
27481	NC_000916	GGA	2	6	1360581	1360586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679501
27482	NC_000916	GAG	3	9	1360630	1360638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679501
27483	NC_000916	CCT	2	6	1360641	1360646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679501
27484	NC_000916	GTCT	2	8	1360660	1360667	0 %	50 %	25 %	25 %	15679501
27485	NC_000916	CAT	2	6	1360792	1360797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679501
27486	NC_000916	GCT	2	6	1360816	1360821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679502
27487	NC_000916	TCC	2	6	1360846	1360851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679502
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27489	NC_000916	GT	3	6	1360936	1360941	0 %	50 %	50 %	0 %	15679502
27490	NC_000916	CCT	2	6	1360974	1360979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679502
27491	NC_000916	GTT	3	9	1361163	1361171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679502
27492	NC_000916	GCG	2	6	1361176	1361181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679502
27493	NC_000916	GGA	2	6	1361216	1361221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679502
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27495	NC_000916	TC	4	8	1361290	1361297	0 %	50 %	0 %	50 %	15679502
27496	NC_000916	TCA	2	6	1361374	1361379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679502
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27500	NC_000916	GCCT	2	8	1361670	1361677	0 %	25 %	25 %	50 %	15679502

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