MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_000916	CCT	2	6	1311742	1311747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26503	NC_000916	TCA	2	6	1311837	1311842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26504	NC_000916	AGG	2	6	1311864	1311869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26505	NC_000916	ATT	2	6	1311929	1311934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679447
26506	NC_000916	ATC	2	6	1311935	1311940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679447
26507	NC_000916	ATT	3	9	1311947	1311955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679447
26508	NC_000916	TAAT	2	8	1311969	1311976	50 %	50 %	0 %	0 %	15679447
26509	NC_000916	AT	3	6	1311992	1311997	50 %	50 %	0 %	0 %	15679447
26510	NC_000916	TGG	2	6	1312053	1312058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679447
26511	NC_000916	GCG	2	6	1312072	1312077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679447
26512	NC_000916	T	6	6	1312163	1312168	0 %	100 %	0 %	0 %	15679447
26513	NC_000916	ATC	2	6	1312196	1312201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679447
26514	NC_000916	CTC	2	6	1312202	1312207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679447
26515	NC_000916	AGCA	2	8	1312225	1312232	50 %	0 %	25 %	25 %	15679447
26516	NC_000916	AGGG	2	8	1312235	1312242	25 %	0 %	75 %	0 %	15679447
26517	NC_000916	TG	3	6	1312302	1312307	0 %	50 %	50 %	0 %	15679447
26518	NC_000916	TACA	2	8	1312376	1312383	50 %	25 %	0 %	25 %	15679447
26519	NC_000916	GAG	2	6	1312393	1312398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679447
26520	NC_000916	GAT	2	6	1312414	1312419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679447
26521	NC_000916	ATA	2	6	1312439	1312444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679447
26522	NC_000916	TCC	2	6	1312455	1312460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679447
26523	NC_000916	TCCT	2	8	1312464	1312471	0 %	50 %	0 %	50 %	15679447
26524	NC_000916	TGG	2	6	1312524	1312529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679448
26525	NC_000916	AGGG	2	8	1312657	1312664	25 %	0 %	75 %	0 %	15679448
26526	NC_000916	GGA	2	6	1312675	1312680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679448
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26529	NC_000916	TTC	2	6	1312730	1312735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679448
26530	NC_000916	CTG	2	6	1312742	1312747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679448
26531	NC_000916	GTT	2	6	1312757	1312762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679448
26532	NC_000916	CTC	2	6	1312765	1312770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679448
26533	NC_000916	TCA	3	9	1312847	1312855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679448
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26535	NC_000916	GCA	2	6	1313051	1313056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679448
26536	NC_000916	CTG	2	6	1313079	1313084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679448
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26539	NC_000916	A	7	7	1313155	1313161	100 %	0 %	0 %	0 %	15679448
26540	NC_000916	GCTG	2	8	1313212	1313219	0 %	25 %	50 %	25 %	15679448
26541	NC_000916	GTT	2	6	1313246	1313251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26542	NC_000916	GAG	2	6	1313289	1313294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679449
26543	NC_000916	ATC	2	6	1313350	1313355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679449
26544	NC_000916	TC	3	6	1313378	1313383	0 %	50 %	0 %	50 %	15679449
26545	NC_000916	GT	3	6	1313443	1313448	0 %	50 %	50 %	0 %	15679449
26546	NC_000916	CTG	2	6	1313518	1313523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679449
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26552	NC_000916	GGC	2	6	1313753	1313758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484928
26553	NC_000916	TCCA	2	8	1313769	1313776	25 %	25 %	0 %	50 %	161484928
26554	NC_000916	GTA	2	6	1313999	1314004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484928
26555	NC_000916	G	6	6	1314019	1314024	0 %	0 %	100 %	0 %	161484928
26556	NC_000916	CCAC	2	8	1314033	1314040	25 %	0 %	0 %	75 %	161484928
26557	NC_000916	GAA	2	6	1314044	1314049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161484928
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26564	NC_000916	CCT	2	6	1314706	1314711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161484928
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26566	NC_000916	CA	3	6	1314948	1314953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26567	NC_000916	CACC	2	8	1315018	1315025	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26568	NC_000916	AT	3	6	1315034	1315039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26569	NC_000916	TA	4	8	1315103	1315110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26570	NC_000916	AGAT	2	8	1315143	1315150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26571	NC_000916	GGGGA	2	10	1315151	1315160	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26572	NC_000916	GT	3	6	1315183	1315188	0 %	50 %	50 %	0 %	15679451
26573	NC_000916	AGG	2	6	1315428	1315433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679451
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26579	NC_000916	AAGG	2	8	1315586	1315593	50 %	0 %	50 %	0 %	15679451
26580	NC_000916	TGAGG	2	10	1315679	1315688	20 %	20 %	60 %	0 %	15679451
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26585	NC_000916	CATTTC	2	12	1315954	1315965	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26586	NC_000916	TCA	2	6	1316017	1316022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26587	NC_000916	AAGAT	2	10	1316200	1316209	60 %	20 %	20 %	0 %	15679452
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26591	NC_000916	CGT	2	6	1316342	1316347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679452
26592	NC_000916	CTC	2	6	1316372	1316377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679452
26593	NC_000916	GGAAT	2	10	1316415	1316424	40 %	20 %	40 %	0 %	15679452
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26603	NC_000916	AGGA	2	8	1316943	1316950	50 %	0 %	50 %	0 %	15679452
26604	NC_000916	CTG	2	6	1316969	1316974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679452
26605	NC_000916	TCCT	2	8	1317003	1317010	0 %	50 %	0 %	50 %	15679452
26606	NC_000916	GAA	2	6	1317017	1317022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679452
26607	NC_000916	CCTG	2	8	1317023	1317030	0 %	25 %	25 %	50 %	15679452
26608	NC_000916	AT	3	6	1317036	1317041	50 %	50 %	0 %	0 %	15679452
26609	NC_000916	AAG	2	6	1317072	1317077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679452
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26612	NC_000916	GAG	2	6	1317258	1317263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679452
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26615	NC_000916	GGA	2	6	1317467	1317472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679452
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26620	NC_000916	TGC	2	6	1317577	1317582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679452
26621	NC_000916	CACC	2	8	1317595	1317602	25 %	0 %	0 %	75 %	15679452
26622	NC_000916	AGA	2	6	1317721	1317726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679452
26623	NC_000916	GTT	3	9	1317759	1317767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679452
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26625	NC_000916	TAA	2	6	1317936	1317941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679452
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26629	NC_000916	ACA	3	9	1318072	1318080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26675	NC_000916	TA	3	6	1320663	1320668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26676	NC_000916	T	6	6	1320747	1320752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26691	NC_000916	TAAA	2	8	1321333	1321340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26692	NC_000916	CAT	2	6	1321353	1321358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26731	NC_000916	CTA	2	6	1323245	1323250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679458
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26734	NC_000916	CTT	2	6	1323312	1323317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679458
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26736	NC_000916	GGC	2	6	1323447	1323452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679458
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26976	NC_000916	TAA	2	6	1334517	1334522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26977	NC_000916	TGA	2	6	1334527	1334532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679474
26978	NC_000916	CAA	2	6	1334653	1334658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679474
26979	NC_000916	GACA	2	8	1334710	1334717	50 %	0 %	25 %	25 %	15679474
26980	NC_000916	GGT	2	6	1334774	1334779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679474
26981	NC_000916	AGC	2	6	1334792	1334797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679474
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