MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_000916	TCC	2	6	1287897	1287902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679420
26003	NC_000916	CAA	2	6	1288006	1288011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679420
26004	NC_000916	CTG	2	6	1288025	1288030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679420
26005	NC_000916	CAT	2	6	1288051	1288056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679420
26006	NC_000916	CT	3	6	1288062	1288067	0 %	50 %	0 %	50 %	15679420
26007	NC_000916	CA	3	6	1288099	1288104	50 %	0 %	0 %	50 %	15679420
26008	NC_000916	TCA	2	6	1288143	1288148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679421
26009	NC_000916	TCC	2	6	1288211	1288216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679421
26010	NC_000916	ACC	2	6	1288223	1288228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679421
26011	NC_000916	GCG	2	6	1288236	1288241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679421
26012	NC_000916	ATCC	2	8	1288322	1288329	25 %	25 %	0 %	50 %	15679421
26013	NC_000916	GAG	2	6	1288340	1288345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679421
26014	NC_000916	TGCT	2	8	1288384	1288391	0 %	50 %	25 %	25 %	15679421
26015	NC_000916	GTG	2	6	1288455	1288460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679421
26016	NC_000916	CCCT	2	8	1288464	1288471	0 %	25 %	0 %	75 %	15679421
26017	NC_000916	CTC	2	6	1288499	1288504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679421
26018	NC_000916	TTC	2	6	1288512	1288517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679421
26019	NC_000916	AG	3	6	1288628	1288633	50 %	0 %	50 %	0 %	15679421
26020	NC_000916	CTC	2	6	1288724	1288729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679421
26021	NC_000916	CAGG	2	8	1288816	1288823	25 %	0 %	50 %	25 %	15679421
26022	NC_000916	CCT	2	6	1288924	1288929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679421
26023	NC_000916	ATG	2	6	1288932	1288937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679421
26024	NC_000916	CAAGGG	2	12	1288993	1289004	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15679421
26025	NC_000916	G	6	6	1289002	1289007	0 %	0 %	100 %	0 %	15679421
26026	NC_000916	AAC	2	6	1289105	1289110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679421
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26028	NC_000916	CGA	2	6	1289152	1289157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679421
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26030	NC_000916	TC	3	6	1289233	1289238	0 %	50 %	0 %	50 %	15679421
26031	NC_000916	CTT	2	6	1289261	1289266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679421
26032	NC_000916	CAA	2	6	1289323	1289328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679421
26033	NC_000916	CGT	2	6	1289353	1289358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679421
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26035	NC_000916	TTA	2	6	1289374	1289379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679421
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26037	NC_000916	GAG	2	6	1289463	1289468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679421
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26039	NC_000916	AGGA	2	8	1289502	1289509	50 %	0 %	50 %	0 %	15679422
26040	NC_000916	TC	3	6	1289515	1289520	0 %	50 %	0 %	50 %	15679422
26041	NC_000916	TG	3	6	1289577	1289582	0 %	50 %	50 %	0 %	15679422
26042	NC_000916	GAT	2	6	1289606	1289611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679422
26043	NC_000916	CCTT	2	8	1289627	1289634	0 %	50 %	0 %	50 %	15679422
26044	NC_000916	TTTCA	2	10	1289667	1289676	20 %	60 %	0 %	20 %	15679422
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26047	NC_000916	CCCT	2	8	1289779	1289786	0 %	25 %	0 %	75 %	15679422
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26050	NC_000916	TTC	2	6	1289928	1289933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679423
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26052	NC_000916	CTC	2	6	1290017	1290022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679423
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26055	NC_000916	CCAT	2	8	1290246	1290253	25 %	25 %	0 %	50 %	15679423
26056	NC_000916	GCA	2	6	1290261	1290266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679423
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26058	NC_000916	GCAT	2	8	1290330	1290337	25 %	25 %	25 %	25 %	15679423
26059	NC_000916	TCT	2	6	1290364	1290369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679423
26060	NC_000916	TTA	2	6	1290390	1290395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679423
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26062	NC_000916	CCT	2	6	1290425	1290430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26063	NC_000916	CAGT	2	8	1290431	1290438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26064	NC_000916	TCAG	2	8	1290481	1290488	25 %	25 %	25 %	25 %	15679424
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26068	NC_000916	TGA	2	6	1290708	1290713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679424
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26072	NC_000916	TGA	2	6	1290918	1290923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679424
26073	NC_000916	CCTC	2	8	1290930	1290937	0 %	25 %	0 %	75 %	15679424
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26089	NC_000916	CCAGA	2	10	1291578	1291587	40 %	0 %	20 %	40 %	15679424
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26101	NC_000916	TA	3	6	1292519	1292524	50 %	50 %	0 %	0 %	15679425
26102	NC_000916	AGGG	2	8	1292560	1292567	25 %	0 %	75 %	0 %	15679425
26103	NC_000916	AT	3	6	1292588	1292593	50 %	50 %	0 %	0 %	15679425
26104	NC_000916	CTC	2	6	1292623	1292628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679425
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26110	NC_000916	AGCAG	2	10	1293046	1293055	40 %	0 %	40 %	20 %	15679425
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26113	NC_000916	CAATA	2	10	1293235	1293244	60 %	20 %	0 %	20 %	15679425
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26245	NC_000916	GGCT	2	8	1298812	1298819	0 %	25 %	50 %	25 %	15679432
26246	NC_000916	T	6	6	1298850	1298855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26247	NC_000916	TGG	2	6	1298904	1298909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26248	NC_000916	CCAT	2	8	1298954	1298961	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26249	NC_000916	AG	3	6	1298967	1298972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26250	NC_000916	CTG	2	6	1299113	1299118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679433
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26348	NC_000916	TC	3	6	1304078	1304083	0 %	50 %	0 %	50 %	15679441
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26355	NC_000916	GGC	2	6	1304264	1304269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679441
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26357	NC_000916	GAT	2	6	1304304	1304309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679441
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26359	NC_000916	CTG	2	6	1304426	1304431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679441
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26477	NC_000916	AAGTAG	2	12	1310211	1310222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15679445
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26480	NC_000916	TGA	2	6	1310431	1310436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679446
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