MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_000916	GGGT	2	8	1263241	1263248	0 %	25 %	75 %	0 %	15679393
25503	NC_000916	GCT	2	6	1263249	1263254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679393
25504	NC_000916	CGC	2	6	1263262	1263267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679393
25505	NC_000916	A	6	6	1263278	1263283	100 %	0 %	0 %	0 %	15679393
25506	NC_000916	GCA	2	6	1263326	1263331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679393
25507	NC_000916	CCCT	2	8	1263335	1263342	0 %	25 %	0 %	75 %	15679393
25508	NC_000916	TGA	3	9	1263427	1263435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679393
25509	NC_000916	GCA	2	6	1263479	1263484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679393
25510	NC_000916	CAC	3	9	1263496	1263504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679393
25511	NC_000916	CAG	2	6	1263562	1263567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679393
25512	NC_000916	CAT	3	9	1263625	1263633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25513	NC_000916	TCAG	2	8	1263650	1263657	25 %	25 %	25 %	25 %	15679394
25514	NC_000916	AAC	2	6	1263659	1263664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679394
25515	NC_000916	ATCTGC	2	12	1263685	1263696	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15679394
25516	NC_000916	CTT	2	6	1263735	1263740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679394
25517	NC_000916	ACC	2	6	1263744	1263749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679394
25518	NC_000916	GGAC	2	8	1263758	1263765	25 %	0 %	50 %	25 %	15679394
25519	NC_000916	GAA	2	6	1263902	1263907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679394
25520	NC_000916	ATC	3	9	1263974	1263982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679394
25521	NC_000916	GAG	2	6	1264004	1264009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679394
25522	NC_000916	ATG	2	6	1264050	1264055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679394
25523	NC_000916	AGG	2	6	1264143	1264148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679394
25524	NC_000916	GA	3	6	1264206	1264211	50 %	0 %	50 %	0 %	15679394
25525	NC_000916	TGG	2	6	1264261	1264266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679394
25526	NC_000916	CCT	2	6	1264324	1264329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679394
25527	NC_000916	CCTGG	2	10	1264364	1264373	0 %	20 %	40 %	40 %	15679394
25528	NC_000916	TGGA	2	8	1264448	1264455	25 %	25 %	50 %	0 %	15679394
25529	NC_000916	AG	3	6	1264462	1264467	50 %	0 %	50 %	0 %	15679394
25530	NC_000916	TCT	2	6	1264471	1264476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679394
25531	NC_000916	GTGA	2	8	1264515	1264522	25 %	25 %	50 %	0 %	15679394
25532	NC_000916	CTTC	2	8	1264645	1264652	0 %	50 %	0 %	50 %	15679394
25533	NC_000916	CAT	2	6	1264782	1264787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679395
25534	NC_000916	AG	3	6	1264791	1264796	50 %	0 %	50 %	0 %	15679395
25535	NC_000916	TTC	2	6	1264797	1264802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679395
25536	NC_000916	GGTG	2	8	1264809	1264816	0 %	25 %	75 %	0 %	15679395
25537	NC_000916	AT	3	6	1264932	1264937	50 %	50 %	0 %	0 %	15679395
25538	NC_000916	CTC	2	6	1265046	1265051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679395
25539	NC_000916	TC	3	6	1265076	1265081	0 %	50 %	0 %	50 %	15679395
25540	NC_000916	CTG	2	6	1265135	1265140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679395
25541	NC_000916	CTGGC	2	10	1265180	1265189	0 %	20 %	40 %	40 %	15679395
25542	NC_000916	GCCC	2	8	1265221	1265228	0 %	0 %	25 %	75 %	15679395
25543	NC_000916	TAT	2	6	1265247	1265252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679395
25544	NC_000916	GCA	2	6	1265301	1265306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679395
25545	NC_000916	CCAT	2	8	1265320	1265327	25 %	25 %	0 %	50 %	15679395
25546	NC_000916	GCA	2	6	1265404	1265409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679395
25547	NC_000916	TCAGGG	2	12	1265461	1265472	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15679395
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25549	NC_000916	CGT	2	6	1265543	1265548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679395
25550	NC_000916	TGA	2	6	1265568	1265573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679395
25551	NC_000916	T	7	7	1265617	1265623	0 %	100 %	0 %	0 %	15679395
25552	NC_000916	GGA	2	6	1265631	1265636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679395
25553	NC_000916	TTC	2	6	1265776	1265781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679396
25554	NC_000916	ATGGTG	2	12	1265800	1265811	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15679396
25555	NC_000916	GAT	2	6	1265896	1265901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679396
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25558	NC_000916	CCT	2	6	1266030	1266035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679396
25559	NC_000916	GGC	2	6	1266048	1266053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679396
25560	NC_000916	CAG	2	6	1266067	1266072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25563	NC_000916	CTC	2	6	1266230	1266235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679397
25564	NC_000916	CCA	2	6	1266250	1266255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679397
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25567	NC_000916	CTG	2	6	1266384	1266389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679397
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25570	NC_000916	TATC	2	8	1266514	1266521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25571	NC_000916	AAT	2	6	1266583	1266588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25572	NC_000916	TAA	2	6	1266684	1266689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25573	NC_000916	TTA	2	6	1266694	1266699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25574	NC_000916	GAT	2	6	1266757	1266762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679398
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25579	NC_000916	TGC	2	6	1266897	1266902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679398
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25583	NC_000916	TCAAC	2	10	1267124	1267133	40 %	20 %	0 %	40 %	15679398
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25587	NC_000916	CA	3	6	1267481	1267486	50 %	0 %	0 %	50 %	15679398
25588	NC_000916	TCA	2	6	1267601	1267606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679398
25589	NC_000916	GAG	2	6	1267804	1267809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679399
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25592	NC_000916	TGA	2	6	1268108	1268113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679399
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25594	NC_000916	CTGT	2	8	1268168	1268175	0 %	50 %	25 %	25 %	15679399
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25598	NC_000916	GGTG	3	12	1268377	1268388	0 %	25 %	75 %	0 %	15679399
25599	NC_000916	GCA	2	6	1268411	1268416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679399
25600	NC_000916	ACT	2	6	1268438	1268443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679399
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25603	NC_000916	AAG	2	6	1268632	1268637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679400
25604	NC_000916	GAG	2	6	1268761	1268766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679400
25605	NC_000916	TAT	2	6	1268779	1268784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679400
25606	NC_000916	GAG	2	6	1268852	1268857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679400
25607	NC_000916	GTT	2	6	1268978	1268983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679400
25608	NC_000916	GAG	2	6	1269001	1269006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679400
25609	NC_000916	A	6	6	1269115	1269120	100 %	0 %	0 %	0 %	15679400
25610	NC_000916	GTG	2	6	1269206	1269211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679400
25611	NC_000916	CCAT	2	8	1269226	1269233	25 %	25 %	0 %	50 %	15679400
25612	NC_000916	AGA	2	6	1269360	1269365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679400
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25614	NC_000916	ACC	2	6	1269398	1269403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679400
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25618	NC_000916	TCTCT	2	10	1269809	1269818	0 %	60 %	0 %	40 %	15679400
25619	NC_000916	CAT	2	6	1269845	1269850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25678	NC_000916	ACC	2	6	1272382	1272387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25856	NC_000916	TCT	2	6	1280216	1280221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679412
25857	NC_000916	TCC	2	6	1280248	1280253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679412
25858	NC_000916	AT	3	6	1280313	1280318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25859	NC_000916	AGA	2	6	1280513	1280518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679413
25860	NC_000916	TCC	2	6	1280554	1280559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679413
25861	NC_000916	TCC	3	9	1280605	1280613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679413
25862	NC_000916	CCT	2	6	1280621	1280626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679413
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25864	NC_000916	CCA	2	6	1280741	1280746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679413
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25866	NC_000916	TCC	2	6	1280965	1280970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679413
25867	NC_000916	TGA	2	6	1280984	1280989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679413
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25870	NC_000916	CT	3	6	1281041	1281046	0 %	50 %	0 %	50 %	15679413
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25874	NC_000916	GCCT	2	8	1281343	1281350	0 %	25 %	25 %	50 %	15679414
25875	NC_000916	TCC	2	6	1281373	1281378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679414
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25878	NC_000916	TC	3	6	1281818	1281823	0 %	50 %	0 %	50 %	15679414
25879	NC_000916	AGT	3	9	1281838	1281846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679414
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25882	NC_000916	CTTCCT	2	12	1281893	1281904	0 %	50 %	0 %	50 %	15679414
25883	NC_000916	ATC	2	6	1281927	1281932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679414
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25888	NC_000916	CTG	2	6	1282098	1282103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679414
25889	NC_000916	TG	3	6	1282182	1282187	0 %	50 %	50 %	0 %	15679414
25890	NC_000916	TAT	2	6	1282193	1282198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679414
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25900	NC_000916	ACAG	2	8	1282745	1282752	50 %	0 %	25 %	25 %	15679414
25901	NC_000916	TTATC	2	10	1282756	1282765	20 %	60 %	0 %	20 %	15679414
25902	NC_000916	TA	3	6	1282823	1282828	50 %	50 %	0 %	0 %	15679414
25903	NC_000916	GTATGA	2	12	1282847	1282858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679414
25904	NC_000916	TGAG	2	8	1282891	1282898	25 %	25 %	50 %	0 %	15679414
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25909	NC_000916	TGA	2	6	1283206	1283211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679414
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25914	NC_000916	ATTT	2	8	1283314	1283321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25915	NC_000916	AGGTTC	2	12	1283323	1283334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25916	NC_000916	AAG	2	6	1283401	1283406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25917	NC_000916	GAT	2	6	1283429	1283434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25918	NC_000916	GCA	2	6	1283500	1283505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679415
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25926	NC_000916	CAC	2	6	1284009	1284014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679416
25927	NC_000916	CCTT	2	8	1284015	1284022	0 %	50 %	0 %	50 %	15679416
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25933	NC_000916	TGGC	2	8	1284212	1284219	0 %	25 %	50 %	25 %	15679416
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25947	NC_000916	CT	3	6	1285394	1285399	0 %	50 %	0 %	50 %	15679418
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25952	NC_000916	GAAA	2	8	1285691	1285698	75 %	0 %	25 %	0 %	15679418
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25960	NC_000916	TCC	2	6	1285998	1286003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679418
25961	NC_000916	TCACAA	2	12	1286004	1286015	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15679418
25962	NC_000916	ATC	2	6	1286023	1286028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679418
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25971	NC_000916	AATC	2	8	1286487	1286494	50 %	25 %	0 %	25 %	15679418
25972	NC_000916	GGA	2	6	1286545	1286550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679418
25973	NC_000916	CAG	2	6	1286598	1286603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679418
25974	NC_000916	AGG	2	6	1286654	1286659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679418
25975	NC_000916	TA	3	6	1286664	1286669	50 %	50 %	0 %	0 %	15679418
25976	NC_000916	ACA	2	6	1286813	1286818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679419
25977	NC_000916	TCA	2	6	1286839	1286844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679419
25978	NC_000916	TGA	2	6	1286914	1286919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679420
25979	NC_000916	TCA	2	6	1286931	1286936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679420
25980	NC_000916	CA	3	6	1286953	1286958	50 %	0 %	0 %	50 %	15679420
25981	NC_000916	GGC	2	6	1286975	1286980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679420
25982	NC_000916	TCC	2	6	1287018	1287023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679420
25983	NC_000916	ACC	2	6	1287033	1287038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679420
25984	NC_000916	CTG	2	6	1287067	1287072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679420
25985	NC_000916	CTG	2	6	1287099	1287104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679420
25986	NC_000916	GCA	2	6	1287105	1287110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679420
25987	NC_000916	GCA	2	6	1287120	1287125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679420
25988	NC_000916	CAGG	2	8	1287147	1287154	25 %	0 %	50 %	25 %	15679420
25989	NC_000916	TCC	2	6	1287181	1287186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679420
25990	NC_000916	ATC	3	9	1287236	1287244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679420
25991	NC_000916	GTG	2	6	1287246	1287251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679420
25992	NC_000916	CTC	2	6	1287257	1287262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679420
25993	NC_000916	TCA	2	6	1287312	1287317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679420
25994	NC_000916	GAC	2	6	1287378	1287383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679420
25995	NC_000916	TCA	2	6	1287411	1287416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679420
25996	NC_000916	GATG	2	8	1287420	1287427	25 %	25 %	50 %	0 %	15679420
25997	NC_000916	AGTGAA	2	12	1287431	1287442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15679420
25998	NC_000916	TGTAA	2	10	1287473	1287482	40 %	40 %	20 %	0 %	15679420
25999	NC_000916	GGC	2	6	1287593	1287598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679420
26000	NC_000916	ACC	2	6	1287614	1287619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679420

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