MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_000916	TGT	2	6	1238279	1238284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679373
25002	NC_000916	ACG	2	6	1238325	1238330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679373
25003	NC_000916	GCTT	2	8	1238374	1238381	0 %	50 %	25 %	25 %	15679373
25004	NC_000916	TGA	2	6	1238393	1238398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679373
25005	NC_000916	GT	3	6	1238413	1238418	0 %	50 %	50 %	0 %	15679373
25006	NC_000916	G	7	7	1238425	1238431	0 %	0 %	100 %	0 %	15679373
25007	NC_000916	CCTCGC	2	12	1238533	1238544	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15679373
25008	NC_000916	ATC	2	6	1238553	1238558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679373
25009	NC_000916	GCT	2	6	1238589	1238594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679373
25010	NC_000916	CAT	2	6	1238635	1238640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679373
25011	NC_000916	CTC	2	6	1238708	1238713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679373
25012	NC_000916	GCA	2	6	1238780	1238785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679373
25013	NC_000916	TCT	2	6	1238866	1238871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679373
25014	NC_000916	CTC	2	6	1238933	1238938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679373
25015	NC_000916	C	6	6	1238982	1238987	0 %	0 %	0 %	100 %	15679373
25016	NC_000916	GAG	2	6	1238990	1238995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679373
25017	NC_000916	CGGGG	2	10	1239007	1239016	0 %	0 %	80 %	20 %	15679373
25018	NC_000916	G	6	6	1239013	1239018	0 %	0 %	100 %	0 %	15679373
25019	NC_000916	GAGT	2	8	1239218	1239225	25 %	25 %	50 %	0 %	15679373
25020	NC_000916	TACCTG	2	12	1239283	1239294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15679373
25021	NC_000916	CCA	2	6	1239297	1239302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679373
25022	NC_000916	GGT	2	6	1239322	1239327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679373
25023	NC_000916	CAT	2	6	1239385	1239390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679373
25024	NC_000916	GCT	2	6	1239449	1239454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679373
25025	NC_000916	TCCC	2	8	1239516	1239523	0 %	25 %	0 %	75 %	15679373
25026	NC_000916	TCCT	2	8	1239528	1239535	0 %	50 %	0 %	50 %	15679373
25027	NC_000916	TTC	2	6	1239724	1239729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679374
25028	NC_000916	TCCT	2	8	1239779	1239786	0 %	50 %	0 %	50 %	15679374
25029	NC_000916	CTG	2	6	1240005	1240010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679374
25030	NC_000916	TCA	2	6	1240035	1240040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679374
25031	NC_000916	TAT	2	6	1240096	1240101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679374
25032	NC_000916	CTGCT	2	10	1240150	1240159	0 %	40 %	20 %	40 %	15679374
25033	NC_000916	ACC	3	9	1240211	1240219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679374
25034	NC_000916	TAT	2	6	1240282	1240287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679374
25035	NC_000916	GCTG	2	8	1240317	1240324	0 %	25 %	50 %	25 %	15679374
25036	NC_000916	CT	3	6	1240367	1240372	0 %	50 %	0 %	50 %	15679374
25037	NC_000916	GTC	2	6	1240507	1240512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679374
25038	NC_000916	CT	3	6	1240514	1240519	0 %	50 %	0 %	50 %	15679374
25039	NC_000916	TCC	2	6	1240565	1240570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679374
25040	NC_000916	CTGG	2	8	1240716	1240723	0 %	25 %	50 %	25 %	15679374
25041	NC_000916	GTT	2	6	1240745	1240750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679374
25042	NC_000916	TTG	2	6	1240787	1240792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679374
25043	NC_000916	TCC	2	6	1240826	1240831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679374
25044	NC_000916	CAA	2	6	1240905	1240910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679374
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25046	NC_000916	CAGC	2	8	1241126	1241133	25 %	0 %	25 %	50 %	15679374
25047	NC_000916	TAT	2	6	1241515	1241520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679374
25048	NC_000916	CAG	2	6	1241537	1241542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679374
25049	NC_000916	TAT	2	6	1241605	1241610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679374
25050	NC_000916	TCG	2	6	1241615	1241620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679374
25051	NC_000916	TGCC	2	8	1241670	1241677	0 %	25 %	25 %	50 %	15679374
25052	NC_000916	CTT	2	6	1241710	1241715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679374
25053	NC_000916	TG	3	6	1241752	1241757	0 %	50 %	50 %	0 %	15679374
25054	NC_000916	TCA	2	6	1241837	1241842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679374
25055	NC_000916	CTT	2	6	1241907	1241912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679374
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25057	NC_000916	TCC	2	6	1242098	1242103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679374
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25059	NC_000916	AGG	2	6	1242185	1242190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679374
25060	NC_000916	CCA	2	6	1242217	1242222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679374
25061	NC_000916	TCCA	2	8	1242272	1242279	25 %	25 %	0 %	50 %	15679374
25062	NC_000916	TTG	2	6	1242344	1242349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679374
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25065	NC_000916	GTAT	2	8	1242499	1242506	25 %	50 %	25 %	0 %	15679374
25066	NC_000916	GAAT	2	8	1242574	1242581	50 %	25 %	25 %	0 %	15679374
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25070	NC_000916	GAG	2	6	1242974	1242979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679375
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25072	NC_000916	CGG	2	6	1243165	1243170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679375
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25078	NC_000916	TGCCC	2	10	1243481	1243490	0 %	20 %	20 %	60 %	15679375
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25083	NC_000916	TCG	2	6	1243746	1243751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679375
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25085	NC_000916	CCTT	2	8	1243858	1243865	0 %	50 %	0 %	50 %	15679375
25086	NC_000916	ATA	2	6	1243920	1243925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679375
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25088	NC_000916	TGA	2	6	1243984	1243989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25089	NC_000916	TA	3	6	1244000	1244005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25090	NC_000916	ATG	2	6	1244026	1244031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679376
25091	NC_000916	AG	4	8	1244033	1244040	50 %	0 %	50 %	0 %	15679376
25092	NC_000916	TAA	2	6	1244046	1244051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679376
25093	NC_000916	GGGGAG	2	12	1244166	1244177	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	15679376
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25101	NC_000916	ATC	2	6	1244621	1244626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679377
25102	NC_000916	ATC	2	6	1244663	1244668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679377
25103	NC_000916	CCTC	2	8	1244695	1244702	0 %	25 %	0 %	75 %	15679377
25104	NC_000916	TCA	3	9	1244715	1244723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679377
25105	NC_000916	AGT	2	6	1244772	1244777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679377
25106	NC_000916	CACG	2	8	1244791	1244798	25 %	0 %	25 %	50 %	15679377
25107	NC_000916	TCC	2	6	1244820	1244825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679377
25108	NC_000916	AGA	2	6	1244826	1244831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679377
25109	NC_000916	A	6	6	1244855	1244860	100 %	0 %	0 %	0 %	15679377
25110	NC_000916	A	7	7	1244886	1244892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25111	NC_000916	T	6	6	1244898	1244903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25112	NC_000916	T	8	8	1244906	1244913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25113	NC_000916	TAT	2	6	1244920	1244925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25114	NC_000916	TAT	2	6	1244979	1244984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25115	NC_000916	TCCA	2	8	1245050	1245057	25 %	25 %	0 %	50 %	15679378
25116	NC_000916	AGT	2	6	1245180	1245185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679378
25117	NC_000916	TGC	2	6	1245224	1245229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679378
25118	NC_000916	AGTTCA	2	12	1245261	1245272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15679378
25119	NC_000916	CTC	2	6	1245305	1245310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679378
25120	NC_000916	CACCC	2	10	1245338	1245347	20 %	0 %	0 %	80 %	15679378
25121	NC_000916	TGCC	2	8	1245349	1245356	0 %	25 %	25 %	50 %	15679378
25122	NC_000916	GAC	2	6	1245398	1245403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679378
25123	NC_000916	ACC	2	6	1245435	1245440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679378
25124	NC_000916	CCT	2	6	1245493	1245498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679378
25125	NC_000916	GTA	2	6	1245521	1245526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679378
25126	NC_000916	AGG	2	6	1245555	1245560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679378
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25128	NC_000916	AGG	3	9	1245657	1245665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679378
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25132	NC_000916	CAT	2	6	1245925	1245930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679379
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25211	NC_000916	T	7	7	1249260	1249266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25212	NC_000916	TAAA	2	8	1249276	1249283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25238	NC_000916	TTG	2	6	1250520	1250525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679382
25239	NC_000916	CCT	2	6	1250604	1250609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679382
25240	NC_000916	TGG	2	6	1250645	1250650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679382
25241	NC_000916	CCT	2	6	1250691	1250696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679382
25242	NC_000916	TCC	2	6	1250788	1250793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679382
25243	NC_000916	CCTCT	2	10	1250794	1250803	0 %	40 %	0 %	60 %	15679382
25244	NC_000916	TCC	2	6	1250940	1250945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679382
25245	NC_000916	TC	3	6	1250959	1250964	0 %	50 %	0 %	50 %	15679382
25246	NC_000916	TCT	2	6	1250994	1250999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679382
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25248	NC_000916	TGGCTG	2	12	1251072	1251083	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15679382
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25251	NC_000916	CTT	2	6	1251236	1251241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679383
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25308	NC_000916	TTA	2	6	1253702	1253707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25345	NC_000916	ACT	2	6	1256252	1256257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679387
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25347	NC_000916	GGA	2	6	1256368	1256373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679387
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25349	NC_000916	A	6	6	1256457	1256462	100 %	0 %	0 %	0 %	15679387
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25351	NC_000916	CAA	2	6	1256517	1256522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679387
25352	NC_000916	A	6	6	1256521	1256526	100 %	0 %	0 %	0 %	15679387
25353	NC_000916	AAG	2	6	1256528	1256533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679387
25354	NC_000916	A	6	6	1256537	1256542	100 %	0 %	0 %	0 %	15679387
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25475	NC_000916	GGT	2	6	1262147	1262152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679392
25476	NC_000916	CGC	2	6	1262155	1262160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679392
25477	NC_000916	GCT	2	6	1262168	1262173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679392
25478	NC_000916	CCGTT	2	10	1262230	1262239	0 %	40 %	20 %	40 %	15679392
25479	NC_000916	GAG	2	6	1262333	1262338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679393
25480	NC_000916	TGG	2	6	1262343	1262348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679393
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25482	NC_000916	ACCCC	2	10	1262547	1262556	20 %	0 %	0 %	80 %	15679393
25483	NC_000916	G	6	6	1262569	1262574	0 %	0 %	100 %	0 %	15679393
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25491	NC_000916	GAG	2	6	1262798	1262803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679393
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