MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_000916	CTC	2	6	1212411	1212416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679346
24502	NC_000916	CCT	2	6	1212465	1212470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679346
24503	NC_000916	TAT	2	6	1212479	1212484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679346
24504	NC_000916	GT	3	6	1212517	1212522	0 %	50 %	50 %	0 %	15679346
24505	NC_000916	AGA	2	6	1212716	1212721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679346
24506	NC_000916	TGG	2	6	1212737	1212742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679346
24507	NC_000916	TCA	2	6	1212829	1212834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679346
24508	NC_000916	TCC	2	6	1212865	1212870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679346
24509	NC_000916	CTT	2	6	1212928	1212933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679346
24510	NC_000916	TCC	2	6	1213009	1213014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679346
24511	NC_000916	TTC	2	6	1213037	1213042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679346
24512	NC_000916	GTTT	2	8	1213061	1213068	0 %	75 %	25 %	0 %	15679346
24513	NC_000916	CCT	2	6	1213086	1213091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679346
24514	NC_000916	TGT	2	6	1213109	1213114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679346
24515	NC_000916	CATAGT	2	12	1213181	1213192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15679346
24516	NC_000916	GAA	2	6	1213263	1213268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679346
24517	NC_000916	CCT	2	6	1213298	1213303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679346
24518	NC_000916	C	6	6	1213319	1213324	0 %	0 %	0 %	100 %	15679346
24519	NC_000916	TGA	2	6	1213356	1213361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679346
24520	NC_000916	AGA	2	6	1213418	1213423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679346
24521	NC_000916	CTC	2	6	1213429	1213434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679346
24522	NC_000916	GAC	2	6	1213440	1213445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679346
24523	NC_000916	GGCT	2	8	1213506	1213513	0 %	25 %	50 %	25 %	15679346
24524	NC_000916	TGCCTG	2	12	1213550	1213561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679346
24525	NC_000916	TAT	2	6	1213620	1213625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679346
24526	NC_000916	CCT	2	6	1213695	1213700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679346
24527	NC_000916	AGG	2	6	1213734	1213739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679346
24528	NC_000916	GAA	2	6	1213755	1213760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679346
24529	NC_000916	CCCTTG	2	12	1213771	1213782	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15679346
24530	NC_000916	TCA	2	6	1213799	1213804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679346
24531	NC_000916	AGA	2	6	1213820	1213825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679346
24532	NC_000916	TA	3	6	1213862	1213867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24533	NC_000916	AG	3	6	1213873	1213878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24534	NC_000916	ATA	2	6	1213897	1213902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24535	NC_000916	GACCA	2	10	1213934	1213943	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24536	NC_000916	TCA	2	6	1213944	1213949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24537	NC_000916	TTA	2	6	1213961	1213966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24538	NC_000916	GGTGTG	2	12	1213996	1214007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679347
24539	NC_000916	TCA	2	6	1214086	1214091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679347
24540	NC_000916	TGA	2	6	1214187	1214192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679347
24541	NC_000916	ATCC	2	8	1214288	1214295	25 %	25 %	0 %	50 %	15679347
24542	NC_000916	CAG	2	6	1214320	1214325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679347
24543	NC_000916	CCT	2	6	1214372	1214377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679347
24544	NC_000916	TGA	2	6	1214421	1214426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679347
24545	NC_000916	TCC	2	6	1214429	1214434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679347
24546	NC_000916	TGA	2	6	1214451	1214456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679347
24547	NC_000916	TG	3	6	1214491	1214496	0 %	50 %	50 %	0 %	15679347
24548	NC_000916	AGG	2	6	1214521	1214526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679347
24549	NC_000916	TGT	2	6	1214565	1214570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679347
24550	NC_000916	GCA	2	6	1214585	1214590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679347
24551	NC_000916	CAA	2	6	1214642	1214647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679347
24552	NC_000916	TA	4	8	1214688	1214695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24553	NC_000916	A	8	8	1214700	1214707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24554	NC_000916	CAC	2	6	1214746	1214751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679348
24555	NC_000916	TCC	2	6	1214769	1214774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679348
24556	NC_000916	TGG	2	6	1214856	1214861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679348
24557	NC_000916	AGT	2	6	1214862	1214867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679348
24558	NC_000916	ATC	2	6	1214943	1214948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679348
24559	NC_000916	CCT	2	6	1214954	1214959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679348
24560	NC_000916	TCC	2	6	1214985	1214990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679348
24561	NC_000916	CCT	2	6	1215064	1215069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679348
24562	NC_000916	GAA	2	6	1215107	1215112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679348
24563	NC_000916	CT	3	6	1215129	1215134	0 %	50 %	0 %	50 %	15679348
24564	NC_000916	T	6	6	1215160	1215165	0 %	100 %	0 %	0 %	15679348
24565	NC_000916	TCT	2	6	1215236	1215241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679348
24566	NC_000916	A	6	6	1215517	1215522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24567	NC_000916	TA	3	6	1215524	1215529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24568	NC_000916	GTATA	2	10	1215537	1215546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24569	NC_000916	GAT	2	6	1215555	1215560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24570	NC_000916	TG	3	6	1215573	1215578	0 %	50 %	50 %	0 %	15679349
24571	NC_000916	CAGAG	2	10	1215595	1215604	40 %	0 %	40 %	20 %	15679349
24572	NC_000916	ACTGG	2	10	1215624	1215633	20 %	20 %	40 %	20 %	15679349
24573	NC_000916	AC	3	6	1215669	1215674	50 %	0 %	0 %	50 %	15679349
24574	NC_000916	GGA	2	6	1215778	1215783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679349
24575	NC_000916	AG	3	6	1215803	1215808	50 %	0 %	50 %	0 %	15679349
24576	NC_000916	TGG	2	6	1215864	1215869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679349
24577	NC_000916	AGG	2	6	1215878	1215883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679349
24578	NC_000916	GGA	2	6	1216001	1216006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679349
24579	NC_000916	CCTT	2	8	1216017	1216024	0 %	50 %	0 %	50 %	15679349
24580	NC_000916	CCTT	2	8	1216062	1216069	0 %	50 %	0 %	50 %	15679349
24581	NC_000916	ACG	2	6	1216092	1216097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679349
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24583	NC_000916	TGC	2	6	1216165	1216170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679349
24584	NC_000916	A	6	6	1216172	1216177	100 %	0 %	0 %	0 %	15679349
24585	NC_000916	CCT	2	6	1216249	1216254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679349
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24587	NC_000916	ATA	2	6	1216313	1216318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679349
24588	NC_000916	GAA	3	9	1216351	1216359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679349
24589	NC_000916	CAC	2	6	1216385	1216390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679349
24590	NC_000916	ATG	2	6	1216400	1216405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679349
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24592	NC_000916	GAC	2	6	1216472	1216477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679349
24593	NC_000916	CCT	2	6	1216570	1216575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679349
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24598	NC_000916	AATG	2	8	1216793	1216800	50 %	25 %	25 %	0 %	15679349
24599	NC_000916	TGT	2	6	1216841	1216846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679350
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24602	NC_000916	GAG	2	6	1217052	1217057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679350
24603	NC_000916	TGA	2	6	1217111	1217116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679350
24604	NC_000916	CTT	2	6	1217126	1217131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679350
24605	NC_000916	TGA	2	6	1217132	1217137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679350
24606	NC_000916	TGC	2	6	1217162	1217167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679350
24607	NC_000916	CTC	2	6	1217181	1217186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679350
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24609	NC_000916	GT	3	6	1217279	1217284	0 %	50 %	50 %	0 %	15679351
24610	NC_000916	GGTGT	2	10	1217289	1217298	0 %	40 %	60 %	0 %	15679351
24611	NC_000916	AGG	2	6	1217304	1217309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679351
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24613	NC_000916	G	6	6	1217335	1217340	0 %	0 %	100 %	0 %	15679351
24614	NC_000916	ACA	2	6	1217448	1217453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679351
24615	NC_000916	GAT	2	6	1217465	1217470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679351
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24617	NC_000916	TGT	2	6	1217582	1217587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679351
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24619	NC_000916	CAT	2	6	1217710	1217715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679351
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24850	NC_000916	A	6	6	1230773	1230778	100 %	0 %	0 %	0 %	15679366
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24977	NC_000916	CAC	2	6	1236885	1236890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679372
24978	NC_000916	TAT	2	6	1236905	1236910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679372
24979	NC_000916	GT	3	6	1236920	1236925	0 %	50 %	50 %	0 %	15679372
24980	NC_000916	CCA	2	6	1236932	1236937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679372
24981	NC_000916	GAA	2	6	1236981	1236986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679372
24982	NC_000916	CTG	2	6	1237004	1237009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679372
24983	NC_000916	TGC	2	6	1237017	1237022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679372
24984	NC_000916	CCT	2	6	1237074	1237079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679372
24985	NC_000916	ATG	3	9	1237117	1237125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679372
24986	NC_000916	ATC	2	6	1237212	1237217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679372
24987	NC_000916	GAA	2	6	1237245	1237250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679372
24988	NC_000916	GCT	2	6	1237300	1237305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679372
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24991	NC_000916	CAT	2	6	1237462	1237467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679373
24992	NC_000916	GCC	2	6	1237514	1237519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679373
24993	NC_000916	GGT	2	6	1237520	1237525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679373
24994	NC_000916	GCCC	2	8	1237552	1237559	0 %	0 %	25 %	75 %	15679373
24995	NC_000916	TCCA	2	8	1237835	1237842	25 %	25 %	0 %	50 %	15679373
24996	NC_000916	TCC	2	6	1237914	1237919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679373
24997	NC_000916	CACC	2	8	1237975	1237982	25 %	0 %	0 %	75 %	15679373
24998	NC_000916	CA	3	6	1238087	1238092	50 %	0 %	0 %	50 %	15679373
24999	NC_000916	CAGGC	2	10	1238161	1238170	20 %	0 %	40 %	40 %	15679373
25000	NC_000916	CCGA	2	8	1238202	1238209	25 %	0 %	25 %	50 %	15679373

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