MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_000916	ATT	2	6	1187717	1187722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679315
24002	NC_000916	CTC	2	6	1187782	1187787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24003	NC_000916	GCC	2	6	1187856	1187861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679316
24004	NC_000916	GCG	2	6	1187913	1187918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679316
24005	NC_000916	TCA	2	6	1187919	1187924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679316
24006	NC_000916	CT	3	6	1187991	1187996	0 %	50 %	0 %	50 %	15679316
24007	NC_000916	TGC	2	6	1187998	1188003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679316
24008	NC_000916	CT	3	6	1188105	1188110	0 %	50 %	0 %	50 %	15679316
24009	NC_000916	GAT	2	6	1188212	1188217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679316
24010	NC_000916	GCCC	2	8	1188280	1188287	0 %	0 %	25 %	75 %	15679316
24011	NC_000916	TCC	2	6	1188315	1188320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679316
24012	NC_000916	CAT	2	6	1188343	1188348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679316
24013	NC_000916	TCA	2	6	1188443	1188448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679317
24014	NC_000916	GCT	2	6	1188470	1188475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679317
24015	NC_000916	T	6	6	1188487	1188492	0 %	100 %	0 %	0 %	15679317
24016	NC_000916	AT	3	6	1188509	1188514	50 %	50 %	0 %	0 %	15679317
24017	NC_000916	GGT	2	6	1188537	1188542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679317
24018	NC_000916	TGC	3	9	1188553	1188561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679317
24019	NC_000916	TCC	2	6	1188575	1188580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679317
24020	NC_000916	CTT	2	6	1188590	1188595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679317
24021	NC_000916	GT	4	8	1188611	1188618	0 %	50 %	50 %	0 %	15679317
24022	NC_000916	T	6	6	1188722	1188727	0 %	100 %	0 %	0 %	15679318
24023	NC_000916	CCTT	2	8	1188932	1188939	0 %	50 %	0 %	50 %	15679318
24024	NC_000916	CTC	2	6	1188956	1188961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679318
24025	NC_000916	TGG	2	6	1189080	1189085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679318
24026	NC_000916	GGA	2	6	1189196	1189201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679318
24027	NC_000916	A	6	6	1189219	1189224	100 %	0 %	0 %	0 %	15679318
24028	NC_000916	CTTAC	2	10	1189292	1189301	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24029	NC_000916	TA	4	8	1189325	1189332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24030	NC_000916	TAC	2	6	1189383	1189388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24031	NC_000916	CATG	2	8	1189436	1189443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24032	NC_000916	AGCC	2	8	1189446	1189453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24033	NC_000916	TAT	2	6	1189503	1189508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679319
24034	NC_000916	GT	3	6	1189517	1189522	0 %	50 %	50 %	0 %	15679319
24035	NC_000916	GTC	2	6	1189524	1189529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679319
24036	NC_000916	TC	4	8	1189536	1189543	0 %	50 %	0 %	50 %	15679319
24037	NC_000916	GAG	2	6	1189689	1189694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679319
24038	NC_000916	CCT	2	6	1189715	1189720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679319
24039	NC_000916	T	6	6	1189725	1189730	0 %	100 %	0 %	0 %	15679319
24040	NC_000916	TGA	2	6	1189773	1189778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679319
24041	NC_000916	ACC	3	9	1189780	1189788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679319
24042	NC_000916	C	6	6	1189787	1189792	0 %	0 %	0 %	100 %	15679319
24043	NC_000916	CTG	2	6	1189795	1189800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679319
24044	NC_000916	CCA	2	6	1189895	1189900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679319
24045	NC_000916	GAC	2	6	1190049	1190054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679319
24046	NC_000916	CTC	2	6	1190067	1190072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679319
24047	NC_000916	GA	3	6	1190076	1190081	50 %	0 %	50 %	0 %	15679319
24048	NC_000916	AGG	2	6	1190095	1190100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679319
24049	NC_000916	GTGCT	2	10	1190106	1190115	0 %	40 %	40 %	20 %	15679319
24050	NC_000916	GTT	2	6	1190116	1190121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679319
24051	NC_000916	TCC	2	6	1190132	1190137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679319
24052	NC_000916	CAG	2	6	1190156	1190161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679319
24053	NC_000916	TGA	2	6	1190168	1190173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679319
24054	NC_000916	ACCT	2	8	1190178	1190185	25 %	25 %	0 %	50 %	15679319
24055	NC_000916	GTG	2	6	1190240	1190245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679319
24056	NC_000916	TG	3	6	1190244	1190249	0 %	50 %	50 %	0 %	15679319
24057	NC_000916	TCTGC	2	10	1190363	1190372	0 %	40 %	20 %	40 %	15679319
24058	NC_000916	C	6	6	1190499	1190504	0 %	0 %	0 %	100 %	15679320
24059	NC_000916	CATC	2	8	1190645	1190652	25 %	25 %	0 %	50 %	15679320
24060	NC_000916	AGG	2	6	1190677	1190682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679320
24061	NC_000916	C	6	6	1190685	1190690	0 %	0 %	0 %	100 %	15679320
24062	NC_000916	CGT	2	6	1190702	1190707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679320
24063	NC_000916	CAC	2	6	1190823	1190828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679320
24064	NC_000916	TTATC	2	10	1190897	1190906	20 %	60 %	0 %	20 %	15679320
24065	NC_000916	CCT	2	6	1190922	1190927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679320
24066	NC_000916	CCT	2	6	1190945	1190950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679320
24067	NC_000916	GTTCGG	2	12	1190957	1190968	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15679320
24068	NC_000916	AGT	2	6	1191002	1191007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679320
24069	NC_000916	CTT	2	6	1191018	1191023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679320
24070	NC_000916	TTG	2	6	1191087	1191092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24071	NC_000916	GCC	2	6	1191153	1191158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24072	NC_000916	CAC	2	6	1191159	1191164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24073	NC_000916	CCA	2	6	1191193	1191198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24074	NC_000916	TA	3	6	1191207	1191212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24075	NC_000916	CAA	2	6	1191222	1191227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24076	NC_000916	TTG	2	6	1191323	1191328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679321
24077	NC_000916	GAG	2	6	1191331	1191336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679321
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24079	NC_000916	CAT	2	6	1191480	1191485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679321
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24088	NC_000916	GGA	2	6	1191864	1191869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679321
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24091	NC_000916	GTG	2	6	1192016	1192021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679321
24092	NC_000916	AGG	2	6	1192184	1192189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679321
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24102	NC_000916	CAG	2	6	1192631	1192636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679322
24103	NC_000916	GGA	2	6	1192643	1192648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679322
24104	NC_000916	GGCA	2	8	1192691	1192698	25 %	0 %	50 %	25 %	15679322
24105	NC_000916	TTG	2	6	1192701	1192706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679322
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24107	NC_000916	CATG	2	8	1192782	1192789	25 %	25 %	25 %	25 %	15679322
24108	NC_000916	TGA	2	6	1192816	1192821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679322
24109	NC_000916	C	6	6	1192898	1192903	0 %	0 %	0 %	100 %	15679322
24110	NC_000916	TGG	2	6	1192908	1192913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679322
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24114	NC_000916	TGG	2	6	1193052	1193057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679322
24115	NC_000916	G	6	6	1193064	1193069	0 %	0 %	100 %	0 %	15679322
24116	NC_000916	GGA	2	6	1193227	1193232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679322
24117	NC_000916	GCCA	2	8	1193258	1193265	25 %	0 %	25 %	50 %	15679322
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24240	NC_000916	CAC	2	6	1198824	1198829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679331
24241	NC_000916	TCA	2	6	1198836	1198841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679331
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