MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_000916	CCT	2	6	1164947	1164952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679287
23503	NC_000916	GGA	2	6	1164953	1164958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679287
23504	NC_000916	TGC	2	6	1164962	1164967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679287
23505	NC_000916	AAG	2	6	1164968	1164973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679287
23506	NC_000916	TGG	2	6	1165028	1165033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23507	NC_000916	TC	3	6	1165173	1165178	0 %	50 %	0 %	50 %	15679288
23508	NC_000916	TCC	2	6	1165186	1165191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679288
23509	NC_000916	CCT	2	6	1165208	1165213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679288
23510	NC_000916	GAG	2	6	1165215	1165220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679288
23511	NC_000916	ACCCC	2	10	1165226	1165235	20 %	0 %	0 %	80 %	15679288
23512	NC_000916	TAT	2	6	1165497	1165502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679288
23513	NC_000916	GAA	2	6	1165518	1165523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679288
23514	NC_000916	AT	3	6	1165551	1165556	50 %	50 %	0 %	0 %	15679288
23515	NC_000916	GAT	2	6	1165579	1165584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679288
23516	NC_000916	TCTATC	2	12	1165757	1165768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23517	NC_000916	GCA	2	6	1165786	1165791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23518	NC_000916	CTT	2	6	1165839	1165844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23519	NC_000916	AGTAA	2	10	1165851	1165860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23520	NC_000916	ATG	2	6	1165875	1165880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23521	NC_000916	TA	3	6	1165896	1165901	50 %	50 %	0 %	0 %	15679289
23522	NC_000916	GTG	2	6	1165936	1165941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679289
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23527	NC_000916	C	6	6	1166163	1166168	0 %	0 %	0 %	100 %	15679289
23528	NC_000916	CCA	2	6	1166255	1166260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679289
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23533	NC_000916	CAT	2	6	1166606	1166611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679290
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23541	NC_000916	AT	3	6	1166936	1166941	50 %	50 %	0 %	0 %	15679290
23542	NC_000916	TCC	2	6	1166998	1167003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679290
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23544	NC_000916	TAGA	2	8	1167118	1167125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23545	NC_000916	TGG	2	6	1167244	1167249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679291
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23549	NC_000916	A	6	6	1167341	1167346	100 %	0 %	0 %	0 %	15679291
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23553	NC_000916	CT	3	6	1167595	1167600	0 %	50 %	0 %	50 %	15679291
23554	NC_000916	GGA	2	6	1167614	1167619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679291
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23580	NC_000916	TGCATA	2	12	1168638	1168649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15679291
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23594	NC_000916	ATAA	2	8	1169439	1169446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23598	NC_000916	GAG	2	6	1169598	1169603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679292
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23602	NC_000916	CCT	2	6	1169780	1169785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679292
23603	NC_000916	TAT	2	6	1169805	1169810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679292
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23605	NC_000916	AGG	2	6	1169872	1169877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679292
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23608	NC_000916	A	6	6	1170051	1170056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23609	NC_000916	A	7	7	1170083	1170089	100 %	0 %	0 %	0 %	15679293
23610	NC_000916	GAAG	2	8	1170175	1170182	50 %	0 %	50 %	0 %	15679293
23611	NC_000916	A	6	6	1170277	1170282	100 %	0 %	0 %	0 %	15679293
23612	NC_000916	CAG	2	6	1170355	1170360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679293
23613	NC_000916	ATGG	2	8	1170362	1170369	25 %	25 %	50 %	0 %	15679293
23614	NC_000916	AGG	2	6	1170411	1170416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679293
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23616	NC_000916	ATC	3	9	1170509	1170517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679293
23617	NC_000916	GAG	2	6	1170518	1170523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679293
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23860	NC_000916	GAT	2	6	1181330	1181335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23861	NC_000916	GATTA	2	10	1181355	1181364	40 %	40 %	20 %	0 %	15679305
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23970	NC_000916	CTT	3	9	1186491	1186499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679313
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23978	NC_000916	CTC	2	6	1186807	1186812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679313
23979	NC_000916	CAT	2	6	1186866	1186871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679313
23980	NC_000916	TCA	2	6	1186880	1186885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679313
23981	NC_000916	GAA	2	6	1186947	1186952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679314
23982	NC_000916	TCA	2	6	1186966	1186971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679314
23983	NC_000916	CCT	2	6	1186974	1186979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679314
23984	NC_000916	CTG	2	6	1186983	1186988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679314
23985	NC_000916	CCA	2	6	1186992	1186997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679314
23986	NC_000916	GTT	2	6	1187038	1187043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679314
23987	NC_000916	CAT	2	6	1187057	1187062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679314
23988	NC_000916	TCT	2	6	1187219	1187224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679314
23989	NC_000916	TCC	2	6	1187225	1187230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679314
23990	NC_000916	TAA	2	6	1187287	1187292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679314
23991	NC_000916	TGC	2	6	1187320	1187325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23992	NC_000916	T	6	6	1187333	1187338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23993	NC_000916	TCA	2	6	1187360	1187365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23994	NC_000916	TCC	2	6	1187393	1187398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679315
23995	NC_000916	GGT	2	6	1187409	1187414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679315
23996	NC_000916	ATC	2	6	1187431	1187436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679315
23997	NC_000916	GAG	2	6	1187572	1187577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679315
23998	NC_000916	CCTC	2	8	1187616	1187623	0 %	25 %	0 %	75 %	15679315
23999	NC_000916	TGC	2	6	1187626	1187631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679315
24000	NC_000916	TCC	2	6	1187662	1187667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679315

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