MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_000916	CCT	2	6	1139155	1139160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679252
23002	NC_000916	ATCT	2	8	1139172	1139179	25 %	50 %	0 %	25 %	15679252
23003	NC_000916	TGG	2	6	1139202	1139207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679252
23004	NC_000916	CTGT	2	8	1139278	1139285	0 %	50 %	25 %	25 %	15679252
23005	NC_000916	AAC	2	6	1139368	1139373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679252
23006	NC_000916	CAA	2	6	1139448	1139453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679252
23007	NC_000916	TTG	2	6	1139486	1139491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679252
23008	NC_000916	ATC	2	6	1139546	1139551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679252
23009	NC_000916	ATA	2	6	1139655	1139660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679253
23010	NC_000916	CCTG	2	8	1139662	1139669	0 %	25 %	25 %	50 %	15679253
23011	NC_000916	GCT	2	6	1139681	1139686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679253
23012	NC_000916	GTA	2	6	1139722	1139727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679253
23013	NC_000916	CGG	2	6	1139791	1139796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679253
23014	NC_000916	ATT	2	6	1139852	1139857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679253
23015	NC_000916	CCA	2	6	1139945	1139950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679254
23016	NC_000916	CAC	2	6	1139964	1139969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679254
23017	NC_000916	TAT	2	6	1139985	1139990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679254
23018	NC_000916	GAA	2	6	1140018	1140023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679254
23019	NC_000916	GAA	2	6	1140075	1140080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679254
23020	NC_000916	CTA	2	6	1140128	1140133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679254
23021	NC_000916	CTG	2	6	1140218	1140223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679254
23022	NC_000916	TCC	2	6	1140246	1140251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679254
23023	NC_000916	TC	3	6	1140347	1140352	0 %	50 %	0 %	50 %	15679254
23024	NC_000916	TCCC	2	8	1140355	1140362	0 %	25 %	0 %	75 %	15679255
23025	NC_000916	CCG	2	6	1140421	1140426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679255
23026	NC_000916	ATG	2	6	1140528	1140533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679255
23027	NC_000916	ATC	2	6	1140549	1140554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679255
23028	NC_000916	TAT	2	6	1140566	1140571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679255
23029	NC_000916	CAC	2	6	1140647	1140652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679255
23030	NC_000916	CAT	2	6	1140702	1140707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679256
23031	NC_000916	CAG	2	6	1140765	1140770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679256
23032	NC_000916	CTGAGA	2	12	1140884	1140895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15679256
23033	NC_000916	C	6	6	1140911	1140916	0 %	0 %	0 %	100 %	15679256
23034	NC_000916	TC	3	6	1140917	1140922	0 %	50 %	0 %	50 %	15679256
23035	NC_000916	CCTT	2	8	1140929	1140936	0 %	50 %	0 %	50 %	15679256
23036	NC_000916	TCA	2	6	1140952	1140957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679256
23037	NC_000916	ATG	2	6	1141059	1141064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679257
23038	NC_000916	CAC	2	6	1141067	1141072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679257
23039	NC_000916	GAG	2	6	1141190	1141195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679257
23040	NC_000916	CCTG	2	8	1141224	1141231	0 %	25 %	25 %	50 %	15679257
23041	NC_000916	TGG	2	6	1141277	1141282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679257
23042	NC_000916	ATGC	2	8	1141413	1141420	25 %	25 %	25 %	25 %	15679257
23043	NC_000916	GGC	2	6	1141469	1141474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679257
23044	NC_000916	CCAAGG	2	12	1141479	1141490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679257
23045	NC_000916	ATC	2	6	1141533	1141538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679257
23046	NC_000916	CTC	2	6	1141539	1141544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679257
23047	NC_000916	GAA	2	6	1141598	1141603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679257
23048	NC_000916	CACC	2	8	1141610	1141617	25 %	0 %	0 %	75 %	15679257
23049	NC_000916	GGA	2	6	1141693	1141698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679257
23050	NC_000916	TG	3	6	1141745	1141750	0 %	50 %	50 %	0 %	15679257
23051	NC_000916	AGG	2	6	1141806	1141811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679257
23052	NC_000916	CTC	2	6	1141842	1141847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679257
23053	NC_000916	CAG	3	9	1141910	1141918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679257
23054	NC_000916	ATC	2	6	1141941	1141946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679257
23055	NC_000916	CACC	2	8	1141999	1142006	25 %	0 %	0 %	75 %	15679257
23056	NC_000916	AGA	2	6	1142029	1142034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679257
23057	NC_000916	GTC	2	6	1142051	1142056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679257
23058	NC_000916	GCG	2	6	1142079	1142084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679257
23059	NC_000916	CTT	2	6	1142124	1142129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679257
23060	NC_000916	GAGG	2	8	1142138	1142145	25 %	0 %	75 %	0 %	15679257
23061	NC_000916	TCC	2	6	1142309	1142314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679257
23062	NC_000916	AAT	2	6	1142317	1142322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679257
23063	NC_000916	TAT	2	6	1142348	1142353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679257
23064	NC_000916	GAA	2	6	1142356	1142361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679257
23065	NC_000916	AGG	2	6	1142412	1142417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679257
23066	NC_000916	ACC	2	6	1142448	1142453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679257
23067	NC_000916	TAT	3	9	1142561	1142569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679258
23068	NC_000916	AGGGG	2	10	1142629	1142638	20 %	0 %	80 %	0 %	15679258
23069	NC_000916	AT	3	6	1142684	1142689	50 %	50 %	0 %	0 %	15679258
23070	NC_000916	C	6	6	1142699	1142704	0 %	0 %	0 %	100 %	15679258
23071	NC_000916	CTT	2	6	1142771	1142776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679258
23072	NC_000916	ATC	2	6	1142862	1142867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679258
23073	NC_000916	TTC	2	6	1142869	1142874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679258
23074	NC_000916	TAT	2	6	1142920	1142925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679259
23075	NC_000916	GGC	2	6	1142986	1142991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679259
23076	NC_000916	TGC	2	6	1142995	1143000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679259
23077	NC_000916	GAG	2	6	1143031	1143036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679259
23078	NC_000916	ATC	2	6	1143098	1143103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679259
23079	NC_000916	TCCC	2	8	1143109	1143116	0 %	25 %	0 %	75 %	15679260
23080	NC_000916	GTG	2	6	1143121	1143126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679260
23081	NC_000916	AGT	2	6	1143182	1143187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679260
23082	NC_000916	AAG	2	6	1143202	1143207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679260
23083	NC_000916	ATGC	2	8	1143215	1143222	25 %	25 %	25 %	25 %	15679260
23084	NC_000916	GCT	2	6	1143302	1143307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679260
23085	NC_000916	GAT	2	6	1143323	1143328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679260
23086	NC_000916	AGG	2	6	1143417	1143422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679261
23087	NC_000916	TATGAG	2	12	1143473	1143484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679261
23088	NC_000916	GCGATG	2	12	1143492	1143503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15679261
23089	NC_000916	CAT	2	6	1143626	1143631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679261
23090	NC_000916	TAT	2	6	1143677	1143682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679262
23091	NC_000916	TCC	2	6	1143684	1143689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679262
23092	NC_000916	TGC	2	6	1143866	1143871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679262
23093	NC_000916	AT	3	6	1143899	1143904	50 %	50 %	0 %	0 %	15679262
23094	NC_000916	AAT	2	6	1143979	1143984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23095	NC_000916	ATT	2	6	1143992	1143997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23096	NC_000916	ATA	2	6	1144002	1144007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23097	NC_000916	TA	3	6	1144018	1144023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23098	NC_000916	TAA	2	6	1144029	1144034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23099	NC_000916	GAT	2	6	1144047	1144052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23100	NC_000916	TAA	2	6	1144081	1144086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23101	NC_000916	AG	3	6	1144116	1144121	50 %	0 %	50 %	0 %	15679263
23102	NC_000916	CAT	2	6	1144237	1144242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679263
23103	NC_000916	ATT	2	6	1144272	1144277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679263
23104	NC_000916	CAG	2	6	1144319	1144324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679263
23105	NC_000916	CAG	2	6	1144328	1144333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679263
23106	NC_000916	GAAG	2	8	1144432	1144439	50 %	0 %	50 %	0 %	15679263
23107	NC_000916	TG	3	6	1144500	1144505	0 %	50 %	50 %	0 %	15679263
23108	NC_000916	AGG	2	6	1144614	1144619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679263
23109	NC_000916	CCA	2	6	1144932	1144937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679264
23110	NC_000916	GGA	2	6	1144971	1144976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679264
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23112	NC_000916	GGA	2	6	1145089	1145094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679264
23113	NC_000916	CT	3	6	1145159	1145164	0 %	50 %	0 %	50 %	15679264
23114	NC_000916	TGAA	2	8	1145224	1145231	50 %	25 %	25 %	0 %	15679264
23115	NC_000916	CCT	2	6	1145266	1145271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679264
23116	NC_000916	TGG	2	6	1145352	1145357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679264
23117	NC_000916	TGC	2	6	1145407	1145412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679264
23118	NC_000916	GCT	2	6	1145435	1145440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679264
23119	NC_000916	TA	3	6	1145569	1145574	50 %	50 %	0 %	0 %	15679264
23120	NC_000916	CAT	2	6	1145616	1145621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679264
23121	NC_000916	TAA	2	6	1145765	1145770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23122	NC_000916	GTAT	2	8	1145866	1145873	25 %	50 %	25 %	0 %	15679265
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23124	NC_000916	TAA	2	6	1145906	1145911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679265
23125	NC_000916	TG	3	6	1145917	1145922	0 %	50 %	50 %	0 %	15679265
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23134	NC_000916	GCA	2	6	1146842	1146847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679265
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23143	NC_000916	GGTA	2	8	1147232	1147239	25 %	25 %	50 %	0 %	15679266
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23145	NC_000916	T	6	6	1147306	1147311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23146	NC_000916	CACAG	2	10	1147332	1147341	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23147	NC_000916	TGA	2	6	1147461	1147466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679267
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23151	NC_000916	CCTTC	2	10	1147621	1147630	0 %	40 %	0 %	60 %	15679267
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23156	NC_000916	CTGC	2	8	1147889	1147896	0 %	25 %	25 %	50 %	15679267
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23172	NC_000916	TGC	2	6	1148671	1148676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679267
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23221	NC_000916	GGCG	2	8	1150726	1150733	0 %	0 %	75 %	25 %	15679269
23222	NC_000916	GTC	2	6	1150774	1150779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679269
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23224	NC_000916	GGA	2	6	1150827	1150832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679269
23225	NC_000916	CA	3	6	1150900	1150905	50 %	0 %	0 %	50 %	15679269
23226	NC_000916	CTC	2	6	1150969	1150974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679269
23227	NC_000916	ATG	2	6	1151023	1151028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679269
23228	NC_000916	A	7	7	1151048	1151054	100 %	0 %	0 %	0 %	15679269
23229	NC_000916	A	7	7	1151085	1151091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23230	NC_000916	AGA	2	6	1151094	1151099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679270
23231	NC_000916	TAT	2	6	1151161	1151166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679270
23232	NC_000916	GCAG	2	8	1151179	1151186	25 %	0 %	50 %	25 %	15679270
23233	NC_000916	CCTT	2	8	1151195	1151202	0 %	50 %	0 %	50 %	15679270
23234	NC_000916	TCA	2	6	1151225	1151230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679270
23235	NC_000916	CA	4	8	1151308	1151315	50 %	0 %	0 %	50 %	15679270
23236	NC_000916	TCT	2	6	1151316	1151321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679270
23237	NC_000916	ACTTGT	2	12	1151343	1151354	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15679270
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23256	NC_000916	TTA	2	6	1152260	1152265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23345	NC_000916	TGG	2	6	1156747	1156752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679275
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23349	NC_000916	GGTC	2	8	1157008	1157015	0 %	25 %	50 %	25 %	15679275
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23352	NC_000916	AGGC	2	8	1157215	1157222	25 %	0 %	50 %	25 %	15679275
23353	NC_000916	A	6	6	1157238	1157243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23354	NC_000916	TTA	2	6	1157266	1157271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23355	NC_000916	TTA	2	6	1157286	1157291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23356	NC_000916	ATG	2	6	1157292	1157297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23357	NC_000916	ATGT	2	8	1157374	1157381	25 %	50 %	25 %	0 %	15679276
23358	NC_000916	GGA	2	6	1157395	1157400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679276
23359	NC_000916	CCT	2	6	1157424	1157429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679276
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23361	NC_000916	GAG	2	6	1157548	1157553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679276
23362	NC_000916	AT	3	6	1157558	1157563	50 %	50 %	0 %	0 %	15679276
23363	NC_000916	CCT	2	6	1157610	1157615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679276
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23387	NC_000916	TTC	2	6	1159020	1159025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23423	NC_000916	CAA	2	6	1160524	1160529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23425	NC_000916	TA	3	6	1160584	1160589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23475	NC_000916	TGGT	2	8	1163564	1163571	0 %	50 %	50 %	0 %	15679284
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