MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_000916	CCG	2	6	1117076	1117081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679225
22503	NC_000916	GACA	2	8	1117146	1117153	50 %	0 %	25 %	25 %	15679225
22504	NC_000916	ATA	2	6	1117159	1117164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679225
22505	NC_000916	TGA	2	6	1117182	1117187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679225
22506	NC_000916	TGA	2	6	1117191	1117196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679225
22507	NC_000916	GA	3	6	1117224	1117229	50 %	0 %	50 %	0 %	15679225
22508	NC_000916	CTCC	2	8	1117236	1117243	0 %	25 %	0 %	75 %	15679225
22509	NC_000916	TGA	2	6	1117347	1117352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679225
22510	NC_000916	AG	3	6	1117407	1117412	50 %	0 %	50 %	0 %	15679225
22511	NC_000916	GAGG	2	8	1117434	1117441	25 %	0 %	75 %	0 %	15679225
22512	NC_000916	AG	3	6	1117446	1117451	50 %	0 %	50 %	0 %	15679225
22513	NC_000916	GGA	2	6	1117540	1117545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679225
22514	NC_000916	TCC	2	6	1117570	1117575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679225
22515	NC_000916	TGG	2	6	1117687	1117692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679225
22516	NC_000916	GCT	2	6	1117713	1117718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679225
22517	NC_000916	CAG	2	6	1117758	1117763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679225
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22521	NC_000916	GAAG	2	8	1117897	1117904	50 %	0 %	50 %	0 %	15679226
22522	NC_000916	ATGG	2	8	1117913	1117920	25 %	25 %	50 %	0 %	15679226
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22542	NC_000916	AT	3	6	1118580	1118585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22543	NC_000916	A	7	7	1118593	1118599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22544	NC_000916	TA	3	6	1118602	1118607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22545	NC_000916	ATTA	2	8	1118612	1118619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22546	NC_000916	AATTTT	2	12	1118689	1118700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22547	NC_000916	T	6	6	1118697	1118702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22548	NC_000916	ATG	2	6	1118714	1118719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22550	NC_000916	TAA	2	6	1118820	1118825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679227
22551	NC_000916	CCTT	2	8	1118846	1118853	0 %	50 %	0 %	50 %	15679227
22552	NC_000916	TCA	2	6	1118860	1118865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679227
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22554	NC_000916	TCC	2	6	1118884	1118889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679227
22555	NC_000916	ATG	2	6	1118929	1118934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679227
22556	NC_000916	CGT	2	6	1118972	1118977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679227
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22563	NC_000916	CAT	2	6	1119221	1119226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679227
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22569	NC_000916	CTTC	2	8	1119578	1119585	0 %	50 %	0 %	50 %	15679227
22570	NC_000916	GCG	2	6	1119607	1119612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679227
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22593	NC_000916	TTAA	2	8	1120638	1120645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22594	NC_000916	ATAAAT	2	12	1120654	1120665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22596	NC_000916	AAG	2	6	1120691	1120696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22602	NC_000916	CCT	2	6	1121297	1121302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679230
22603	NC_000916	TGTGG	2	10	1121354	1121363	0 %	40 %	60 %	0 %	15679230
22604	NC_000916	GTGTT	2	10	1121376	1121385	0 %	60 %	40 %	0 %	15679230
22605	NC_000916	CTGA	2	8	1121389	1121396	25 %	25 %	25 %	25 %	15679230
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22619	NC_000916	GAA	2	6	1122063	1122068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679231
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22621	NC_000916	AT	4	8	1122384	1122391	50 %	50 %	0 %	0 %	15679231
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22842	NC_000916	GAC	2	6	1131195	1131200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679242
22843	NC_000916	CTG	2	6	1131221	1131226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679242
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22845	NC_000916	GAT	2	6	1131417	1131422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679242
22846	NC_000916	CTG	2	6	1131442	1131447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679242
22847	NC_000916	AGGG	2	8	1131498	1131505	25 %	0 %	75 %	0 %	15679242
22848	NC_000916	GTT	2	6	1131570	1131575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679242
22849	NC_000916	AAC	2	6	1131578	1131583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679242
22850	NC_000916	ATGA	2	8	1131594	1131601	50 %	25 %	25 %	0 %	15679242
22851	NC_000916	TG	3	6	1131658	1131663	0 %	50 %	50 %	0 %	15679243
22852	NC_000916	GTG	2	6	1131703	1131708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679243
22853	NC_000916	GCTCAG	2	12	1131759	1131770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15679243
22854	NC_000916	GGT	2	6	1131774	1131779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679243
22855	NC_000916	ACCG	2	8	1131796	1131803	25 %	0 %	25 %	50 %	15679243
22856	NC_000916	TGT	2	6	1131948	1131953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679243
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22978	NC_000916	TTC	2	6	1138016	1138021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679251
22979	NC_000916	GGGTTC	2	12	1138135	1138146	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15679251
22980	NC_000916	CCCTC	2	10	1138149	1138158	0 %	20 %	0 %	80 %	15679251
22981	NC_000916	TCC	2	6	1138164	1138169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679251
22982	NC_000916	AGA	2	6	1138253	1138258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679251
22983	NC_000916	TTC	2	6	1138259	1138264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679251
22984	NC_000916	CCA	2	6	1138272	1138277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679251
22985	NC_000916	CAC	2	6	1138344	1138349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679252
22986	NC_000916	ATC	3	9	1138363	1138371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679252
22987	NC_000916	ATC	2	6	1138376	1138381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679252
22988	NC_000916	CAGA	2	8	1138426	1138433	50 %	0 %	25 %	25 %	15679252
22989	NC_000916	CTTCT	2	10	1138487	1138496	0 %	60 %	0 %	40 %	15679252
22990	NC_000916	GTT	2	6	1138502	1138507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679252
22991	NC_000916	CA	3	6	1138548	1138553	50 %	0 %	0 %	50 %	15679252
22992	NC_000916	TCT	2	6	1138649	1138654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679252
22993	NC_000916	ATCC	2	8	1138662	1138669	25 %	25 %	0 %	50 %	15679252
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22997	NC_000916	ATTGC	2	10	1138979	1138988	20 %	40 %	20 %	20 %	15679252
22998	NC_000916	ACCG	2	8	1139059	1139066	25 %	0 %	25 %	50 %	15679252
22999	NC_000916	GACA	2	8	1139067	1139074	50 %	0 %	25 %	25 %	15679252
23000	NC_000916	AGT	2	6	1139142	1139147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679252

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