MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_000916	TGC	2	6	1041251	1041256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679140
21002	NC_000916	ACC	2	6	1041329	1041334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679140
21003	NC_000916	GTC	2	6	1041482	1041487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679140
21004	NC_000916	CAC	2	6	1041562	1041567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679140
21005	NC_000916	AGGG	2	8	1041569	1041576	25 %	0 %	75 %	0 %	15679140
21006	NC_000916	GTC	2	6	1041692	1041697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679140
21007	NC_000916	CTG	2	6	1041704	1041709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679140
21008	NC_000916	GTT	2	6	1041719	1041724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679140
21009	NC_000916	GTC	2	6	1041737	1041742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679140
21010	NC_000916	TCC	2	6	1041836	1041841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679140
21011	NC_000916	CTG	2	6	1041850	1041855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679140
21012	NC_000916	CTT	2	6	1041857	1041862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679140
21013	NC_000916	CCG	2	6	1041906	1041911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679140
21014	NC_000916	TCG	2	6	1041936	1041941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679140
21015	NC_000916	CTT	3	9	1041959	1041967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679140
21016	NC_000916	ATC	2	6	1042003	1042008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679141
21017	NC_000916	GT	3	6	1042073	1042078	0 %	50 %	50 %	0 %	15679141
21018	NC_000916	CAA	2	6	1042086	1042091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679141
21019	NC_000916	ATC	2	6	1042108	1042113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679141
21020	NC_000916	TCCT	2	8	1042130	1042137	0 %	50 %	0 %	50 %	15679141
21021	NC_000916	T	6	6	1042154	1042159	0 %	100 %	0 %	0 %	15679141
21022	NC_000916	TGT	2	6	1042345	1042350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679141
21023	NC_000916	CCTT	2	8	1042553	1042560	0 %	50 %	0 %	50 %	15679141
21024	NC_000916	TCC	2	6	1042598	1042603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679141
21025	NC_000916	GTG	2	6	1042623	1042628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679141
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21032	NC_000916	CTC	2	6	1043080	1043085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679142
21033	NC_000916	CCG	2	6	1043104	1043109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679142
21034	NC_000916	GTA	2	6	1043146	1043151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679142
21035	NC_000916	AT	3	6	1043209	1043214	50 %	50 %	0 %	0 %	15679142
21036	NC_000916	AAG	2	6	1043221	1043226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679142
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21038	NC_000916	CAT	2	6	1043296	1043301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679142
21039	NC_000916	GCA	2	6	1043340	1043345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679143
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21041	NC_000916	TCT	2	6	1043419	1043424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679143
21042	NC_000916	TGC	2	6	1043462	1043467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679143
21043	NC_000916	CA	3	6	1043471	1043476	50 %	0 %	0 %	50 %	15679143
21044	NC_000916	ACG	2	6	1043508	1043513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679143
21045	NC_000916	TCCACC	2	12	1043537	1043548	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15679143
21046	NC_000916	GAA	2	6	1043564	1043569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679143
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21050	NC_000916	TGC	2	6	1043729	1043734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679143
21051	NC_000916	ATTTC	2	10	1043785	1043794	20 %	60 %	0 %	20 %	15679143
21052	NC_000916	TGA	2	6	1043806	1043811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679143
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21054	NC_000916	TTG	2	6	1043901	1043906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679143
21055	NC_000916	CTGT	2	8	1043986	1043993	0 %	50 %	25 %	25 %	15679143
21056	NC_000916	GAT	2	6	1044003	1044008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679143
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21058	NC_000916	ACG	2	6	1044048	1044053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679143
21059	NC_000916	GAG	2	6	1044095	1044100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679143
21060	NC_000916	TGG	2	6	1044104	1044109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679143
21061	NC_000916	GAG	2	6	1044113	1044118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679143
21062	NC_000916	CTGT	2	8	1044148	1044155	0 %	50 %	25 %	25 %	15679143
21063	NC_000916	TCG	2	6	1044216	1044221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679143
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21066	NC_000916	CTG	2	6	1044317	1044322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679143
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21069	NC_000916	CTTCC	2	10	1044430	1044439	0 %	40 %	0 %	60 %	15679143
21070	NC_000916	CTT	2	6	1044473	1044478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679143
21071	NC_000916	GAG	2	6	1044596	1044601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679143
21072	NC_000916	TATT	3	12	1044670	1044681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21073	NC_000916	TAA	2	6	1044702	1044707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21074	NC_000916	TCC	2	6	1044820	1044825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21075	NC_000916	TTA	2	6	1044875	1044880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21077	NC_000916	A	6	6	1044949	1044954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21078	NC_000916	ATA	2	6	1044957	1044962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21079	NC_000916	A	7	7	1044980	1044986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21080	NC_000916	ATA	2	6	1045036	1045041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21081	NC_000916	A	6	6	1045080	1045085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21082	NC_000916	G	6	6	1045089	1045094	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21083	NC_000916	CAGG	2	8	1045123	1045130	25 %	0 %	50 %	25 %	15679144
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21085	NC_000916	TGTAC	2	10	1045250	1045259	20 %	40 %	20 %	20 %	15679144
21086	NC_000916	CCTCTT	2	12	1045260	1045271	0 %	50 %	0 %	50 %	15679144
21087	NC_000916	CAA	2	6	1045304	1045309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679144
21088	NC_000916	TCA	2	6	1045381	1045386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679144
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21091	NC_000916	CGT	2	6	1045439	1045444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679144
21092	NC_000916	TGGC	2	8	1045601	1045608	0 %	25 %	50 %	25 %	15679144
21093	NC_000916	CCTG	2	8	1045743	1045750	0 %	25 %	25 %	50 %	15679144
21094	NC_000916	AC	3	6	1045876	1045881	50 %	0 %	0 %	50 %	15679144
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21098	NC_000916	CA	3	6	1046085	1046090	50 %	0 %	0 %	50 %	15679144
21099	NC_000916	TG	3	6	1046137	1046142	0 %	50 %	50 %	0 %	15679144
21100	NC_000916	TGCC	2	8	1046144	1046151	0 %	25 %	25 %	50 %	15679144
21101	NC_000916	AC	3	6	1046203	1046208	50 %	0 %	0 %	50 %	15679144
21102	NC_000916	GGCA	2	8	1046288	1046295	25 %	0 %	50 %	25 %	15679144
21103	NC_000916	ACC	2	6	1046337	1046342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21104	NC_000916	GT	4	8	1046428	1046435	0 %	50 %	50 %	0 %	15679145
21105	NC_000916	GA	3	6	1046443	1046448	50 %	0 %	50 %	0 %	15679145
21106	NC_000916	ATC	2	6	1046496	1046501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679145
21107	NC_000916	GTT	2	6	1046565	1046570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679145
21108	NC_000916	TTG	2	6	1046576	1046581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679145
21109	NC_000916	TGA	2	6	1046603	1046608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679145
21110	NC_000916	GTG	2	6	1046631	1046636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679145
21111	NC_000916	TG	3	6	1046635	1046640	0 %	50 %	50 %	0 %	15679145
21112	NC_000916	TC	3	6	1046711	1046716	0 %	50 %	0 %	50 %	15679145
21113	NC_000916	GAG	2	6	1046763	1046768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679145
21114	NC_000916	AGG	2	6	1046794	1046799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679145
21115	NC_000916	CTG	2	6	1046802	1046807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679145
21116	NC_000916	TATG	2	8	1046943	1046950	25 %	50 %	25 %	0 %	15679145
21117	NC_000916	TCCT	2	8	1047033	1047040	0 %	50 %	0 %	50 %	15679145
21118	NC_000916	TG	3	6	1047099	1047104	0 %	50 %	50 %	0 %	15679145
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21120	NC_000916	GAG	2	6	1047216	1047221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679145
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21233	NC_000916	CCGA	2	8	1053823	1053830	25 %	0 %	25 %	50 %	15679152
21234	NC_000916	T	6	6	1053898	1053903	0 %	100 %	0 %	0 %	15679152
21235	NC_000916	TCTGAA	2	12	1053926	1053937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15679152
21236	NC_000916	CAC	2	6	1053950	1053955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679152
21237	NC_000916	AT	3	6	1054006	1054011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21238	NC_000916	AAT	2	6	1054108	1054113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21239	NC_000916	ATA	2	6	1054179	1054184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21403	NC_000916	A	6	6	1062079	1062084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21459	NC_000916	TGG	2	6	1064543	1064548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21467	NC_000916	GGA	2	6	1064919	1064924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679165
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21475	NC_000916	T	6	6	1065442	1065447	0 %	100 %	0 %	0 %	15679166
21476	NC_000916	TCT	2	6	1065497	1065502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679166
21477	NC_000916	TGC	2	6	1065555	1065560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679166
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21479	NC_000916	AGA	2	6	1065595	1065600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679166
21480	NC_000916	CCA	2	6	1065671	1065676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679166
21481	NC_000916	AGGG	2	8	1065789	1065796	25 %	0 %	75 %	0 %	15679166
21482	NC_000916	GGA	2	6	1065849	1065854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679166
21483	NC_000916	AGG	2	6	1065911	1065916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679166
21484	NC_000916	CAAG	2	8	1065950	1065957	50 %	0 %	25 %	25 %	15679166
21485	NC_000916	CAC	2	6	1065962	1065967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679166
21486	NC_000916	GAA	2	6	1065969	1065974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679166
21487	NC_000916	TTC	2	6	1065976	1065981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679166
21488	NC_000916	TAA	2	6	1066001	1066006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21489	NC_000916	TAA	2	6	1066075	1066080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21490	NC_000916	A	8	8	1066110	1066117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21491	NC_000916	GAA	2	6	1066149	1066154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679167
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21499	NC_000916	CAG	2	6	1066514	1066519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679167
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