MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_000916	T	6	6	1017338	1017343	0 %	100 %	0 %	0 %	15679114
20502	NC_000916	TCA	3	9	1017361	1017369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679114
20503	NC_000916	ATA	2	6	1017411	1017416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20504	NC_000916	AGG	2	6	1017430	1017435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20505	NC_000916	GAT	2	6	1017436	1017441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20506	NC_000916	AT	3	6	1017440	1017445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20507	NC_000916	TTA	2	6	1017472	1017477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20508	NC_000916	AT	4	8	1017490	1017497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20509	NC_000916	ATC	2	6	1017523	1017528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679115
20510	NC_000916	AG	3	6	1017681	1017686	50 %	0 %	50 %	0 %	15679115
20511	NC_000916	ATA	2	6	1017754	1017759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679115
20512	NC_000916	GAA	2	6	1017823	1017828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679115
20513	NC_000916	ACT	2	6	1017839	1017844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679115
20514	NC_000916	TGC	2	6	1017989	1017994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679115
20515	NC_000916	CA	3	6	1018044	1018049	50 %	0 %	0 %	50 %	15679115
20516	NC_000916	ATC	2	6	1018165	1018170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679115
20517	NC_000916	CTC	2	6	1018336	1018341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679115
20518	NC_000916	TCC	2	6	1018343	1018348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679115
20519	NC_000916	TCT	2	6	1018367	1018372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679115
20520	NC_000916	TCA	2	6	1018417	1018422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20521	NC_000916	GATAA	2	10	1018582	1018591	60 %	20 %	20 %	0 %	15679116
20522	NC_000916	TAG	2	6	1018601	1018606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679116
20523	NC_000916	TAA	2	6	1018656	1018661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679116
20524	NC_000916	GGC	2	6	1018702	1018707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679116
20525	NC_000916	TGC	2	6	1018734	1018739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679116
20526	NC_000916	TGAG	2	8	1018775	1018782	25 %	25 %	50 %	0 %	15679116
20527	NC_000916	CCA	2	6	1018795	1018800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679116
20528	NC_000916	CAG	2	6	1018808	1018813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679116
20529	NC_000916	TCT	2	6	1018814	1018819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679116
20530	NC_000916	C	6	6	1018880	1018885	0 %	0 %	0 %	100 %	15679116
20531	NC_000916	TCC	2	6	1018955	1018960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679116
20532	NC_000916	CTC	2	6	1018981	1018986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679116
20533	NC_000916	AGG	2	6	1019009	1019014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679116
20534	NC_000916	ACA	2	6	1019066	1019071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679116
20535	NC_000916	TGA	2	6	1019142	1019147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679116
20536	NC_000916	CCA	2	6	1019168	1019173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679116
20537	NC_000916	AGG	2	6	1019206	1019211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679116
20538	NC_000916	TGG	2	6	1019247	1019252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679116
20539	NC_000916	AAG	2	6	1019299	1019304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679116
20540	NC_000916	GAT	2	6	1019353	1019358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679116
20541	NC_000916	TGC	2	6	1019530	1019535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679116
20542	NC_000916	ATC	2	6	1019580	1019585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679116
20543	NC_000916	GAC	2	6	1019620	1019625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679116
20544	NC_000916	TGG	2	6	1019639	1019644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679116
20545	NC_000916	GA	3	6	1019668	1019673	50 %	0 %	50 %	0 %	15679116
20546	NC_000916	T	6	6	1019695	1019700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20547	NC_000916	TCT	2	6	1019729	1019734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20548	NC_000916	CATA	2	8	1019746	1019753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20549	NC_000916	A	8	8	1019755	1019762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20550	NC_000916	TCT	2	6	1019786	1019791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20551	NC_000916	AATA	2	8	1019821	1019828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20552	NC_000916	CATT	2	8	1019901	1019908	25 %	50 %	0 %	25 %	15679117
20553	NC_000916	TAT	2	6	1019948	1019953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679117
20554	NC_000916	TCA	2	6	1020003	1020008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679117
20555	NC_000916	GTA	2	6	1020109	1020114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20556	NC_000916	TGA	2	6	1020123	1020128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20557	NC_000916	CTG	2	6	1020139	1020144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20558	NC_000916	CTA	2	6	1020162	1020167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20559	NC_000916	TA	3	6	1020170	1020175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20560	NC_000916	CTT	2	6	1020259	1020264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679118
20561	NC_000916	TGACA	2	10	1020285	1020294	40 %	20 %	20 %	20 %	15679118
20562	NC_000916	GGGT	2	8	1020317	1020324	0 %	25 %	75 %	0 %	15679118
20563	NC_000916	TTC	2	6	1020325	1020330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679118
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20571	NC_000916	AG	3	6	1020933	1020938	50 %	0 %	50 %	0 %	15679118
20572	NC_000916	AC	3	6	1020959	1020964	50 %	0 %	0 %	50 %	15679118
20573	NC_000916	CCTTGA	2	12	1020978	1020989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15679118
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20591	NC_000916	GAG	3	9	1021543	1021551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679118
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20599	NC_000916	CTT	2	6	1021919	1021924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20601	NC_000916	AAG	2	6	1021988	1021993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20602	NC_000916	ATT	2	6	1022003	1022008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20603	NC_000916	T	7	7	1022007	1022013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20604	NC_000916	A	6	6	1022039	1022044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20605	NC_000916	ATC	2	6	1022095	1022100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679119
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20607	NC_000916	GCCT	2	8	1022218	1022225	0 %	25 %	25 %	50 %	15679119
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20610	NC_000916	CCT	2	6	1022352	1022357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679119
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20616	NC_000916	CAT	2	6	1022759	1022764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679120
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20620	NC_000916	CGC	2	6	1023185	1023190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679120
20621	NC_000916	GGT	2	6	1023194	1023199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679120
20622	NC_000916	TGG	2	6	1023327	1023332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679120
20623	NC_000916	GAA	2	6	1023333	1023338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679120
20624	NC_000916	GAG	2	6	1023366	1023371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679120
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20645	NC_000916	AATG	2	8	1024462	1024469	50 %	25 %	25 %	0 %	15679122
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20733	NC_000916	GTCT	2	8	1028157	1028164	0 %	50 %	25 %	25 %	15679127
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