MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_000916	AGG	2	6	917739	917744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_000916	AGG	2	6	917800	917805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679022
18504	NC_000916	GTT	2	6	917821	917826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679022
18505	NC_000916	AGGTG	2	10	917855	917864	20 %	20 %	60 %	0 %	15679022
18506	NC_000916	AC	3	6	917999	918004	50 %	0 %	0 %	50 %	15679022
18507	NC_000916	AAGG	2	8	918027	918034	50 %	0 %	50 %	0 %	15679022
18508	NC_000916	GAA	2	6	918072	918077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679023
18509	NC_000916	CGG	2	6	918186	918191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679023
18510	NC_000916	TGA	2	6	918209	918214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679023
18511	NC_000916	AGG	2	6	918292	918297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679023
18512	NC_000916	CGA	2	6	918326	918331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679023
18513	NC_000916	AAG	2	6	918375	918380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679023
18514	NC_000916	TAC	2	6	918387	918392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679023
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18516	NC_000916	CCA	2	6	918580	918585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679023
18517	NC_000916	CCA	2	6	918597	918602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679023
18518	NC_000916	AAT	2	6	918629	918634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679023
18519	NC_000916	TTC	2	6	918690	918695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679023
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18521	NC_000916	ATA	2	6	918801	918806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679023
18522	NC_000916	GAA	2	6	918880	918885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18523	NC_000916	AT	3	6	918896	918901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18524	NC_000916	A	7	7	918909	918915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18525	NC_000916	ATG	2	6	918921	918926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18527	NC_000916	A	6	6	919004	919009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18528	NC_000916	A	6	6	919017	919022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_000916	ATTT	2	8	919041	919048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18530	NC_000916	TGAA	2	8	919057	919064	50 %	25 %	25 %	0 %	15679024
18531	NC_000916	GGA	2	6	919223	919228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679024
18532	NC_000916	AGGG	2	8	919271	919278	25 %	0 %	75 %	0 %	15679024
18533	NC_000916	TGA	2	6	919310	919315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679024
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18536	NC_000916	AGA	2	6	919576	919581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679024
18537	NC_000916	ATT	2	6	919671	919676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_000916	TCT	2	6	919701	919706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_000916	AT	3	6	919753	919758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_000916	AGG	2	6	919809	919814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18541	NC_000916	TGA	2	6	919848	919853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679025
18542	NC_000916	ACTC	2	8	919866	919873	25 %	25 %	0 %	50 %	15679025
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18545	NC_000916	TCT	2	6	920099	920104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679025
18546	NC_000916	TCCAG	2	10	920138	920147	20 %	20 %	20 %	40 %	15679025
18547	NC_000916	CAG	2	6	920152	920157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679025
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18549	NC_000916	GATG	2	8	920274	920281	25 %	25 %	50 %	0 %	15679025
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18555	NC_000916	TCC	2	6	920522	920527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679025
18556	NC_000916	CCCA	2	8	920528	920535	25 %	0 %	0 %	75 %	15679025
18557	NC_000916	CCG	2	6	920546	920551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679025
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18992	NC_000916	GAT	2	6	941693	941698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679047
18993	NC_000916	CA	3	6	941713	941718	50 %	0 %	0 %	50 %	15679047
18994	NC_000916	GCCA	2	8	941785	941792	25 %	0 %	25 %	50 %	15679047
18995	NC_000916	TAC	2	6	941825	941830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679047
18996	NC_000916	CAG	2	6	941865	941870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679047
18997	NC_000916	CAG	2	6	941934	941939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679047
18998	NC_000916	CCA	2	6	941973	941978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18999	NC_000916	T	7	7	941983	941989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19000	NC_000916	CAA	2	6	942160	942165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679048

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