MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_000916	TCC	2	6	843662	843667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678948
17003	NC_000916	GGA	2	6	843671	843676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678948
17004	NC_000916	GA	3	6	843729	843734	50 %	0 %	50 %	0 %	15678948
17005	NC_000916	CAT	2	6	843767	843772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678948
17006	NC_000916	GTG	2	6	843837	843842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678948
17007	NC_000916	CAT	2	6	843862	843867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678948
17008	NC_000916	TCC	2	6	844005	844010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678948
17009	NC_000916	GTT	2	6	844073	844078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678948
17010	NC_000916	CAT	2	6	844112	844117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678948
17011	NC_000916	GTA	2	6	844139	844144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678948
17012	NC_000916	TAT	2	6	844217	844222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678948
17013	NC_000916	GCC	2	6	844241	844246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678948
17014	NC_000916	GCC	2	6	844248	844253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678948
17015	NC_000916	GTCCAC	2	12	844295	844306	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15678948
17016	NC_000916	GGTT	2	8	844318	844325	0 %	50 %	50 %	0 %	15678948
17017	NC_000916	AC	3	6	844339	844344	50 %	0 %	0 %	50 %	15678948
17018	NC_000916	CCT	2	6	844375	844380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678948
17019	NC_000916	TCC	2	6	844458	844463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678948
17020	NC_000916	CTG	2	6	844475	844480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
17021	NC_000916	CAT	2	6	844594	844599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678948
17022	NC_000916	TGC	2	6	844694	844699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
17023	NC_000916	GAG	2	6	844700	844705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678948
17024	NC_000916	CTG	2	6	844720	844725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
17025	NC_000916	ATG	2	6	844759	844764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678948
17026	NC_000916	AGG	2	6	844794	844799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678948
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17028	NC_000916	GTG	2	6	844882	844887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678948
17029	NC_000916	ACA	2	6	845004	845009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678948
17030	NC_000916	TCA	2	6	845049	845054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678948
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17032	NC_000916	TCC	2	6	845123	845128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678948
17033	NC_000916	GCT	2	6	845139	845144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
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17039	NC_000916	CAT	2	6	845528	845533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678948
17040	NC_000916	GTC	2	6	845558	845563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
17041	NC_000916	ATG	2	6	845604	845609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678948
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17045	NC_000916	GATGTA	2	12	845819	845830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678948
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17047	NC_000916	TGG	3	9	845988	845996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678948
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17052	NC_000916	TC	3	6	846426	846431	0 %	50 %	0 %	50 %	15678948
17053	NC_000916	CTG	2	6	846450	846455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
17054	NC_000916	CT	3	6	846471	846476	0 %	50 %	0 %	50 %	15678948
17055	NC_000916	CAT	2	6	846554	846559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678948
17056	NC_000916	GAG	2	6	846566	846571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678948
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17069	NC_000916	TGA	2	6	847207	847212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678948
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17072	NC_000916	GTA	2	6	847322	847327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678948
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17088	NC_000916	TCC	2	6	848261	848266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678948
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17093	NC_000916	TAA	2	6	848454	848459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_000916	TAA	2	6	848468	848473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_000916	TCA	2	6	848495	848500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17097	NC_000916	ATGT	2	8	848551	848558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_000916	ATCA	2	8	848638	848645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17099	NC_000916	TGTA	2	8	848680	848687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17100	NC_000916	TAA	2	6	848699	848704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_000916	G	6	6	848792	848797	0 %	0 %	100 %	0 %	15678949
17102	NC_000916	AATC	2	8	848841	848848	50 %	25 %	0 %	25 %	15678949
17103	NC_000916	C	6	6	848857	848862	0 %	0 %	0 %	100 %	15678949
17104	NC_000916	TGAATG	2	12	848874	848885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678949
17105	NC_000916	TCC	3	9	848891	848899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678949
17106	NC_000916	AG	3	6	848926	848931	50 %	0 %	50 %	0 %	15678949
17107	NC_000916	CCT	2	6	848965	848970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678949
17108	NC_000916	CTCC	2	8	849030	849037	0 %	25 %	0 %	75 %	15678949
17109	NC_000916	AGG	2	6	849053	849058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678949
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17111	NC_000916	TCC	2	6	849130	849135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678949
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17115	NC_000916	TCC	2	6	849360	849365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678949
17116	NC_000916	CAGGTT	2	12	849426	849437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17117	NC_000916	TA	3	6	849509	849514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17118	NC_000916	GAA	2	6	849516	849521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_000916	AT	3	6	849526	849531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_000916	AT	3	6	849546	849551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17121	NC_000916	ATAA	2	8	849580	849587	75 %	25 %	0 %	0 %	15678950
17122	NC_000916	CCT	2	6	849645	849650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678950
17123	NC_000916	ACAT	2	8	849661	849668	50 %	25 %	0 %	25 %	15678950
17124	NC_000916	GAT	2	6	849696	849701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678950
17125	NC_000916	CAC	2	6	849723	849728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678950
17126	NC_000916	GCT	2	6	849786	849791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678950
17127	NC_000916	CACCTA	2	12	849816	849827	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15678950
17128	NC_000916	ACA	2	6	849854	849859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678950
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17130	NC_000916	ACC	2	6	849928	849933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678950
17131	NC_000916	TGA	2	6	849948	849953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678950
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17133	NC_000916	CCTCAC	2	12	849981	849992	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15678950
17134	NC_000916	GAT	2	6	850023	850028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678950
17135	NC_000916	CGT	2	6	850108	850113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17136	NC_000916	CTC	2	6	850127	850132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17137	NC_000916	CAT	2	6	850134	850139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17138	NC_000916	TCC	2	6	850143	850148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17139	NC_000916	AG	3	6	850152	850157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17140	NC_000916	GGCT	2	8	850275	850282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17141	NC_000916	AGC	2	6	850457	850462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678951
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17143	NC_000916	AGC	2	6	850591	850596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678951
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17148	NC_000916	CGC	2	6	850743	850748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678951
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17154	NC_000916	T	6	6	851116	851121	0 %	100 %	0 %	0 %	15678952
17155	NC_000916	ACTCT	2	10	851246	851255	20 %	40 %	0 %	40 %	15678952
17156	NC_000916	GAT	2	6	851315	851320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678952
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17159	NC_000916	GAA	2	6	851627	851632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17160	NC_000916	AT	3	6	851650	851655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17161	NC_000916	CATT	2	8	851695	851702	25 %	50 %	0 %	25 %	15678953
17162	NC_000916	AGA	2	6	851706	851711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678953
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17164	NC_000916	GAT	2	6	851835	851840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678953
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17167	NC_000916	TA	3	6	851874	851879	50 %	50 %	0 %	0 %	15678953
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17200	NC_000916	TGA	2	6	853497	853502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678956
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17237	NC_000916	GT	3	6	855323	855328	0 %	50 %	50 %	0 %	15678960
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17239	NC_000916	AG	3	6	855591	855596	50 %	0 %	50 %	0 %	15678960
17240	NC_000916	TTC	2	6	855651	855656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678960
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17489	NC_000916	GAA	2	6	866929	866934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17490	NC_000916	TCCA	2	8	866956	866963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17491	NC_000916	ACG	2	6	867012	867017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17492	NC_000916	AGTGA	2	10	867052	867061	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17493	NC_000916	TCA	2	6	867081	867086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17494	NC_000916	AAAT	2	8	867128	867135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17495	NC_000916	AGG	2	6	867177	867182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678970
17496	NC_000916	CTG	2	6	867189	867194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678970
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17499	NC_000916	CA	3	6	867313	867318	50 %	0 %	0 %	50 %	15678970
17500	NC_000916	CCT	2	6	867349	867354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678970

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