MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_000916	TCT	2	6	816946	816951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678920
16502	NC_000916	AT	3	6	816957	816962	50 %	50 %	0 %	0 %	15678920
16503	NC_000916	TCC	2	6	817102	817107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678920
16504	NC_000916	GAAG	2	8	817111	817118	50 %	0 %	50 %	0 %	15678920
16505	NC_000916	CTC	2	6	817179	817184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678920
16506	NC_000916	GTG	2	6	817194	817199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678920
16507	NC_000916	TA	3	6	817221	817226	50 %	50 %	0 %	0 %	15678920
16508	NC_000916	TCA	2	6	817267	817272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678920
16509	NC_000916	CATTT	2	10	817349	817358	20 %	60 %	0 %	20 %	15678920
16510	NC_000916	GCAA	2	8	817365	817372	50 %	0 %	25 %	25 %	15678920
16511	NC_000916	GGA	2	6	817560	817565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16512	NC_000916	TCC	2	6	817578	817583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16513	NC_000916	ATTT	2	8	817589	817596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16514	NC_000916	ATC	2	6	817605	817610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_000916	AGACA	2	10	817632	817641	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16516	NC_000916	ATC	2	6	817642	817647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678921
16517	NC_000916	CAT	2	6	817702	817707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678921
16518	NC_000916	TCC	2	6	817730	817735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678921
16519	NC_000916	CAT	2	6	817757	817762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678921
16520	NC_000916	C	6	6	817778	817783	0 %	0 %	0 %	100 %	15678921
16521	NC_000916	TCT	2	6	817856	817861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678921
16522	NC_000916	TGA	2	6	818023	818028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678921
16523	NC_000916	TGA	2	6	818033	818038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678921
16524	NC_000916	GC	3	6	818094	818099	0 %	0 %	50 %	50 %	15678921
16525	NC_000916	CTC	2	6	818150	818155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678921
16526	NC_000916	GAG	2	6	818192	818197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678921
16527	NC_000916	ATG	2	6	818202	818207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678921
16528	NC_000916	GTT	2	6	818216	818221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678921
16529	NC_000916	TTC	2	6	818322	818327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678921
16530	NC_000916	TC	4	8	818373	818380	0 %	50 %	0 %	50 %	15678921
16531	NC_000916	TCA	2	6	818439	818444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678921
16532	NC_000916	CTG	2	6	818445	818450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678921
16533	NC_000916	TCT	3	9	818482	818490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678921
16534	NC_000916	TTA	2	6	818491	818496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678921
16535	NC_000916	GCA	2	6	818502	818507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678921
16536	NC_000916	ATG	2	6	818535	818540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678921
16537	NC_000916	ATT	2	6	818544	818549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678921
16538	NC_000916	CTG	2	6	818593	818598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678921
16539	NC_000916	TCC	2	6	818631	818636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678921
16540	NC_000916	TCCTCA	2	12	818667	818678	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15678921
16541	NC_000916	AAC	2	6	818684	818689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678921
16542	NC_000916	TCA	2	6	818698	818703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678921
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16544	NC_000916	ACT	2	6	818759	818764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678922
16545	NC_000916	CCTCA	2	10	818908	818917	20 %	20 %	0 %	60 %	15678922
16546	NC_000916	TCA	2	6	819011	819016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678922
16547	NC_000916	TCCC	2	8	819038	819045	0 %	25 %	0 %	75 %	15678922
16548	NC_000916	ACC	2	6	819101	819106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678922
16549	NC_000916	GTT	2	6	819250	819255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678922
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16551	NC_000916	TTCT	2	8	819289	819296	0 %	75 %	0 %	25 %	15678922
16552	NC_000916	AGC	2	6	819410	819415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678922
16553	NC_000916	CAT	2	6	819432	819437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678922
16554	NC_000916	TCA	2	6	819506	819511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678922
16555	NC_000916	TCA	2	6	819587	819592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678922
16556	NC_000916	TCC	2	6	819639	819644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678922
16557	NC_000916	TCT	2	6	819648	819653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678922
16558	NC_000916	CCTC	2	8	819657	819664	0 %	25 %	0 %	75 %	15678922
16559	NC_000916	GCTCCT	2	12	819708	819719	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15678922
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16561	NC_000916	TCA	2	6	819953	819958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678922
16562	NC_000916	ATC	2	6	820093	820098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16563	NC_000916	ACG	2	6	820280	820285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678923
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16569	NC_000916	CTCCG	2	10	820723	820732	0 %	20 %	20 %	60 %	15678923
16570	NC_000916	ATC	2	6	820888	820893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678923
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16589	NC_000916	GAG	2	6	822010	822015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678924
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16593	NC_000916	ATGA	2	8	822422	822429	50 %	25 %	25 %	0 %	15678924
16594	NC_000916	CA	3	6	822504	822509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16595	NC_000916	GAA	2	6	822516	822521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16603	NC_000916	GACA	2	8	823012	823019	50 %	0 %	25 %	25 %	15678925
16604	NC_000916	ATAC	2	8	823083	823090	50 %	25 %	0 %	25 %	15678925
16605	NC_000916	TTG	2	6	823097	823102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678925
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16615	NC_000916	TGG	2	6	823867	823872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16993	NC_000916	AT	3	6	843243	843248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16994	NC_000916	TCTT	2	8	843252	843259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16995	NC_000916	A	7	7	843349	843355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16996	NC_000916	TTC	2	6	843370	843375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678948
16997	NC_000916	AAG	2	6	843384	843389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678948
16998	NC_000916	GCT	2	6	843479	843484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
16999	NC_000916	TGC	2	6	843530	843535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
17000	NC_000916	CTCCA	2	10	843536	843545	20 %	20 %	0 %	60 %	15678948

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