MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000916	CTT	2	6	48698	48703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678104
1002	NC_000916	ATA	2	6	48759	48764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_000916	TAG	2	6	48778	48783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_000916	TAC	2	6	48799	48804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_000916	CAA	2	6	48821	48826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_000916	TGC	2	6	48876	48881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678105
1007	NC_000916	TCC	2	6	48883	48888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678105
1008	NC_000916	TTC	2	6	48910	48915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678105
1009	NC_000916	AAATC	2	10	49046	49055	60 %	20 %	0 %	20 %	15678105
1010	NC_000916	CAG	2	6	49100	49105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678105
1011	NC_000916	ATG	2	6	49177	49182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678105
1012	NC_000916	T	6	6	49185	49190	0 %	100 %	0 %	0 %	15678105
1013	NC_000916	AGG	2	6	49210	49215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678105
1014	NC_000916	TAT	2	6	49227	49232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678105
1015	NC_000916	TGC	2	6	49242	49247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678105
1016	NC_000916	T	6	6	49344	49349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_000916	T	6	6	49355	49360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_000916	T	7	7	49375	49381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_000916	G	6	6	49388	49393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_000916	CTTTT	2	10	49397	49406	0 %	80 %	0 %	20 %	15678106
1021	NC_000916	AAG	2	6	49418	49423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678106
1022	NC_000916	CAAG	2	8	49434	49441	50 %	0 %	25 %	25 %	15678106
1023	NC_000916	AATT	2	8	49543	49550	50 %	50 %	0 %	0 %	15678106
1024	NC_000916	ATA	2	6	49556	49561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678106
1025	NC_000916	GCA	2	6	49592	49597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678106
1026	NC_000916	TAAAA	2	10	49620	49629	80 %	20 %	0 %	0 %	15678106
1027	NC_000916	A	6	6	49626	49631	100 %	0 %	0 %	0 %	15678106
1028	NC_000916	CAT	2	6	49642	49647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678106
1029	NC_000916	ATC	2	6	49648	49653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_000916	GCC	2	6	49771	49776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678107
1031	NC_000916	TAG	2	6	49862	49867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678107
1032	NC_000916	A	6	6	49879	49884	100 %	0 %	0 %	0 %	15678107
1033	NC_000916	ACT	2	6	49910	49915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678107
1034	NC_000916	ATG	2	6	49986	49991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678107
1035	NC_000916	T	6	6	49994	49999	0 %	100 %	0 %	0 %	15678107
1036	NC_000916	AGG	2	6	50019	50024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678107
1037	NC_000916	TAT	2	6	50036	50041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678107
1038	NC_000916	TGC	2	6	50051	50056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678107
1039	NC_000916	CTT	2	6	50148	50153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678107
1040	NC_000916	ATC	2	6	50160	50165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678107
1041	NC_000916	CTA	2	6	50215	50220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678108
1042	NC_000916	CT	3	6	50255	50260	0 %	50 %	0 %	50 %	15678108
1043	NC_000916	AGA	2	6	50289	50294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678108
1044	NC_000916	A	6	6	50296	50301	100 %	0 %	0 %	0 %	15678108
1045	NC_000916	AAAAT	2	10	50362	50371	80 %	20 %	0 %	0 %	15678108
1046	NC_000916	AAG	2	6	50384	50389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678108
1047	NC_000916	CCT	2	6	50435	50440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_000916	ATC	2	6	50443	50448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_000916	TCC	2	6	50554	50559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678109
1050	NC_000916	TTC	2	6	50581	50586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678109
1051	NC_000916	CAC	2	6	50765	50770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678109
1052	NC_000916	TCT	2	6	50821	50826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678109
1053	NC_000916	ATGT	2	8	50830	50837	25 %	50 %	25 %	0 %	15678109
1054	NC_000916	ATG	2	6	50848	50853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678109
1055	NC_000916	T	6	6	50856	50861	0 %	100 %	0 %	0 %	15678109
1056	NC_000916	AGG	2	6	50881	50886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678109
1057	NC_000916	TAT	2	6	50898	50903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678109
1058	NC_000916	TGC	2	6	50913	50918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678109
1059	NC_000916	CTT	2	6	51027	51032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678109
1060	NC_000916	ATC	2	6	51039	51044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678109
1061	NC_000916	TCTG	2	8	51133	51140	0 %	50 %	25 %	25 %	15678109
1062	NC_000916	TGG	2	6	51142	51147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678109
1063	NC_000916	TAG	2	6	51148	51153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678109
1064	NC_000916	ATG	2	6	51211	51216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_000916	GAG	2	6	51288	51293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_000916	TGT	2	6	51309	51314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678110
1067	NC_000916	T	8	8	51353	51360	0 %	100 %	0 %	0 %	15678110
1068	NC_000916	T	6	6	51383	51388	0 %	100 %	0 %	0 %	15678110
1069	NC_000916	T	6	6	51392	51397	0 %	100 %	0 %	0 %	15678110
1070	NC_000916	CTT	2	6	51442	51447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678110
1071	NC_000916	GTTTT	2	10	51495	51504	0 %	80 %	20 %	0 %	15678111
1072	NC_000916	G	6	6	51505	51510	0 %	0 %	100 %	0 %	15678111
1073	NC_000916	T	6	6	51555	51560	0 %	100 %	0 %	0 %	15678111
1074	NC_000916	TCT	2	6	51565	51570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678111
1075	NC_000916	TTTCCA	2	12	51582	51593	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15678111
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1079	NC_000916	CCT	2	6	51749	51754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678111
1080	NC_000916	ACT	2	6	51778	51783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678111
1081	NC_000916	TGT	2	6	51788	51793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678111
1082	NC_000916	TCA	2	6	51853	51858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678111
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1084	NC_000916	ATC	2	6	51906	51911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678111
1085	NC_000916	CTT	2	6	51953	51958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678111
1086	NC_000916	AT	3	6	51960	51965	50 %	50 %	0 %	0 %	15678111
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1088	NC_000916	T	6	6	52065	52070	0 %	100 %	0 %	0 %	15678111
1089	NC_000916	TCA	2	6	52159	52164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678111
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1098	NC_000916	TCC	2	6	52565	52570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678111
1099	NC_000916	CT	3	6	52574	52579	0 %	50 %	0 %	50 %	15678112
1100	NC_000916	CTT	2	6	52583	52588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678112
1101	NC_000916	TAT	2	6	52679	52684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678112
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1103	NC_000916	CATC	2	8	52753	52760	25 %	25 %	0 %	50 %	15678112
1104	NC_000916	ATT	2	6	52775	52780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678112
1105	NC_000916	ATC	2	6	52796	52801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678112
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1107	NC_000916	C	6	6	52840	52845	0 %	0 %	0 %	100 %	15678112
1108	NC_000916	TTCTT	2	10	52855	52864	0 %	80 %	0 %	20 %	15678112
1109	NC_000916	TAT	2	6	52880	52885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678112
1110	NC_000916	TG	3	6	52908	52913	0 %	50 %	50 %	0 %	15678112
1111	NC_000916	TAG	2	6	52922	52927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678112
1112	NC_000916	TGA	2	6	52936	52941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678112
1113	NC_000916	ACC	2	6	52952	52957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678112
1114	NC_000916	TCA	3	9	52975	52983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678112
1115	NC_000916	ATA	2	6	53025	53030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678112
1116	NC_000916	TAA	2	6	53044	53049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678112
1117	NC_000916	GCT	2	6	53103	53108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678112
1118	NC_000916	CCA	2	6	53144	53149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678112
1119	NC_000916	T	6	6	53180	53185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_000916	TGTT	2	8	53195	53202	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_000916	GTA	2	6	53206	53211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_000916	ATA	2	6	53219	53224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_000916	A	7	7	53249	53255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_000916	CTC	2	6	53291	53296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678113
1125	NC_000916	TAAT	2	8	53312	53319	50 %	50 %	0 %	0 %	15678113
1126	NC_000916	ATC	2	6	53335	53340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678113
1127	NC_000916	TCT	2	6	53350	53355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678113
1128	NC_000916	T	7	7	53355	53361	0 %	100 %	0 %	0 %	15678113
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1499	NC_000916	T	6	6	70119	70124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_000916	TCA	2	6	70146	70151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678138

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