MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_000916	TAAA	2	8	691092	691099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_000916	AATG	2	8	691135	691142	50 %	25 %	25 %	0 %	15678788
14003	NC_000916	GAGGTG	2	12	691321	691332	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15678788
14004	NC_000916	CAT	2	6	691382	691387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678788
14005	NC_000916	GAT	2	6	691395	691400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678788
14006	NC_000916	AGA	2	6	691433	691438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678788
14007	NC_000916	TCC	2	6	691454	691459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678788
14008	NC_000916	TGCA	2	8	691464	691471	25 %	25 %	25 %	25 %	15678788
14009	NC_000916	GAC	2	6	691477	691482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678788
14010	NC_000916	AAG	2	6	691705	691710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678788
14011	NC_000916	CAG	2	6	691795	691800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678788
14012	NC_000916	CA	3	6	691939	691944	50 %	0 %	0 %	50 %	15678788
14013	NC_000916	GGC	2	6	692009	692014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678788
14014	NC_000916	AGG	2	6	692035	692040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678788
14015	NC_000916	AGAA	2	8	692049	692056	75 %	0 %	25 %	0 %	15678788
14016	NC_000916	GGC	2	6	692112	692117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678788
14017	NC_000916	AGG	2	6	692128	692133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678788
14018	NC_000916	ATG	2	6	692141	692146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678788
14019	NC_000916	ATCC	2	8	692151	692158	25 %	25 %	0 %	50 %	15678788
14020	NC_000916	CTC	2	6	692227	692232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678788
14021	NC_000916	ACT	2	6	692267	692272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678788
14022	NC_000916	GGA	2	6	692343	692348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678788
14023	NC_000916	AGG	2	6	692408	692413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678788
14024	NC_000916	AT	3	6	692440	692445	50 %	50 %	0 %	0 %	15678788
14025	NC_000916	ACC	2	6	692468	692473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678788
14026	NC_000916	TGA	2	6	692511	692516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678788
14027	NC_000916	GAT	2	6	692601	692606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678788
14028	NC_000916	AG	3	6	692622	692627	50 %	0 %	50 %	0 %	15678788
14029	NC_000916	GAGGCC	2	12	692680	692691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15678788
14030	NC_000916	GCA	2	6	692704	692709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678788
14031	NC_000916	GGA	2	6	692727	692732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678788
14032	NC_000916	CGC	2	6	692745	692750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678788
14033	NC_000916	CAT	2	6	692799	692804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678788
14034	NC_000916	AC	3	6	693056	693061	50 %	0 %	0 %	50 %	15678788
14035	NC_000916	TGG	3	9	693195	693203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678788
14036	NC_000916	AAG	2	6	693247	693252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678788
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14038	NC_000916	CTC	2	6	693437	693442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678789
14039	NC_000916	TCA	2	6	693532	693537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678789
14040	NC_000916	TGGC	2	8	693622	693629	0 %	25 %	50 %	25 %	15678789
14041	NC_000916	CAT	2	6	693721	693726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678789
14042	NC_000916	CCTC	2	8	693751	693758	0 %	25 %	0 %	75 %	15678789
14043	NC_000916	CCT	2	6	693761	693766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678789
14044	NC_000916	GCCT	2	8	693785	693792	0 %	25 %	25 %	50 %	15678789
14045	NC_000916	TGA	2	6	693796	693801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678789
14046	NC_000916	CTC	2	6	693975	693980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678789
14047	NC_000916	TGA	2	6	694009	694014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678789
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14049	NC_000916	A	7	7	694042	694048	100 %	0 %	0 %	0 %	15678789
14050	NC_000916	ATC	2	6	694161	694166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678790
14051	NC_000916	TCA	2	6	694210	694215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678790
14052	NC_000916	ATT	2	6	694225	694230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678790
14053	NC_000916	CAA	2	6	694265	694270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678790
14054	NC_000916	TAT	2	6	694272	694277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678790
14055	NC_000916	TC	3	6	694323	694328	0 %	50 %	0 %	50 %	15678790
14056	NC_000916	TCT	2	6	694355	694360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678790
14057	NC_000916	CAAGTG	2	12	694388	694399	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15678790
14058	NC_000916	TTATC	2	10	694424	694433	20 %	60 %	0 %	20 %	15678790
14059	NC_000916	GTT	3	9	694450	694458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678790
14060	NC_000916	TTC	2	6	694507	694512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678790
14061	NC_000916	TA	3	6	694573	694578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_000916	ATTC	2	8	694590	694597	25 %	50 %	0 %	25 %	15678791
14063	NC_000916	CAT	2	6	694611	694616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678791
14064	NC_000916	CT	3	6	694618	694623	0 %	50 %	0 %	50 %	15678791
14065	NC_000916	CCCT	2	8	694675	694682	0 %	25 %	0 %	75 %	15678791
14066	NC_000916	C	6	6	694740	694745	0 %	0 %	0 %	100 %	15678791
14067	NC_000916	CCTC	2	8	694753	694760	0 %	25 %	0 %	75 %	15678791
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14083	NC_000916	TGTCA	2	10	695247	695256	20 %	40 %	20 %	20 %	15678791
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14092	NC_000916	AGAT	2	8	695581	695588	50 %	25 %	25 %	0 %	15678791
14093	NC_000916	TCA	2	6	695593	695598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678791
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14101	NC_000916	T	6	6	696100	696105	0 %	100 %	0 %	0 %	15678792
14102	NC_000916	GCCA	2	8	696152	696159	25 %	0 %	25 %	50 %	15678792
14103	NC_000916	TGG	2	6	696247	696252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678792
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14120	NC_000916	TCCA	2	8	697122	697129	25 %	25 %	0 %	50 %	15678792
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14122	NC_000916	GCA	2	6	697216	697221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678792
14123	NC_000916	CCAGTC	2	12	697310	697321	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15678792
14124	NC_000916	GAG	2	6	697340	697345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678792
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14126	NC_000916	TCTG	2	8	697489	697496	0 %	50 %	25 %	25 %	15678792
14127	NC_000916	CTT	2	6	697505	697510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678792
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14136	NC_000916	TCA	2	6	698128	698133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678792
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14143	NC_000916	TC	3	6	698509	698514	0 %	50 %	0 %	50 %	15678792
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14230	NC_000916	TCCTG	2	10	702517	702526	0 %	40 %	20 %	40 %	15678797
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14244	NC_000916	CA	3	6	703287	703292	50 %	0 %	0 %	50 %	15678797
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14492	NC_000916	TGA	2	6	714779	714784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678810
14493	NC_000916	CTG	2	6	714858	714863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678810
14494	NC_000916	TTC	2	6	714879	714884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678810
14495	NC_000916	TCT	2	6	714916	714921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678810
14496	NC_000916	TCT	2	6	714961	714966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678810
14497	NC_000916	CCT	2	6	714980	714985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678810
14498	NC_000916	TCA	2	6	715002	715007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678810
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14500	NC_000916	TCC	3	9	715188	715196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678810

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