MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_000916	CCT	2	6	617616	617621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678719
12502	NC_000916	G	6	6	617624	617629	0 %	0 %	100 %	0 %	15678719
12503	NC_000916	ACC	2	6	617636	617641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678719
12504	NC_000916	CTT	2	6	617659	617664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678719
12505	NC_000916	TAT	2	6	617683	617688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678719
12506	NC_000916	ACA	2	6	617738	617743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678719
12507	NC_000916	CAGTAC	2	12	617794	617805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15678719
12508	NC_000916	TAT	2	6	617806	617811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678719
12509	NC_000916	TCC	2	6	617833	617838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678720
12510	NC_000916	CAA	2	6	617846	617851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678720
12511	NC_000916	T	6	6	618022	618027	0 %	100 %	0 %	0 %	15678720
12512	NC_000916	TGC	2	6	618048	618053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678720
12513	NC_000916	AGG	2	6	618073	618078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678720
12514	NC_000916	GCG	2	6	618091	618096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678720
12515	NC_000916	GCT	2	6	618145	618150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678720
12516	NC_000916	AGG	2	6	618175	618180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678720
12517	NC_000916	AAG	2	6	618181	618186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678720
12518	NC_000916	TAT	3	9	618225	618233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678720
12519	NC_000916	CAC	2	6	618258	618263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678720
12520	NC_000916	TAT	2	6	618288	618293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678721
12521	NC_000916	TTA	2	6	618313	618318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678721
12522	NC_000916	AT	3	6	618321	618326	50 %	50 %	0 %	0 %	15678721
12523	NC_000916	TTA	2	6	618372	618377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678721
12524	NC_000916	TGTT	2	8	618391	618398	0 %	75 %	25 %	0 %	15678721
12525	NC_000916	TAA	2	6	618409	618414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678721
12526	NC_000916	T	6	6	618415	618420	0 %	100 %	0 %	0 %	15678721
12527	NC_000916	GTG	2	6	618441	618446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678721
12528	NC_000916	AGG	2	6	618463	618468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678721
12529	NC_000916	TTCTGG	2	12	618501	618512	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15678721
12530	NC_000916	GGA	2	6	618592	618597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678721
12531	NC_000916	TGA	2	6	618627	618632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678721
12532	NC_000916	AAAT	2	8	618636	618643	75 %	25 %	0 %	0 %	15678721
12533	NC_000916	GCAG	2	8	618672	618679	25 %	0 %	50 %	25 %	15678721
12534	NC_000916	CTGAAT	2	12	618798	618809	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15678721
12535	NC_000916	ATT	2	6	618896	618901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_000916	CAT	2	6	619110	619115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_000916	ATC	2	6	619119	619124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_000916	GAA	2	6	619149	619154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678722
12539	NC_000916	AC	3	6	619268	619273	50 %	0 %	0 %	50 %	15678722
12540	NC_000916	AGAT	2	8	619337	619344	50 %	25 %	25 %	0 %	15678722
12541	NC_000916	GGA	2	6	619383	619388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678722
12542	NC_000916	AGATAA	2	12	619481	619492	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15678722
12543	NC_000916	GAAA	2	8	619565	619572	75 %	0 %	25 %	0 %	15678722
12544	NC_000916	ATAAAG	2	12	619585	619596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15678722
12545	NC_000916	GCA	2	6	619641	619646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678722
12546	NC_000916	AGG	2	6	619697	619702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678722
12547	NC_000916	AT	3	6	619717	619722	50 %	50 %	0 %	0 %	15678722
12548	NC_000916	GGA	2	6	619749	619754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678722
12549	NC_000916	GGA	2	6	619809	619814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678722
12550	NC_000916	CTC	2	6	619873	619878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678722
12551	NC_000916	ATA	3	9	619882	619890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678722
12552	NC_000916	TAA	2	6	619904	619909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678722
12553	NC_000916	AGG	2	6	619981	619986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678722
12554	NC_000916	TGC	2	6	620037	620042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678722
12555	NC_000916	TCC	2	6	620075	620080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678722
12556	NC_000916	AGG	2	6	620172	620177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678722
12557	NC_000916	GGA	2	6	620293	620298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678723
12558	NC_000916	TGG	2	6	620333	620338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678723
12559	NC_000916	AAT	2	6	620351	620356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678723
12560	NC_000916	CCT	2	6	620384	620389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678723
12561	NC_000916	AAGGGA	2	12	620456	620467	50 %	0 %	50 %	0 %	15678723
12562	NC_000916	GAG	2	6	620487	620492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678723
12563	NC_000916	GGA	2	6	620588	620593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678723
12564	NC_000916	TGG	2	6	620663	620668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678723
12565	NC_000916	ATCC	2	8	620710	620717	25 %	25 %	0 %	50 %	15678723
12566	NC_000916	ATA	2	6	620718	620723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678723
12567	NC_000916	CCAG	2	8	620761	620768	25 %	0 %	25 %	50 %	15678723
12568	NC_000916	AG	3	6	620767	620772	50 %	0 %	50 %	0 %	15678723
12569	NC_000916	AGG	2	6	620797	620802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678723
12570	NC_000916	GTT	2	6	620820	620825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678723
12571	NC_000916	GAC	2	6	620895	620900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678723
12572	NC_000916	TCT	2	6	620951	620956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_000916	TAA	2	6	620973	620978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_000916	TAA	2	6	621024	621029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_000916	CCGGGG	2	12	621084	621095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678724
12576	NC_000916	AAG	2	6	621134	621139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678724
12577	NC_000916	CAGGT	2	10	621282	621291	20 %	20 %	40 %	20 %	15678724
12578	NC_000916	TTG	2	6	621318	621323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678724
12579	NC_000916	CAT	2	6	621427	621432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678724
12580	NC_000916	GTA	2	6	621458	621463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678724
12581	NC_000916	ACA	2	6	621464	621469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678724
12582	NC_000916	A	6	6	621482	621487	100 %	0 %	0 %	0 %	15678724
12583	NC_000916	AGG	2	6	621507	621512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678724
12584	NC_000916	GAA	2	6	621526	621531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678724
12585	NC_000916	AGA	2	6	621573	621578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678724
12586	NC_000916	GAG	2	6	621593	621598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678724
12587	NC_000916	A	7	7	621649	621655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_000916	ATT	2	6	621668	621673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678725
12589	NC_000916	CTGA	2	8	621732	621739	25 %	25 %	25 %	25 %	15678725
12590	NC_000916	AAG	2	6	621826	621831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678725
12591	NC_000916	ATTT	2	8	621924	621931	25 %	75 %	0 %	0 %	15678725
12592	NC_000916	CTGTTC	2	12	621949	621960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15678725
12593	NC_000916	AAC	2	6	621978	621983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678725
12594	NC_000916	ACC	2	6	622002	622007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678725
12595	NC_000916	ATA	3	9	622008	622016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678725
12596	NC_000916	CTGTT	2	10	622021	622030	0 %	60 %	20 %	20 %	15678725
12597	NC_000916	AT	3	6	622033	622038	50 %	50 %	0 %	0 %	15678725
12598	NC_000916	GTG	2	6	622039	622044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678725
12599	NC_000916	GGA	2	6	622079	622084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678725
12600	NC_000916	A	7	7	622161	622167	100 %	0 %	0 %	0 %	15678725
12601	NC_000916	GAA	2	6	622173	622178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678725
12602	NC_000916	GAA	2	6	622228	622233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678725
12603	NC_000916	GAA	2	6	622239	622244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678725
12604	NC_000916	C	10	10	622272	622281	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12605	NC_000916	CCAG	2	8	622303	622310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12606	NC_000916	AG	3	6	622326	622331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_000916	A	7	7	622357	622363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_000916	GGA	2	6	622400	622405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678726
12609	NC_000916	TTC	2	6	622408	622413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678726
12610	NC_000916	TCA	2	6	622429	622434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678726
12611	NC_000916	CTG	2	6	622625	622630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678726
12612	NC_000916	CTC	2	6	622668	622673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678726
12613	NC_000916	CG	3	6	622683	622688	0 %	0 %	50 %	50 %	15678726
12614	NC_000916	TCC	2	6	622822	622827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678726
12615	NC_000916	CTT	2	6	622845	622850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678726
12616	NC_000916	CCCT	2	8	622868	622875	0 %	25 %	0 %	75 %	15678726
12617	NC_000916	TTA	2	6	622924	622929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_000916	TAA	2	6	622950	622955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_000916	ATT	2	6	622958	622963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_000916	TGA	2	6	622979	622984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_000916	GAA	2	6	623060	623065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678727
12622	NC_000916	CCG	2	6	623104	623109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678727
12623	NC_000916	GAT	2	6	623126	623131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678727
12624	NC_000916	CTC	2	6	623189	623194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678727
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12626	NC_000916	AGA	2	6	623261	623266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678727
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12642	NC_000916	TGGT	2	8	624049	624056	0 %	50 %	50 %	0 %	15678728
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12650	NC_000916	CAGA	2	8	624597	624604	50 %	0 %	25 %	25 %	15678728
12651	NC_000916	TG	3	6	624611	624616	0 %	50 %	50 %	0 %	15678728
12652	NC_000916	TGGA	2	8	624633	624640	25 %	25 %	50 %	0 %	15678728
12653	NC_000916	TGG	2	6	624691	624696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678728
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12992	NC_000916	AGA	2	6	642220	642225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12993	NC_000916	A	7	7	642258	642264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12994	NC_000916	G	6	6	642271	642276	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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