MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12006	NC_000916	CCT	2	6	592191	592196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678691
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12017	NC_000916	ATGTT	2	10	592519	592528	20 %	60 %	20 %	0 %	15678692
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12126	NC_000916	ACT	2	6	598088	598093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678700
12127	NC_000916	CAT	2	6	598096	598101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678700
12128	NC_000916	CAT	2	6	598247	598252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678700
12129	NC_000916	TCA	2	6	598344	598349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678700
12130	NC_000916	TGC	2	6	598370	598375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678700
12131	NC_000916	AGTCAT	2	12	598492	598503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15678700
12132	NC_000916	CAA	2	6	598504	598509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678700
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12135	NC_000916	GTA	2	6	598619	598624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678700
12136	NC_000916	GTA	2	6	598691	598696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678700
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12147	NC_000916	CGT	2	6	599506	599511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678700
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12164	NC_000916	GTTG	2	8	600149	600156	0 %	50 %	50 %	0 %	15678700
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12369	NC_000916	TCA	2	6	610586	610591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678709
12370	NC_000916	GT	3	6	610665	610670	0 %	50 %	50 %	0 %	15678709
12371	NC_000916	TTA	2	6	610823	610828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678709
12372	NC_000916	TAT	2	6	610867	610872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678709
12373	NC_000916	CCT	2	6	610906	610911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678710
12374	NC_000916	TCC	3	9	611064	611072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678710
12375	NC_000916	AG	3	6	611075	611080	50 %	0 %	50 %	0 %	15678710
12376	NC_000916	ACC	2	6	611088	611093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678710
12377	NC_000916	CTG	2	6	611110	611115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678710
12378	NC_000916	CAA	2	6	611122	611127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678710
12379	NC_000916	CCTC	2	8	611199	611206	0 %	25 %	0 %	75 %	15678710
12380	NC_000916	CTC	2	6	611339	611344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678710
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12382	NC_000916	TCA	2	6	611529	611534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678710
12383	NC_000916	TCC	2	6	611547	611552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678710
12384	NC_000916	TG	3	6	611583	611588	0 %	50 %	50 %	0 %	15678710
12385	NC_000916	ATT	2	6	611611	611616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678711
12386	NC_000916	CAT	2	6	611649	611654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678711
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12389	NC_000916	TCA	2	6	611723	611728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678711
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12394	NC_000916	ACC	2	6	611945	611950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678711
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12398	NC_000916	TCA	2	6	612170	612175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678711
12399	NC_000916	CAC	2	6	612337	612342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678711
12400	NC_000916	C	6	6	612345	612350	0 %	0 %	0 %	100 %	15678711
12401	NC_000916	TCT	2	6	612390	612395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678711
12402	NC_000916	ACCTG	2	10	612491	612500	20 %	20 %	20 %	40 %	15678711
12403	NC_000916	AAC	2	6	612502	612507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678711
12404	NC_000916	T	6	6	612549	612554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12405	NC_000916	AGGAG	2	10	612565	612574	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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12408	NC_000916	CGT	2	6	612684	612689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678712
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12440	NC_000916	CT	3	6	614035	614040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12441	NC_000916	TGA	2	6	614076	614081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12442	NC_000916	TCTT	2	8	614101	614108	0 %	75 %	0 %	25 %	15678714
12443	NC_000916	TAA	2	6	614117	614122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678714
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12464	NC_000916	G	6	6	615653	615658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12473	NC_000916	GTCA	2	8	616318	616325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12474	NC_000916	GTT	2	6	616374	616379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12475	NC_000916	TGAGG	2	10	616437	616446	20 %	20 %	60 %	0 %	15678718
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12478	NC_000916	TGC	2	6	616545	616550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678718
12479	NC_000916	GGC	2	6	616608	616613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678718
12480	NC_000916	AAC	2	6	616626	616631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678718
12481	NC_000916	AT	3	6	616638	616643	50 %	50 %	0 %	0 %	15678718
12482	NC_000916	TCC	2	6	616654	616659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678718
12483	NC_000916	GAT	2	6	616797	616802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12484	NC_000916	A	7	7	616847	616853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12485	NC_000916	TTG	2	6	617010	617015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678719
12486	NC_000916	TAT	2	6	617062	617067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678719
12487	NC_000916	TGGCCT	2	12	617115	617126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678719
12488	NC_000916	TTG	2	6	617156	617161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678719
12489	NC_000916	CTT	2	6	617173	617178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678719
12490	NC_000916	CTGC	2	8	617214	617221	0 %	25 %	25 %	50 %	15678719
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