MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_000916	TCC	2	6	541474	541479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678633
11002	NC_000916	GAT	2	6	541524	541529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678633
11003	NC_000916	CCT	2	6	541661	541666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678633
11004	NC_000916	GCT	2	6	541667	541672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678633
11005	NC_000916	TGA	2	6	541673	541678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678633
11006	NC_000916	TGCC	2	8	541808	541815	0 %	25 %	25 %	50 %	15678633
11007	NC_000916	ACC	2	6	541819	541824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678633
11008	NC_000916	GAG	2	6	541848	541853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678633
11009	NC_000916	TGA	2	6	541868	541873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678633
11010	NC_000916	ATC	2	6	541933	541938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678633
11011	NC_000916	ATGA	2	8	541942	541949	50 %	25 %	25 %	0 %	15678633
11012	NC_000916	AAGG	2	8	542043	542050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_000916	TGC	2	6	542071	542076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678634
11014	NC_000916	GGC	2	6	542181	542186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678634
11015	NC_000916	TGG	2	6	542204	542209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678634
11016	NC_000916	GGA	2	6	542302	542307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678634
11017	NC_000916	TCA	2	6	542479	542484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678634
11018	NC_000916	CCT	2	6	542498	542503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678634
11019	NC_000916	TGA	2	6	542534	542539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678634
11020	NC_000916	CCT	2	6	542588	542593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678634
11021	NC_000916	TTG	2	6	542599	542604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678634
11022	NC_000916	AAT	2	6	542639	542644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678634
11023	NC_000916	CCT	2	6	542657	542662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678634
11024	NC_000916	GCA	2	6	542673	542678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678634
11025	NC_000916	TTCAG	2	10	542691	542700	20 %	40 %	20 %	20 %	15678634
11026	NC_000916	AT	4	8	542771	542778	50 %	50 %	0 %	0 %	15678634
11027	NC_000916	CT	3	6	542821	542826	0 %	50 %	0 %	50 %	15678634
11028	NC_000916	GTTCA	2	10	542835	542844	20 %	40 %	20 %	20 %	15678634
11029	NC_000916	AATA	2	8	542901	542908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_000916	AATTAA	2	12	543067	543078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678635
11031	NC_000916	GGT	2	6	543081	543086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678635
11032	NC_000916	ACC	3	9	543090	543098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678635
11033	NC_000916	ATA	2	6	543105	543110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678635
11034	NC_000916	GTA	2	6	543170	543175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_000916	CAA	2	6	543289	543294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678636
11036	NC_000916	TGT	2	6	543304	543309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678636
11037	NC_000916	ATC	2	6	543335	543340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678636
11038	NC_000916	AAC	2	6	543386	543391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678636
11039	NC_000916	CAA	2	6	543517	543522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678636
11040	NC_000916	CGG	2	6	543556	543561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678636
11041	NC_000916	TCT	2	6	543574	543579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678636
11042	NC_000916	CAC	2	6	543598	543603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678636
11043	NC_000916	CAT	2	6	543661	543666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678636
11044	NC_000916	CTC	2	6	543755	543760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678636
11045	NC_000916	CTC	2	6	543779	543784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678636
11046	NC_000916	GTT	2	6	543798	543803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678636
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11048	NC_000916	CAT	2	6	543832	543837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678636
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11050	NC_000916	TCT	2	6	543868	543873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678636
11051	NC_000916	T	6	6	543900	543905	0 %	100 %	0 %	0 %	15678637
11052	NC_000916	T	6	6	543976	543981	0 %	100 %	0 %	0 %	15678637
11053	NC_000916	TGC	2	6	544037	544042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678637
11054	NC_000916	CTC	2	6	544221	544226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678637
11055	NC_000916	AGA	2	6	544286	544291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678637
11056	NC_000916	ATCA	2	8	544336	544343	50 %	25 %	0 %	25 %	15678637
11057	NC_000916	CGG	2	6	544373	544378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678638
11058	NC_000916	TGT	2	6	544430	544435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678638
11059	NC_000916	ATG	2	6	544456	544461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678638
11060	NC_000916	CAT	3	9	544557	544565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678638
11061	NC_000916	CACAC	2	10	544575	544584	40 %	0 %	0 %	60 %	15678638
11062	NC_000916	CTG	2	6	544663	544668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678638
11063	NC_000916	GCT	2	6	544695	544700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678638
11064	NC_000916	CTC	2	6	544731	544736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678638
11065	NC_000916	CCT	2	6	544742	544747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678638
11066	NC_000916	TAT	2	6	544767	544772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678638
11067	NC_000916	TCA	2	6	544784	544789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678638
11068	NC_000916	TTA	2	6	544922	544927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678638
11069	NC_000916	TGA	2	6	544956	544961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678638
11070	NC_000916	CAT	2	6	545021	545026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678638
11071	NC_000916	TGC	2	6	545031	545036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678638
11072	NC_000916	CCA	2	6	545107	545112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678638
11073	NC_000916	TGG	2	6	545171	545176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678638
11074	NC_000916	CAT	2	6	545177	545182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678638
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11076	NC_000916	TCC	2	6	545312	545317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678638
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11078	NC_000916	AAT	2	6	545426	545431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_000916	AT	3	6	545461	545466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_000916	A	6	6	545484	545489	100 %	0 %	0 %	0 %	15678639
11081	NC_000916	A	6	6	545512	545517	100 %	0 %	0 %	0 %	15678639
11082	NC_000916	GAA	2	6	545630	545635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678639
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11093	NC_000916	AGG	2	6	546081	546086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678639
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11096	NC_000916	C	6	6	546332	546337	0 %	0 %	0 %	100 %	15678639
11097	NC_000916	GGC	2	6	546344	546349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678639
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11102	NC_000916	GGC	2	6	546437	546442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678639
11103	NC_000916	TGA	2	6	546461	546466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678639
11104	NC_000916	GA	3	6	546578	546583	50 %	0 %	50 %	0 %	15678639
11105	NC_000916	CCG	2	6	546601	546606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678639
11106	NC_000916	GAG	2	6	546720	546725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678639
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11110	NC_000916	GTG	2	6	546770	546775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678639
11111	NC_000916	GAG	2	6	546804	546809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678639
11112	NC_000916	AGG	2	6	546838	546843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678639
11113	NC_000916	TGA	2	6	546915	546920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678639
11114	NC_000916	AAT	2	6	546925	546930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_000916	CAT	2	6	546945	546950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_000916	TGAA	2	8	546965	546972	50 %	25 %	25 %	0 %	15678640
11117	NC_000916	GAA	2	6	546975	546980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678640
11118	NC_000916	GGC	2	6	547049	547054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678640
11119	NC_000916	CA	3	6	547096	547101	50 %	0 %	0 %	50 %	15678640
11120	NC_000916	AGC	2	6	547106	547111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678640
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11122	NC_000916	CAG	2	6	547218	547223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678640
11123	NC_000916	GAG	2	6	547285	547290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678640
11124	NC_000916	GGA	2	6	547342	547347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678640
11125	NC_000916	TCA	3	9	547355	547363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678640
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11132	NC_000916	CACC	2	8	547724	547731	25 %	0 %	0 %	75 %	15678641
11133	NC_000916	AG	3	6	547743	547748	50 %	0 %	50 %	0 %	15678641
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11143	NC_000916	AGG	2	6	548338	548343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_000916	AGG	2	6	548386	548391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678642
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11163	NC_000916	TCATG	2	10	549161	549170	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11164	NC_000916	GTTTGA	2	12	549201	549212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11165	NC_000916	TCAG	2	8	549300	549307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11166	NC_000916	A	7	7	549314	549320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11167	NC_000916	CATG	2	8	549538	549545	25 %	25 %	25 %	25 %	15678643
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11188	NC_000916	TCA	2	6	550423	550428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11191	NC_000916	TGA	2	6	550518	550523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11229	NC_000916	GGT	2	6	552105	552110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678645
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11247	NC_000916	TACA	2	8	552945	552952	50 %	25 %	0 %	25 %	15678646
11248	NC_000916	ATT	2	6	552970	552975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11491	NC_000916	CTTACC	2	12	566419	566430	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15678662
11492	NC_000916	TTA	2	6	566433	566438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678662
11493	NC_000916	ATC	2	6	566446	566451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678662
11494	NC_000916	CCT	2	6	566469	566474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678662
11495	NC_000916	CAA	2	6	566475	566480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678662
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11498	NC_000916	GCT	2	6	566567	566572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678662
11499	NC_000916	A	8	8	566592	566599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11500	NC_000916	A	8	8	566612	566619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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