MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_000916	ACA	2	6	515558	515563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678603
10503	NC_000916	A	6	6	515651	515656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_000916	TA	3	6	515713	515718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_000916	ATT	2	6	515753	515758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_000916	TA	3	6	515774	515779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_000916	CAG	3	9	515797	515805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_000916	GAA	2	6	515810	515815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_000916	A	6	6	515814	515819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_000916	CAG	2	6	515836	515841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_000916	GCC	2	6	515847	515852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10512	NC_000916	CCG	2	6	515859	515864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10513	NC_000916	CCT	2	6	515907	515912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678604
10514	NC_000916	TTC	2	6	515917	515922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678604
10515	NC_000916	CCT	2	6	515930	515935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678604
10516	NC_000916	TCC	2	6	515972	515977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678604
10517	NC_000916	CAT	2	6	516119	516124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678604
10518	NC_000916	TGGT	2	8	516208	516215	0 %	50 %	50 %	0 %	15678604
10519	NC_000916	CCA	2	6	516233	516238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678604
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10521	NC_000916	CCT	2	6	516276	516281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678604
10522	NC_000916	TG	3	6	516322	516327	0 %	50 %	50 %	0 %	15678604
10523	NC_000916	TCC	2	6	516373	516378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678604
10524	NC_000916	CCT	2	6	516468	516473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10525	NC_000916	AGG	2	6	516508	516513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_000916	CAA	2	6	516591	516596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_000916	TC	3	6	516598	516603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10528	NC_000916	CA	3	6	516699	516704	50 %	0 %	0 %	50 %	15678605
10529	NC_000916	TTC	2	6	516713	516718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678605
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10533	NC_000916	TGA	2	6	516856	516861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678605
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10539	NC_000916	GCC	2	6	517144	517149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678605
10540	NC_000916	ATC	2	6	517172	517177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678605
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10543	NC_000916	CCCGG	2	10	517312	517321	0 %	0 %	40 %	60 %	15678605
10544	NC_000916	GGA	2	6	517390	517395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678605
10545	NC_000916	CCCTGA	2	12	517669	517680	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10546	NC_000916	AT	3	6	517817	517822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_000916	AGC	2	6	517840	517845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10554	NC_000916	CAT	2	6	518234	518239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678606
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10557	NC_000916	C	6	6	518339	518344	0 %	0 %	0 %	100 %	15678606
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10561	NC_000916	GGGA	2	8	518602	518609	25 %	0 %	75 %	0 %	15678607
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10605	NC_000916	CCA	2	6	521041	521046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678610
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10607	NC_000916	AGG	2	6	521097	521102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678610
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10609	NC_000916	CCA	2	6	521156	521161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678610
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10616	NC_000916	ATAC	2	8	521575	521582	50 %	25 %	0 %	25 %	15678611
10617	NC_000916	AGGG	2	8	521704	521711	25 %	0 %	75 %	0 %	15678611
10618	NC_000916	T	6	6	521902	521907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_000916	TTC	2	6	521991	521996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10620	NC_000916	TGA	2	6	522001	522006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_000916	TGA	2	6	522057	522062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678612
10622	NC_000916	TGC	2	6	522189	522194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678612
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10624	NC_000916	GGT	2	6	522292	522297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678612
10625	NC_000916	GAT	2	6	522385	522390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678612
10626	NC_000916	CA	3	6	522430	522435	50 %	0 %	0 %	50 %	15678612
10627	NC_000916	AT	3	6	522438	522443	50 %	50 %	0 %	0 %	15678612
10628	NC_000916	AG	3	6	522467	522472	50 %	0 %	50 %	0 %	15678612
10629	NC_000916	ATG	2	6	522473	522478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678612
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10632	NC_000916	GCT	2	6	522564	522569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678612
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10637	NC_000916	GTCATC	2	12	522871	522882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15678612
10638	NC_000916	ACT	2	6	522995	523000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678612
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10641	NC_000916	GA	3	6	523108	523113	50 %	0 %	50 %	0 %	15678612
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10645	NC_000916	GAT	2	6	523370	523375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678612
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10744	NC_000916	CCT	2	6	528308	528313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678616
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10992	NC_000916	CAG	2	6	541077	541082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678632
10993	NC_000916	TGG	2	6	541130	541135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678632
10994	NC_000916	TGG	2	6	541143	541148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678632
10995	NC_000916	GAG	2	6	541188	541193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678632
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10997	NC_000916	GGT	3	9	541317	541325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678633
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10999	NC_000916	ACCA	2	8	541364	541371	50 %	0 %	0 %	50 %	15678633
11000	NC_000916	TCAAGG	2	12	541410	541421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15678633

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