MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_000916	TGC	2	6	490668	490673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678573
10003	NC_000916	TGG	2	6	490696	490701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678573
10004	NC_000916	G	6	6	490721	490726	0 %	0 %	100 %	0 %	15678573
10005	NC_000916	AGG	2	6	490733	490738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678573
10006	NC_000916	CGG	2	6	490746	490751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678573
10007	NC_000916	CTGG	2	8	490767	490774	0 %	25 %	50 %	25 %	15678573
10008	NC_000916	CTC	2	6	490786	490791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678573
10009	NC_000916	AGG	2	6	490828	490833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678573
10010	NC_000916	CCT	2	6	490845	490850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678573
10011	NC_000916	GTG	2	6	490864	490869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678573
10012	NC_000916	CGA	2	6	490890	490895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678573
10013	NC_000916	G	6	6	490941	490946	0 %	0 %	100 %	0 %	15678573
10014	NC_000916	TCA	2	6	490975	490980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678573
10015	NC_000916	TCA	2	6	491017	491022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678573
10016	NC_000916	AGC	2	6	491039	491044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678573
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10019	NC_000916	GGT	2	6	491145	491150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678573
10020	NC_000916	GAG	2	6	491196	491201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678573
10021	NC_000916	C	6	6	491227	491232	0 %	0 %	0 %	100 %	15678573
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10023	NC_000916	ATG	2	6	491267	491272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678573
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10025	NC_000916	TA	3	6	491322	491327	50 %	50 %	0 %	0 %	15678573
10026	NC_000916	AG	3	6	491362	491367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_000916	ATA	2	6	491371	491376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_000916	CCAA	2	8	491407	491414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_000916	TTA	2	6	491420	491425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_000916	GAG	2	6	491445	491450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678574
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10037	NC_000916	CTCA	2	8	491826	491833	25 %	25 %	0 %	50 %	15678574
10038	NC_000916	CAT	2	6	491835	491840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678574
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10051	NC_000916	CCA	2	6	492623	492628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678574
10052	NC_000916	CTC	2	6	492640	492645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678574
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10054	NC_000916	ATC	2	6	492745	492750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10058	NC_000916	ATG	2	6	492945	492950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678575
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10089	NC_000916	CCAT	2	8	494258	494265	25 %	25 %	0 %	50 %	15678576
10090	NC_000916	GCT	2	6	494399	494404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678576
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10101	NC_000916	CAT	2	6	494925	494930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678578
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10105	NC_000916	GCA	2	6	495270	495275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678578
10106	NC_000916	CT	3	6	495282	495287	0 %	50 %	0 %	50 %	15678578
10107	NC_000916	TTC	2	6	495333	495338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678578
10108	NC_000916	CAT	2	6	495367	495372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678578
10109	NC_000916	GCC	2	6	495426	495431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678578
10110	NC_000916	CTCC	2	8	495488	495495	0 %	25 %	0 %	75 %	15678578
10111	NC_000916	ATCGA	2	10	495528	495537	40 %	20 %	20 %	20 %	15678578
10112	NC_000916	C	6	6	495571	495576	0 %	0 %	0 %	100 %	15678578
10113	NC_000916	TCA	2	6	495720	495725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678578
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10118	NC_000916	CCCT	2	8	495873	495880	0 %	25 %	0 %	75 %	15678578
10119	NC_000916	CCT	2	6	495919	495924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678578
10120	NC_000916	ATGTCA	2	12	495987	495998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15678578
10121	NC_000916	CCT	2	6	496016	496021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678578
10122	NC_000916	TCT	2	6	496115	496120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678578
10123	NC_000916	CCTC	2	8	496165	496172	0 %	25 %	0 %	75 %	15678578
10124	NC_000916	CCT	2	6	496208	496213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678578
10125	NC_000916	CTC	2	6	496220	496225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678578
10126	NC_000916	GAG	2	6	496301	496306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678578
10127	NC_000916	CTC	2	6	496328	496333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678578
10128	NC_000916	TC	3	6	496340	496345	0 %	50 %	0 %	50 %	15678578
10129	NC_000916	TCC	2	6	496399	496404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678578
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10131	NC_000916	CCT	2	6	496487	496492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678578
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10134	NC_000916	CAT	2	6	496598	496603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_000916	TTA	2	6	496637	496642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_000916	TGG	2	6	496682	496687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_000916	GAA	2	6	496749	496754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678579
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10182	NC_000916	TGA	2	6	499339	499344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10212	NC_000916	ACT	2	6	500883	500888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678582
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10219	NC_000916	CAG	2	6	501041	501046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10220	NC_000916	CAA	2	6	501064	501069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10221	NC_000916	TAG	2	6	501161	501166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678583
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10225	NC_000916	TCCC	2	8	501302	501309	0 %	25 %	0 %	75 %	15678583
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10229	NC_000916	CT	3	6	501569	501574	0 %	50 %	0 %	50 %	15678583
10230	NC_000916	ACC	2	6	501632	501637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678583
10231	NC_000916	T	6	6	501672	501677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_000916	GCC	3	9	501719	501727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10233	NC_000916	CTT	3	9	501838	501846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10234	NC_000916	GAG	2	6	501859	501864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10235	NC_000916	CTT	2	6	501865	501870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10236	NC_000916	TCC	2	6	502061	502066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678584
10237	NC_000916	TC	4	8	502073	502080	0 %	50 %	0 %	50 %	15678584
10238	NC_000916	CCT	2	6	502114	502119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678584
10239	NC_000916	TC	3	6	502153	502158	0 %	50 %	0 %	50 %	15678584
10240	NC_000916	TCC	2	6	502190	502195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678584
10241	NC_000916	CTT	3	9	502205	502213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678584
10242	NC_000916	GCT	2	6	502223	502228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678584
10243	NC_000916	AGG	2	6	502313	502318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678584
10244	NC_000916	TCG	2	6	502322	502327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678584
10245	NC_000916	GTC	2	6	502420	502425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678584
10246	NC_000916	CTC	2	6	502439	502444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678584
10247	NC_000916	GCT	2	6	502461	502466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678584
10248	NC_000916	CCCT	2	8	502595	502602	0 %	25 %	0 %	75 %	15678584
10249	NC_000916	GGT	2	6	502653	502658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678584
10250	NC_000916	AGG	2	6	502664	502669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678584
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10252	NC_000916	CAA	2	6	502809	502814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678584
10253	NC_000916	CCG	2	6	502953	502958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678584
10254	NC_000916	TGA	2	6	502986	502991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678584
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10258	NC_000916	TATT	2	8	503126	503133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_000916	AAT	2	6	503137	503142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_000916	TCA	2	6	503172	503177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10262	NC_000916	C	7	7	503242	503248	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10263	NC_000916	AAG	2	6	503367	503372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678585
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10308	NC_000916	AG	3	6	505789	505794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10320	NC_000916	ATC	3	9	506385	506393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10348	NC_000916	CCT	2	6	508313	508318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678591
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10354	NC_000916	ATA	2	6	508605	508610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10355	NC_000916	A	6	6	508637	508642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10356	NC_000916	TCCTC	2	10	508666	508675	0 %	40 %	0 %	60 %	15678592
10357	NC_000916	AAGG	2	8	508709	508716	50 %	0 %	50 %	0 %	15678592
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10363	NC_000916	GTC	2	6	508871	508876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678592
10364	NC_000916	CCAT	2	8	508953	508960	25 %	25 %	0 %	50 %	15678592
10365	NC_000916	CAC	2	6	509011	509016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678592
10366	NC_000916	ATATG	2	10	509081	509090	40 %	40 %	20 %	0 %	15678592
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10368	NC_000916	TCC	2	6	509202	509207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678592
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10493	NC_000916	GATCA	2	10	515242	515251	40 %	20 %	20 %	20 %	15678602
10494	NC_000916	TC	3	6	515354	515359	0 %	50 %	0 %	50 %	15678602
10495	NC_000916	T	7	7	515398	515404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_000916	TA	4	8	515412	515419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10497	NC_000916	TAT	3	9	515443	515451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10498	NC_000916	TTA	2	6	515474	515479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678603
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