MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_000916	TCCA	2	8	416435	416442	25 %	25 %	0 %	50 %	15678504
8502	NC_000916	GAG	2	6	416448	416453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678504
8503	NC_000916	GGC	2	6	416454	416459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678504
8504	NC_000916	TACA	2	8	416583	416590	50 %	25 %	0 %	25 %	15678504
8505	NC_000916	GGCC	2	8	416672	416679	0 %	0 %	50 %	50 %	15678504
8506	NC_000916	ACA	2	6	416833	416838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678504
8507	NC_000916	ATG	2	6	416985	416990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678504
8508	NC_000916	C	6	6	417009	417014	0 %	0 %	0 %	100 %	15678504
8509	NC_000916	CTGAT	2	10	417037	417046	20 %	40 %	20 %	20 %	15678504
8510	NC_000916	CAGAG	2	10	417050	417059	40 %	0 %	40 %	20 %	15678504
8511	NC_000916	ATA	2	6	417069	417074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678504
8512	NC_000916	AGC	2	6	417095	417100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678504
8513	NC_000916	GTT	2	6	417108	417113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678504
8514	NC_000916	GCT	2	6	417222	417227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678504
8515	NC_000916	TCT	2	6	417254	417259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678504
8516	NC_000916	TCA	2	6	417273	417278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678504
8517	NC_000916	GGA	2	6	417307	417312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678504
8518	NC_000916	ATG	2	6	417336	417341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678504
8519	NC_000916	TCC	2	6	417384	417389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678504
8520	NC_000916	TGG	2	6	417415	417420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678504
8521	NC_000916	CAT	2	6	417533	417538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678504
8522	NC_000916	GAT	3	9	417561	417569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678504
8523	NC_000916	CAT	2	6	417572	417577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678504
8524	NC_000916	TGG	2	6	417603	417608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678504
8525	NC_000916	CGG	2	6	417688	417693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678504
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8529	NC_000916	CAGA	2	8	417801	417808	50 %	0 %	25 %	25 %	15678504
8530	NC_000916	GGGGCC	2	12	417850	417861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678504
8531	NC_000916	GAT	2	6	417870	417875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678504
8532	NC_000916	GGA	2	6	417887	417892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678504
8533	NC_000916	GAGG	2	8	417899	417906	25 %	0 %	75 %	0 %	15678504
8534	NC_000916	GGTCC	2	10	417921	417930	0 %	20 %	40 %	40 %	15678504
8535	NC_000916	GGT	2	6	418045	418050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678505
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8537	NC_000916	GCT	2	6	418122	418127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678505
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8539	NC_000916	TGG	2	6	418230	418235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678505
8540	NC_000916	CT	3	6	418256	418261	0 %	50 %	0 %	50 %	15678505
8541	NC_000916	CAA	2	6	418350	418355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678505
8542	NC_000916	T	6	6	418381	418386	0 %	100 %	0 %	0 %	15678505
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8546	NC_000916	CCTTGA	2	12	418525	418536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15678505
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8550	NC_000916	TCA	2	6	418829	418834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678505
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8553	NC_000916	AGG	2	6	418898	418903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678505
8554	NC_000916	ATG	2	6	418931	418936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678505
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8556	NC_000916	CAT	2	6	419032	419037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678505
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8589	NC_000916	TTC	2	6	420261	420266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678507
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8609	NC_000916	CT	3	6	421124	421129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8611	NC_000916	T	6	6	421143	421148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8623	NC_000916	CCT	2	6	421692	421697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678509
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8995	NC_000916	ATG	2	6	440377	440382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678526
8996	NC_000916	GCA	2	6	440391	440396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678526
8997	NC_000916	AGA	2	6	440401	440406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678526
8998	NC_000916	TGA	2	6	440465	440470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678526
8999	NC_000916	ACG	2	6	440483	440488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678526
9000	NC_000916	GAATA	2	10	440507	440516	60 %	20 %	20 %	0 %	15678526

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