MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_000916	CCT	2	6	366482	366487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678456
7502	NC_000916	TGC	2	6	366494	366499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678456
7503	NC_000916	AAC	2	6	366501	366506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678456
7504	NC_000916	CAG	2	6	366526	366531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_000916	ATA	2	6	366603	366608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678457
7506	NC_000916	TGG	2	6	366628	366633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678457
7507	NC_000916	GAT	2	6	366680	366685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678457
7508	NC_000916	GCA	2	6	366714	366719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678457
7509	NC_000916	TGAGG	2	10	366782	366791	20 %	20 %	60 %	0 %	15678457
7510	NC_000916	CAAC	2	8	366865	366872	50 %	0 %	0 %	50 %	15678457
7511	NC_000916	AGG	2	6	367020	367025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_000916	CTTG	2	8	367032	367039	0 %	50 %	25 %	25 %	15678458
7513	NC_000916	CAG	3	9	367221	367229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678458
7514	NC_000916	GAG	2	6	367249	367254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678458
7515	NC_000916	GCCA	2	8	367292	367299	25 %	0 %	25 %	50 %	15678458
7516	NC_000916	GTT	2	6	367345	367350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678458
7517	NC_000916	GGC	2	6	367402	367407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678458
7518	NC_000916	AAT	2	6	367609	367614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678459
7519	NC_000916	GAA	3	9	367618	367626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678459
7520	NC_000916	CGG	2	6	367669	367674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678459
7521	NC_000916	CTT	2	6	367678	367683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678459
7522	NC_000916	ATG	2	6	367698	367703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678459
7523	NC_000916	G	6	6	367722	367727	0 %	0 %	100 %	0 %	15678459
7524	NC_000916	AGG	2	6	367821	367826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678459
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7527	NC_000916	ATA	2	6	367916	367921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678459
7528	NC_000916	AACAT	2	10	367928	367937	60 %	20 %	0 %	20 %	15678459
7529	NC_000916	AAT	2	6	367963	367968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678459
7530	NC_000916	TGG	3	9	368073	368081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678459
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7533	NC_000916	GAG	2	6	368165	368170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678459
7534	NC_000916	TA	3	6	368296	368301	50 %	50 %	0 %	0 %	15678459
7535	NC_000916	TGA	2	6	368321	368326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678459
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7537	NC_000916	CCT	2	6	368475	368480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678460
7538	NC_000916	GAG	4	12	368530	368541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678460
7539	NC_000916	CT	3	6	368609	368614	0 %	50 %	0 %	50 %	15678460
7540	NC_000916	AGG	2	6	368653	368658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678460
7541	NC_000916	GGA	2	6	368712	368717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678460
7542	NC_000916	TGA	2	6	368772	368777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678460
7543	NC_000916	GGA	2	6	368789	368794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678460
7544	NC_000916	GAT	2	6	368808	368813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678460
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7546	NC_000916	GTG	2	6	368867	368872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678460
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7549	NC_000916	GCCA	2	8	369061	369068	25 %	0 %	25 %	50 %	15678461
7550	NC_000916	CTC	2	6	369135	369140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678461
7551	NC_000916	TGTT	2	8	369172	369179	0 %	75 %	25 %	0 %	15678461
7552	NC_000916	T	6	6	369213	369218	0 %	100 %	0 %	0 %	15678461
7553	NC_000916	CCT	2	6	369263	369268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678461
7554	NC_000916	AACTTT	2	12	369405	369416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15678461
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7556	NC_000916	TCC	2	6	369430	369435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678462
7557	NC_000916	CTG	2	6	369437	369442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678462
7558	NC_000916	CTC	2	6	369445	369450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678462
7559	NC_000916	T	7	7	369490	369496	0 %	100 %	0 %	0 %	15678462
7560	NC_000916	GTC	2	6	369613	369618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678462
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7562	NC_000916	TCTT	2	8	369654	369661	0 %	75 %	0 %	25 %	15678462
7563	NC_000916	TTCTGA	2	12	369754	369765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15678462
7564	NC_000916	TCC	2	6	369815	369820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678462
7565	NC_000916	TTA	2	6	369876	369881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678462
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7567	NC_000916	CTG	2	6	370022	370027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_000916	T	8	8	370054	370061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_000916	CCATA	2	10	370083	370092	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7570	NC_000916	CGA	2	6	370205	370210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678463
7571	NC_000916	GTA	2	6	370373	370378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678463
7572	NC_000916	CTGTC	2	10	370382	370391	0 %	40 %	20 %	40 %	15678463
7573	NC_000916	ATC	2	6	370470	370475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678463
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7587	NC_000916	GGA	2	6	370991	370996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_000916	GGAG	2	8	371052	371059	25 %	0 %	75 %	0 %	15678464
7589	NC_000916	G	6	6	371065	371070	0 %	0 %	100 %	0 %	15678464
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7596	NC_000916	GGTCC	2	10	371378	371387	0 %	20 %	40 %	40 %	15678465
7597	NC_000916	AAG	2	6	371446	371451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678465
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7607	NC_000916	GAG	2	6	372052	372057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678465
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7609	NC_000916	G	6	6	372087	372092	0 %	0 %	100 %	0 %	15678465
7610	NC_000916	AGGG	2	8	372124	372131	25 %	0 %	75 %	0 %	15678465
7611	NC_000916	AAT	2	6	372261	372266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7613	NC_000916	CAA	2	6	372345	372350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678466
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7618	NC_000916	TAA	2	6	372539	372544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_000916	AT	3	6	372549	372554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_000916	ATT	2	6	372566	372571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7622	NC_000916	TTAT	2	8	372686	372693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_000916	CT	3	6	372706	372711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7624	NC_000916	AGA	2	6	372738	372743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8000	NC_000916	CCT	2	6	391653	391658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678481

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