MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_000916	TCA	2	6	340823	340828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678430
7002	NC_000916	GTG	2	6	340884	340889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_000916	GAG	2	6	340941	340946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_000916	CCT	2	6	340955	340960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_000916	AGAA	2	8	340980	340987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_000916	TG	3	6	341120	341125	0 %	50 %	50 %	0 %	15678431
7007	NC_000916	CCA	2	6	341130	341135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678431
7008	NC_000916	AGG	2	6	341162	341167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678431
7009	NC_000916	GCAACC	2	12	341180	341191	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15678431
7010	NC_000916	AGGG	2	8	341206	341213	25 %	0 %	75 %	0 %	15678431
7011	NC_000916	GTG	2	6	341220	341225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678431
7012	NC_000916	TCCT	2	8	341231	341238	0 %	50 %	0 %	50 %	15678431
7013	NC_000916	CTA	2	6	341287	341292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678431
7014	NC_000916	GGAT	2	8	341398	341405	25 %	25 %	50 %	0 %	15678431
7015	NC_000916	ATG	2	6	341414	341419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678431
7016	NC_000916	CAT	2	6	341545	341550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678431
7017	NC_000916	AGGC	2	8	341598	341605	25 %	0 %	50 %	25 %	15678431
7018	NC_000916	GCC	2	6	341609	341614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678431
7019	NC_000916	AGG	2	6	341628	341633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678431
7020	NC_000916	GCA	2	6	341669	341674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678431
7021	NC_000916	CAC	2	6	341710	341715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678431
7022	NC_000916	ACC	2	6	341718	341723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678431
7023	NC_000916	AGG	2	6	341742	341747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678431
7024	NC_000916	GAG	2	6	341831	341836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678431
7025	NC_000916	GAG	2	6	342031	342036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678432
7026	NC_000916	CAG	2	6	342074	342079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678432
7027	NC_000916	AGGG	2	8	342148	342155	25 %	0 %	75 %	0 %	15678432
7028	NC_000916	G	6	6	342153	342158	0 %	0 %	100 %	0 %	15678432
7029	NC_000916	CTC	2	6	342160	342165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678432
7030	NC_000916	CGT	2	6	342204	342209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678432
7031	NC_000916	AC	3	6	342296	342301	50 %	0 %	0 %	50 %	15678432
7032	NC_000916	TGA	2	6	342321	342326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678432
7033	NC_000916	CTG	2	6	342343	342348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678432
7034	NC_000916	TCC	2	6	342500	342505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678432
7035	NC_000916	TGA	2	6	342530	342535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678432
7036	NC_000916	GAG	2	6	342553	342558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678432
7037	NC_000916	GCA	2	6	342559	342564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678432
7038	NC_000916	GTGGTT	2	12	342583	342594	0 %	50 %	50 %	0 %	15678432
7039	NC_000916	TGG	2	6	342641	342646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678432
7040	NC_000916	ACG	2	6	342673	342678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678432
7041	NC_000916	AT	3	6	342709	342714	50 %	50 %	0 %	0 %	15678432
7042	NC_000916	GGA	2	6	342784	342789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678432
7043	NC_000916	TCCC	2	8	342805	342812	0 %	25 %	0 %	75 %	15678432
7044	NC_000916	AGG	2	6	342836	342841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678432
7045	NC_000916	A	7	7	342921	342927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_000916	TAA	2	6	342951	342956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_000916	ATC	2	6	343010	343015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678433
7048	NC_000916	AAG	2	6	343019	343024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678433
7049	NC_000916	GGA	2	6	343030	343035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678433
7050	NC_000916	GAG	2	6	343073	343078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678433
7051	NC_000916	GT	3	6	343150	343155	0 %	50 %	50 %	0 %	15678433
7052	NC_000916	GAG	2	6	343175	343180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678433
7053	NC_000916	ATC	2	6	343204	343209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678433
7054	NC_000916	GTT	2	6	343292	343297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678433
7055	NC_000916	CCA	2	6	343308	343313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678433
7056	NC_000916	GAA	2	6	343378	343383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678433
7057	NC_000916	AGAT	2	8	343396	343403	50 %	25 %	25 %	0 %	15678433
7058	NC_000916	GGT	2	6	343471	343476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678433
7059	NC_000916	CGG	2	6	343574	343579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678433
7060	NC_000916	GAG	2	6	343622	343627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678433
7061	NC_000916	GCA	2	6	343727	343732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678433
7062	NC_000916	GTT	2	6	343812	343817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678434
7063	NC_000916	GGA	2	6	343835	343840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678434
7064	NC_000916	TGT	2	6	343862	343867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678434
7065	NC_000916	GATGGG	2	12	343869	343880	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15678434
7066	NC_000916	CAT	2	6	343952	343957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678434
7067	NC_000916	ATA	2	6	344211	344216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678434
7068	NC_000916	GAG	2	6	344219	344224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678434
7069	NC_000916	GAG	2	6	344259	344264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678434
7070	NC_000916	GCAAGG	2	12	344373	344384	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15678434
7071	NC_000916	CACC	2	8	344392	344399	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7072	NC_000916	TCTG	3	12	344451	344462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7073	NC_000916	CT	4	8	344510	344517	0 %	50 %	0 %	50 %	15678435
7074	NC_000916	ATC	2	6	344574	344579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678435
7075	NC_000916	CTT	2	6	344636	344641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678435
7076	NC_000916	ACC	2	6	344643	344648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678435
7077	NC_000916	TTA	2	6	344664	344669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678435
7078	NC_000916	ATA	2	6	344682	344687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678435
7079	NC_000916	T	6	6	344788	344793	0 %	100 %	0 %	0 %	15678436
7080	NC_000916	CTA	2	6	344884	344889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678436
7081	NC_000916	GAA	2	6	344902	344907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678436
7082	NC_000916	TGA	2	6	344940	344945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678436
7083	NC_000916	TTGAT	2	10	344975	344984	20 %	60 %	20 %	0 %	15678436
7084	NC_000916	ATGA	2	8	344989	344996	50 %	25 %	25 %	0 %	15678436
7085	NC_000916	GAT	2	6	345049	345054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678436
7086	NC_000916	A	6	6	345059	345064	100 %	0 %	0 %	0 %	15678436
7087	NC_000916	AGG	2	6	345106	345111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678436
7088	NC_000916	TAT	2	6	345112	345117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678436
7089	NC_000916	CAG	2	6	345157	345162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678436
7090	NC_000916	TCA	2	6	345186	345191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_000916	AG	3	6	345197	345202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_000916	AG	3	6	345382	345387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_000916	AAC	2	6	345526	345531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678437
7094	NC_000916	GAT	2	6	345535	345540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678437
7095	NC_000916	A	6	6	345577	345582	100 %	0 %	0 %	0 %	15678437
7096	NC_000916	GCT	2	6	345602	345607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_000916	ATG	2	6	345635	345640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_000916	ATG	2	6	345651	345656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678438
7099	NC_000916	TAT	2	6	345686	345691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678438
7100	NC_000916	A	6	6	345775	345780	100 %	0 %	0 %	0 %	15678438
7101	NC_000916	TATGA	2	10	345843	345852	40 %	40 %	20 %	0 %	15678438
7102	NC_000916	AC	3	6	345853	345858	50 %	0 %	0 %	50 %	15678438
7103	NC_000916	GCA	2	6	345952	345957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678439
7104	NC_000916	GCA	2	6	345961	345966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678439
7105	NC_000916	GCA	2	6	345973	345978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678439
7106	NC_000916	TCC	2	6	345983	345988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678439
7107	NC_000916	CTC	2	6	346021	346026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678439
7108	NC_000916	GCA	2	6	346066	346071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678439
7109	NC_000916	GTCAG	2	10	346072	346081	20 %	20 %	40 %	20 %	15678439
7110	NC_000916	GAG	2	6	346204	346209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678439
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7112	NC_000916	CA	3	6	346226	346231	50 %	0 %	0 %	50 %	15678439
7113	NC_000916	AGGA	2	8	346319	346326	50 %	0 %	50 %	0 %	15678439
7114	NC_000916	TCCC	2	8	346423	346430	0 %	25 %	0 %	75 %	15678439
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7117	NC_000916	GA	3	6	346582	346587	50 %	0 %	50 %	0 %	15678439
7118	NC_000916	AC	3	6	346613	346618	50 %	0 %	0 %	50 %	15678439
7119	NC_000916	TGC	2	6	346706	346711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678439
7120	NC_000916	CTC	2	6	346735	346740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678439
7121	NC_000916	TCA	2	6	346799	346804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678439
7122	NC_000916	CAT	2	6	346845	346850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678439
7123	NC_000916	GGA	2	6	346908	346913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678439
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7125	NC_000916	AGC	2	6	346938	346943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678439
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7376	NC_000916	AGG	2	6	360126	360131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678449
7377	NC_000916	TAC	2	6	360173	360178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678449
7378	NC_000916	GAG	3	9	360293	360301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678449
7379	NC_000916	CAT	2	6	360454	360459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678449
7380	NC_000916	GGT	2	6	360471	360476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678450
7381	NC_000916	AT	3	6	360545	360550	50 %	50 %	0 %	0 %	15678450
7382	NC_000916	CTG	2	6	360636	360641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678450
7383	NC_000916	TCC	2	6	360652	360657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678450
7384	NC_000916	GGA	2	6	360666	360671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678450
7385	NC_000916	TCA	2	6	360841	360846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678450
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7388	NC_000916	TCT	2	6	361047	361052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678451
7389	NC_000916	GCAGT	2	10	361062	361071	20 %	20 %	40 %	20 %	15678451
7390	NC_000916	CAT	2	6	361087	361092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678451
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7393	NC_000916	TGA	2	6	361249	361254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678451
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7399	NC_000916	TTCC	2	8	361451	361458	0 %	50 %	0 %	50 %	15678451
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7402	NC_000916	CTT	2	6	361549	361554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678451
7403	NC_000916	TTC	2	6	361634	361639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678451
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7405	NC_000916	GGTG	2	8	361744	361751	0 %	25 %	75 %	0 %	15678451
7406	NC_000916	CCT	2	6	361758	361763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678451
7407	NC_000916	AAT	2	6	361823	361828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678451
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7410	NC_000916	TAA	2	6	361941	361946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7411	NC_000916	TGTCC	2	10	362034	362043	0 %	40 %	20 %	40 %	15678452
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7417	NC_000916	TGA	2	6	362319	362324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678452
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7419	NC_000916	ATA	2	6	362398	362403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678452
7420	NC_000916	AT	3	6	362418	362423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7421	NC_000916	AT	3	6	362434	362439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7422	NC_000916	AAT	2	6	362440	362445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7462	NC_000916	ATC	2	6	364287	364292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678455
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7481	NC_000916	GGAT	2	8	365486	365493	25 %	25 %	50 %	0 %	15678456
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