MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_000916	TGA	2	6	267596	267601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678360
5503	NC_000916	ATG	2	6	267617	267622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678360
5504	NC_000916	GAA	2	6	267674	267679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678360
5505	NC_000916	ATG	2	6	267698	267703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678360
5506	NC_000916	TG	3	6	267715	267720	0 %	50 %	50 %	0 %	15678360
5507	NC_000916	GTG	2	6	267723	267728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678360
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5513	NC_000916	TCA	2	6	267965	267970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678360
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5555	NC_000916	TGC	2	6	270220	270225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678362
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5608	NC_000916	A	6	6	272322	272327	100 %	0 %	0 %	0 %	15678364
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5610	NC_000916	A	6	6	272391	272396	100 %	0 %	0 %	0 %	15678364
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5743	NC_000916	GCA	2	6	277890	277895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678368
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5752	NC_000916	GAT	2	6	278262	278267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678369
5753	NC_000916	ATCT	2	8	278280	278287	25 %	50 %	0 %	25 %	15678369
5754	NC_000916	TTC	2	6	278329	278334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678369
5755	NC_000916	TA	3	6	278345	278350	50 %	50 %	0 %	0 %	15678369
5756	NC_000916	GAG	2	6	278358	278363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678369
5757	NC_000916	ACC	2	6	278400	278405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678369
5758	NC_000916	TCC	2	6	278456	278461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678369
5759	NC_000916	CTTT	2	8	278462	278469	0 %	75 %	0 %	25 %	15678369
5760	NC_000916	TC	3	6	278550	278555	0 %	50 %	0 %	50 %	15678369
5761	NC_000916	GTA	4	12	278597	278608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678369
5762	NC_000916	CAC	2	6	278654	278659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678369
5763	NC_000916	GAT	2	6	278759	278764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678369
5764	NC_000916	CTG	2	6	278788	278793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678369
5765	NC_000916	GGCAG	2	10	278825	278834	20 %	0 %	60 %	20 %	15678369
5766	NC_000916	GAT	2	6	278925	278930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678369
5767	NC_000916	GGTTCA	2	12	278956	278967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15678369
5768	NC_000916	CTC	2	6	279018	279023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678369
5769	NC_000916	ACC	2	6	279054	279059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678369
5770	NC_000916	GGA	2	6	279060	279065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678369
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5773	NC_000916	ATC	2	6	279135	279140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678369
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5775	NC_000916	CAA	2	6	279239	279244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678369
5776	NC_000916	TCA	2	6	279278	279283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678369
5777	NC_000916	CGC	2	6	279306	279311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678369
5778	NC_000916	TTC	2	6	279355	279360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678369
5779	NC_000916	TCC	2	6	279367	279372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678370
5780	NC_000916	TCC	2	6	279399	279404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678370
5781	NC_000916	GCT	2	6	279450	279455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678370
5782	NC_000916	CAG	3	9	279467	279475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678370
5783	NC_000916	ATC	2	6	279498	279503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678370
5784	NC_000916	TGC	2	6	279521	279526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678370
5785	NC_000916	TGA	2	6	279535	279540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678370
5786	NC_000916	TA	3	6	279578	279583	50 %	50 %	0 %	0 %	15678370
5787	NC_000916	AGAGGA	2	12	279586	279597	50 %	0 %	50 %	0 %	15678370
5788	NC_000916	AGG	2	6	279603	279608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678370
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5790	NC_000916	GTA	2	6	279650	279655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678370
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5793	NC_000916	GCA	2	6	279879	279884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678370
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5801	NC_000916	TGC	2	6	280226	280231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678370
5802	NC_000916	ATG	2	6	280296	280301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678370
5803	NC_000916	CT	3	6	280335	280340	0 %	50 %	0 %	50 %	15678370
5804	NC_000916	AGG	2	6	280446	280451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678370
5805	NC_000916	ATG	2	6	280558	280563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678370
5806	NC_000916	GAG	2	6	280595	280600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678370
5807	NC_000916	AGT	2	6	280632	280637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678370
5808	NC_000916	CAT	2	6	280908	280913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5809	NC_000916	CCT	2	6	281103	281108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678371
5810	NC_000916	AGG	2	6	281155	281160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678371
5811	NC_000916	TGCCC	2	10	281190	281199	0 %	20 %	20 %	60 %	15678371
5812	NC_000916	TCCT	2	8	281203	281210	0 %	50 %	0 %	50 %	15678371
5813	NC_000916	ACC	2	6	281269	281274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678371
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5816	NC_000916	CAT	2	6	281399	281404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678371
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5819	NC_000916	TCC	2	6	281506	281511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678371
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5823	NC_000916	ATC	3	9	281634	281642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678371
5824	NC_000916	CAT	3	9	281687	281695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678371
5825	NC_000916	CAT	2	6	281720	281725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678371
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5830	NC_000916	CTC	2	6	282014	282019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5831	NC_000916	AGAC	2	8	282043	282050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5832	NC_000916	TCCTC	2	10	282062	282071	0 %	40 %	0 %	60 %	15678372
5833	NC_000916	ATC	2	6	282099	282104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678372
5834	NC_000916	TAG	2	6	282112	282117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678372
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5843	NC_000916	GAG	2	6	282879	282884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678372
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5845	NC_000916	CCT	2	6	282998	283003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678372
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5850	NC_000916	CT	3	6	283117	283122	0 %	50 %	0 %	50 %	15678372
5851	NC_000916	GCTG	2	8	283127	283134	0 %	25 %	50 %	25 %	15678372
5852	NC_000916	CT	3	6	283141	283146	0 %	50 %	0 %	50 %	15678372
5853	NC_000916	ATG	2	6	283180	283185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678372
5854	NC_000916	ATTC	2	8	283222	283229	25 %	50 %	0 %	25 %	15678373
5855	NC_000916	T	7	7	283261	283267	0 %	100 %	0 %	0 %	15678373
5856	NC_000916	CAT	2	6	283275	283280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678373
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5858	NC_000916	TGA	2	6	283392	283397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678373
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5860	NC_000916	TCC	2	6	283485	283490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678373
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5863	NC_000916	CTG	2	6	283626	283631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678373
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5866	NC_000916	GTA	2	6	283729	283734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678373
5867	NC_000916	CA	3	6	283888	283893	50 %	0 %	0 %	50 %	15678373
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5871	NC_000916	CCT	2	6	284105	284110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678374
5872	NC_000916	CTC	2	6	284129	284134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678374
5873	NC_000916	ATTC	2	8	284296	284303	25 %	50 %	0 %	25 %	15678374
5874	NC_000916	CAA	2	6	284341	284346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678374
5875	NC_000916	GCT	2	6	284379	284384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678374
5876	NC_000916	G	6	6	284431	284436	0 %	0 %	100 %	0 %	15678374
5877	NC_000916	C	6	6	284543	284548	0 %	0 %	0 %	100 %	15678374
5878	NC_000916	GCA	2	6	284560	284565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678374
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5881	NC_000916	CCATA	2	10	284608	284617	40 %	20 %	0 %	40 %	15678374
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5932	NC_000916	TGA	2	6	287270	287275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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