MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 9665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_022112	TGA	2	6	2543776	2543781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_022112	CAA	2	6	2543863	2543868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_022112	A	7	7	2543867	2543873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_022112	CCA	2	6	2543874	2543879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_022112	T	6	6	2543905	2543910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_022112	GGT	2	6	2543992	2543997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_022112	CAA	3	9	2544006	2544014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_022112	TA	3	6	2544039	2544044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_022112	A	7	7	2544063	2544069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_022112	ACA	2	6	2544395	2544400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_022112	CAA	2	6	2545799	2545804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_022112	TCA	2	6	2545807	2545812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_022112	A	6	6	2545848	2545853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_022112	AGCG	2	8	2545976	2545983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8515	NC_022112	AGCG	2	8	2546100	2546107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8516	NC_022112	A	6	6	2546272	2546277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_022112	T	6	6	2547951	2547956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_022112	AAT	2	6	2547957	2547962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_022112	A	6	6	2547967	2547972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_022112	ATAA	2	8	2548116	2548123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_022112	ATC	2	6	2549207	2549212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8523	NC_022112	GCA	2	6	2549329	2549334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_022112	TA	3	6	2549338	2549343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_022112	CA	3	6	2549429	2549434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8526	NC_022112	A	7	7	2549434	2549440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8528	NC_022112	TATAA	2	10	2550789	2550798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_022112	AGAA	2	8	2550813	2550820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_022112	T	6	6	2553521	2553526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_022112	GCA	2	6	2554622	2554627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8533	NC_022112	AAT	2	6	2555137	2555142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_022112	TAG	2	6	2555188	2555193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_022112	TTGC	2	8	2556444	2556451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8536	NC_022112	TG	3	6	2557822	2557827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_022112	ATT	2	6	2557868	2557873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_022112	TA	3	6	2557939	2557944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_022112	ATT	2	6	2557967	2557972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_022112	T	7	7	2558021	2558027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_022112	ATTT	2	8	2558029	2558036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_022112	GGA	2	6	2558043	2558048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_022112	A	6	6	2559277	2559282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_022112	ATC	2	6	2559333	2559338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_022112	ATCTA	2	10	2559362	2559371	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8546	NC_022112	TTTG	2	8	2559797	2559804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_022112	AGT	2	6	2559810	2559815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_022112	CAAA	2	8	2559831	2559838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8549	NC_022112	CAG	2	6	2559853	2559858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_022112	CAAT	2	8	2559892	2559899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8551	NC_022112	ATG	2	6	2559982	2559987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_022112	TAAA	2	8	2559992	2559999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_022112	A	6	6	2559997	2560002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_022112	T	6	6	2560027	2560032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_022112	TCC	2	6	2561016	2561021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8556	NC_022112	A	7	7	2561077	2561083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_022112	ACA	2	6	2562554	2562559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_022112	GTGG	2	8	2562561	2562568	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_022112	CAA	2	6	2562589	2562594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_022112	CACTA	2	10	2564704	2564713	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8561	NC_022112	CAA	2	6	2564731	2564736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_022112	GTT	2	6	2564774	2564779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8564	NC_022112	AACG	2	8	2564785	2564792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8565	NC_022112	CTT	2	6	2564850	2564855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8571	NC_022112	TCT	2	6	2568431	2568436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8580	NC_022112	A	7	7	2573948	2573954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_022112	CTAG	2	8	2573966	2573973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8582	NC_022112	AGG	2	6	2574035	2574040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8589	NC_022112	CTTTG	2	10	2583994	2584003	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8593	NC_022112	A	6	6	2585039	2585044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_022112	GAT	2	6	2585733	2585738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8599	NC_022112	TAACA	2	10	2586699	2586708	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8601	NC_022112	TTA	2	6	2586765	2586770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8608	NC_022112	T	6	6	2588614	2588619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_022112	CTT	2	6	2588634	2588639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_022112	ATCC	2	8	2589951	2589958	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8612	NC_022112	GGCT	2	8	2590066	2590073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8613	NC_022112	GCT	2	6	2590107	2590112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8615	NC_022112	TTA	2	6	2594890	2594895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8617	NC_022112	TTC	2	6	2594972	2594977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_022112	CTG	2	6	2595008	2595013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_022112	TAA	2	6	2595045	2595050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8623	NC_022112	CTGCGA	2	12	2596212	2596223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8625	NC_022112	CTGCGA	2	12	2596335	2596346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_022112	GAG	2	6	2596366	2596371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_022112	TCA	2	6	2597356	2597361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_022112	GC	3	6	2597871	2597876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8629	NC_022112	GC	3	6	2597992	2597997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8630	NC_022112	GC	3	6	2598114	2598119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8631	NC_022112	ATCA	2	8	2598278	2598285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8632	NC_022112	TCC	2	6	2599658	2599663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8633	NC_022112	CAA	2	6	2599704	2599709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8634	NC_022112	CAA	2	6	2599801	2599806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8635	NC_022112	A	6	6	2599816	2599821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8636	NC_022112	AT	3	6	2599853	2599858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8637	NC_022112	TACC	2	8	2601375	2601382	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8638	NC_022112	AAC	2	6	2601407	2601412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8639	NC_022112	AGGC	2	8	2601428	2601435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8640	NC_022112	ATC	2	6	2601453	2601458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8641	NC_022112	CAT	2	6	2601475	2601480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8642	NC_022112	GAC	2	6	2601489	2601494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8643	NC_022112	TCC	2	6	2602552	2602557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8644	NC_022112	TGA	2	6	2602737	2602742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8645	NC_022112	A	7	7	2602810	2602816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8646	NC_022112	AAC	2	6	2602831	2602836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8647	NC_022112	GC	3	6	2602848	2602853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8648	NC_022112	ACC	2	6	2602857	2602862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8649	NC_022112	CT	3	6	2602884	2602889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8650	NC_022112	CACC	2	8	2602902	2602909	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8651	NC_022112	CT	3	6	2602971	2602976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8652	NC_022112	TG	3	6	2603007	2603012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8653	NC_022112	ATT	2	6	2603112	2603117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8655	NC_022112	TTC	2	6	2605273	2605278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8656	NC_022112	TAA	2	6	2605330	2605335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8657	NC_022112	A	7	7	2605334	2605340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8662	NC_022112	TCTT	2	8	2609327	2609334	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8663	NC_022112	AAG	2	6	2609404	2609409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8664	NC_022112	AG	3	6	2609452	2609457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8665	NC_022112	GCG	2	6	2609466	2609471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8672	NC_022112	GTTT	2	8	2612231	2612238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8686	NC_022112	GGTT	2	8	2615448	2615455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8692	NC_022112	A	7	7	2615677	2615683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8737	NC_022112	TTAT	2	8	2630138	2630145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8738	NC_022112	CA	3	6	2630148	2630153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8739	NC_022112	ATG	2	6	2630162	2630167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8743	NC_022112	T	8	8	2631041	2631048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8747	NC_022112	T	7	7	2631896	2631902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8748	NC_022112	TCTG	2	8	2631910	2631917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8749	NC_022112	T	6	6	2631938	2631943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8750	NC_022112	TTG	2	6	2631979	2631984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8751	NC_022112	GTA	2	6	2632018	2632023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8752	NC_022112	CCAC	2	8	2632043	2632050	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8753	NC_022112	CCCAA	2	10	2632065	2632074	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8754	NC_022112	CTC	2	6	2632089	2632094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8755	NC_022112	TCG	2	6	2632106	2632111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8756	NC_022112	CAA	2	6	2632131	2632136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8757	NC_022112	GCC	2	6	2632141	2632146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8758	NC_022112	TGC	2	6	2632164	2632169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8759	NC_022112	CCGA	2	8	2632216	2632223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8760	NC_022112	GTTT	2	8	2635186	2635193	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8761	NC_022112	TTTCAG	2	12	2635233	2635244	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8762	NC_022112	AGG	2	6	2635277	2635282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8763	NC_022112	GGA	2	6	2637721	2637726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8765	NC_022112	CAAT	2	8	2637885	2637892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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