MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 7488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021872	TTAG	2	8	1454640	1454647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021872	TG	3	6	1454668	1454673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021872	AGTT	2	8	1454746	1454753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021872	CTT	2	6	1454768	1454773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_021872	AGTT	2	8	1454840	1454847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021872	AGT	2	6	1454857	1454862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021872	TTC	2	6	1454894	1454899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_021872	TAA	2	6	1454939	1454944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021872	CTTT	2	8	1454953	1454960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5012	NC_021872	GTG	2	6	1455188	1455193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021872	TAGA	2	8	1455227	1455234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021872	AGT	2	6	1455243	1455248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021872	CCT	2	6	1455261	1455266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_021872	TCA	2	6	1455357	1455362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_021872	AT	3	6	1455363	1455368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5019	NC_021872	CTA	2	6	1455466	1455471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_021872	TAT	2	6	1455520	1455525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021872	TTG	2	6	1455572	1455577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021872	CCA	2	6	1455589	1455594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_021872	CCA	2	6	1455621	1455626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_021872	GCA	2	6	1455724	1455729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5028	NC_021872	TTG	2	6	1455925	1455930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021872	TAT	2	6	1456020	1456025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021872	AGT	2	6	1456191	1456196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021872	AGTT	2	8	1456229	1456236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021872	CTT	2	6	1456252	1456257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_021872	CTTC	2	8	1456286	1456293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5039	NC_021872	T	6	6	1457465	1457470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021872	ATAA	2	8	1457483	1457490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021872	TAA	2	6	1461262	1461267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021872	TTTCA	2	10	1463873	1463882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5043	NC_021872	ATT	2	6	1463894	1463899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021872	TAAGT	3	15	1463978	1463992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_021872	AAT	2	6	1464130	1464135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021872	TAG	2	6	1464139	1464144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5051	NC_021872	TAA	2	6	1465878	1465883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021872	TCAT	2	8	1465947	1465954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5057	NC_021872	ATT	2	6	1466161	1466166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021872	ATA	2	6	1466175	1466180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021872	TGA	2	6	1466190	1466195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5063	NC_021872	TTAG	2	8	1468115	1468122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021872	TA	3	6	1468123	1468128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021872	ATT	2	6	1468138	1468143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021872	ATT	2	6	1468446	1468451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021872	GCAA	2	8	1468461	1468468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_021872	T	7	7	1468485	1468491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5070	NC_021872	T	6	6	1473311	1473316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021872	AGTT	2	8	1473337	1473344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_021872	TA	3	6	1473876	1473881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021872	GTTC	2	8	1475532	1475539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5084	NC_021872	TCAAT	2	10	1475623	1475632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5085	NC_021872	A	6	6	1475639	1475644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_021872	ACTA	2	8	1475763	1475770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_021872	ATT	2	6	1475780	1475785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_021872	AGT	2	6	1477667	1477672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021872	TAA	2	6	1477753	1477758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_021872	GCA	3	9	1478016	1478024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5121	NC_021872	CTAC	2	8	1478384	1478391	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_021872	TCC	2	6	1478422	1478427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_021872	ATA	2	6	1478450	1478455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_021872	TAT	2	6	1480242	1480247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021872	ACC	2	6	1480302	1480307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_021872	GT	3	6	1480325	1480330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021872	GTA	2	6	1480347	1480352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5266	NC_021872	TAGCT	2	10	1519342	1519351	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5267	NC_021872	CTAA	2	8	1519467	1519474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5271	NC_021872	GT	3	6	1519629	1519634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_021872	TAG	2	6	1519681	1519686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5385	NC_021872	CTTGC	2	10	1532036	1532045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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