MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 7488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021872	TGT	2	6	1285040	1285045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_021872	CCT	2	6	1286274	1286279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_021872	CAT	2	6	1286296	1286301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_021872	GAAAA	2	10	1286374	1286383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_021872	A	6	6	1286386	1286391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021872	ATC	2	6	1286464	1286469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_021872	ATT	2	6	1286515	1286520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021872	AAT	2	6	1286563	1286568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_021872	ATT	2	6	1286581	1286586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021872	ATT	2	6	1286647	1286652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_021872	ATT	2	6	1286713	1286718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021872	AGT	2	6	1286747	1286752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021872	CCT	2	6	1286763	1286768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_021872	ATT	2	6	1286779	1286784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021872	ATT	2	6	1286807	1286812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_021872	AAT	2	6	1288728	1288733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021872	T	7	7	1288753	1288759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021872	A	7	7	1288783	1288789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021872	GT	3	6	1288810	1288815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021872	TTG	2	6	1290287	1290292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021872	A	6	6	1290297	1290302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_021872	TAAT	2	8	1290312	1290319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021872	ACT	2	6	1290337	1290342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_021872	ATT	2	6	1290347	1290352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_021872	TC	3	6	1290475	1290480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_021872	TC	3	6	1290523	1290528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_021872	TC	3	6	1290689	1290694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_021872	TAT	2	6	1290714	1290719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_021872	TTA	2	6	1290815	1290820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_021872	ATC	2	6	1290835	1290840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_021872	T	6	6	1290863	1290868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_021872	CTT	2	6	1291084	1291089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_021872	T	6	6	1291219	1291224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021872	GCT	2	6	1291253	1291258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_021872	CCA	2	6	1291274	1291279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_021872	CAC	2	6	1291362	1291367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_021872	TA	3	6	1291374	1291379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021872	CTT	2	6	1291380	1291385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_021872	TCA	2	6	1291439	1291444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4541	NC_021872	A	6	6	1291535	1291540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021872	T	6	6	1291588	1291593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_021872	TA	3	6	1291638	1291643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_021872	ATG	2	6	1291684	1291689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_021872	TGA	2	6	1291739	1291744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021872	AAT	2	6	1291765	1291770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_021872	AACT	2	8	1291834	1291841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4548	NC_021872	TTA	2	6	1291901	1291906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_021872	GTTTAC	2	12	1291908	1291919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4550	NC_021872	TTA	2	6	1292003	1292008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_021872	GTC	2	6	1292013	1292018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_021872	ATC	2	6	1292044	1292049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_021872	CATA	2	8	1292085	1292092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_021872	TCA	2	6	1292102	1292107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_021872	ATTG	2	8	1292110	1292117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_021872	ATC	2	6	1292212	1292217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_021872	T	6	6	1292250	1292255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_021872	GAGC	2	8	1292300	1292307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_021872	ATC	2	6	1292356	1292361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_021872	TTTTG	2	10	1292391	1292400	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021872	GAC	2	6	1292493	1292498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_021872	AAT	2	6	1292542	1292547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_021872	T	7	7	1292633	1292639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_021872	AAT	2	6	1292716	1292721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021872	ATC	2	6	1292731	1292736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_021872	ATC	2	6	1292749	1292754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_021872	T	6	6	1292775	1292780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021872	AT	3	6	1292789	1292794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_021872	AAT	2	6	1292877	1292882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021872	TTA	2	6	1292883	1292888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_021872	TGC	2	6	1292912	1292917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4574	NC_021872	TCTA	2	8	1293109	1293116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4575	NC_021872	GTT	2	6	1293211	1293216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4578	NC_021872	ATA	2	6	1293330	1293335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_021872	AAT	2	6	1293351	1293356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_021872	T	6	6	1293455	1293460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4584	NC_021872	T	6	6	1293586	1293591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_021872	TAA	2	6	1293618	1293623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_021872	ATCA	2	8	1293654	1293661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_021872	ATA	2	6	1293730	1293735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_021872	TCA	2	6	1293757	1293762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4590	NC_021872	CTA	2	6	1293805	1293810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_021872	AGTTT	2	10	1293812	1293821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_021872	TTAT	2	8	1293916	1293923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_021872	TTA	2	6	1293937	1293942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4595	NC_021872	TTGCTT	2	12	1293972	1293983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4596	NC_021872	CTT	2	6	1293990	1293995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_021872	AATT	2	8	1294043	1294050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_021872	ATT	2	6	1294059	1294064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021872	AATC	2	8	1294115	1294122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_021872	AAG	2	6	1294198	1294203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_021872	T	6	6	1294221	1294226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_021872	TCA	2	6	1294235	1294240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_021872	TTA	2	6	1294333	1294338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021872	AT	3	6	1294399	1294404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021872	A	6	6	1294410	1294415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_021872	TAA	2	6	1294422	1294427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021872	CGA	2	6	1294456	1294461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4609	NC_021872	ACT	2	6	1294525	1294530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_021872	CCGA	2	8	1294582	1294589	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_021872	TCTT	2	8	1294621	1294628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_021872	ATC	2	6	1294630	1294635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_021872	TCC	2	6	1294640	1294645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_021872	TAGCA	2	10	1294665	1294674	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4615	NC_021872	TATC	2	8	1294698	1294705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_021872	ATG	2	6	1294731	1294736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4621	NC_021872	GTT	2	6	1295415	1295420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021872	GGA	2	6	1295464	1295469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021872	CT	3	6	1295489	1295494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_021872	TCA	2	6	1296678	1296683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_021872	TAAAA	2	10	1296707	1296716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021872	CTT	2	6	1296752	1296757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_021872	ATCA	2	8	1296768	1296775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4628	NC_021872	ATT	2	6	1296787	1296792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_021872	GAAG	2	8	1296800	1296807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4631	NC_021872	TCCCA	2	10	1297073	1297082	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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