MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 7488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021872	AGG	2	6	25	30	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021872	ATT	2	6	33	38	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021872	TAA	2	6	1376	1381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021872	CTA	3	9	1470	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021872	AT	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021872	TA	3	6	1508	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021872	TA	3	6	2689	2694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021872	A	6	6	2703	2708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021872	GTTTT	2	10	2722	2731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021872	TAA	2	6	2765	2770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021872	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021872	TAA	2	6	2866	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021872	AAT	2	6	2887	2892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021872	TGT	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021872	A	6	6	6253	6258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021872	GGA	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021872	TA	4	8	8807	8814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021872	TTC	2	6	8927	8932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021872	AGG	2	6	8962	8967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021872	TAAAG	2	10	9287	9296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021872	AG	3	6	9295	9300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021872	AGG	2	6	9895	9900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021872	A	6	6	10159	10164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021872	TAA	2	6	10165	10170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021872	TAT	2	6	10197	10202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021872	ACCAA	2	10	10387	10396	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_021872	TGATA	2	10	11857	11866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021872	TAA	2	6	11879	11884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021872	AGG	2	6	11900	11905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021872	A	7	7	15893	15899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021872	GAG	2	6	15920	15925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021872	T	6	6	17491	17496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021872	TTA	2	6	17507	17512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021872	GA	3	6	17523	17528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021872	ATG	2	6	17535	17540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021872	A	6	6	18461	18466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021872	CTC	2	6	19056	19061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021872	TAG	2	6	19087	19092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021872	TA	3	6	19125	19130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021872	A	6	6	19154	19159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021872	ATT	2	6	19163	19168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021872	ATTC	2	8	19178	19185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021872	A	6	6	19186	19191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021872	TA	3	6	19207	19212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021872	GCA	2	6	19243	19248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021872	A	7	7	19385	19391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021872	ACC	2	6	19393	19398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021872	T	6	6	19414	19419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021872	ATG	2	6	19422	19427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021872	ACA	2	6	19508	19513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021872	ATA	3	9	19517	19525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021872	ATTT	2	8	19561	19568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021872	TAAAAT	2	12	19623	19634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021872	TCA	3	9	20123	20131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021872	AGG	2	6	20156	20161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021872	AAGAT	2	10	21908	21917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021872	A	6	6	21943	21948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021872	AT	3	6	22179	22184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021872	TAAT	2	8	22198	22205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021872	GAG	2	6	26952	26957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021872	T	6	6	29186	29191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021872	TTAA	2	8	29205	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021872	AATTA	2	10	29847	29856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021872	GTA	2	6	29889	29894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021872	GCT	2	6	29936	29941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021872	T	6	6	29986	29991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021872	AAT	2	6	31069	31074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021872	AGA	2	6	31087	31092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021872	TGT	2	6	31138	31143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021872	ATA	2	6	31166	31171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021872	TAAC	2	8	31203	31210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021872	ATT	2	6	31255	31260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021872	TG	3	6	31286	31291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021872	TA	3	6	31314	31319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021872	CAA	2	6	31327	31332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021872	ATT	2	6	31359	31364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021872	CAA	2	6	31424	31429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021872	A	6	6	31428	31433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021872	A	7	7	31457	31463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021872	ATT	3	9	32022	32030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021872	TCG	2	6	32033	32038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021872	GATTT	2	10	32089	32098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021872	A	6	6	32389	32394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021872	AGG	2	6	32418	32423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021872	ATT	2	6	32988	32993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021872	ATT	3	9	33071	33079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021872	A	6	6	33101	33106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021872	TAAA	2	8	34364	34371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021872	GCCA	2	8	34425	34432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021872	T	7	7	34483	34489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021872	T	7	7	34518	34524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021872	TAA	2	6	34561	34566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021872	ATT	2	6	34569	34574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021872	AG	3	6	34578	34583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021872	GA	3	6	35498	35503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021872	T	7	7	35543	35549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021872	TAT	2	6	35557	35562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021872	CAT	2	6	37177	37182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021872	ACCTA	2	10	37196	37205	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_021872	CTT	2	6	37244	37249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021872	A	7	7	37252	37258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021872	AAATT	2	10	37283	37292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021872	AATTA	2	10	37315	37324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021872	A	6	6	37361	37366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021872	ATG	2	6	37380	37385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021872	TTTA	2	8	37451	37458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021872	AGG	2	6	37459	37464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021872	ACG	2	6	38857	38862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021872	T	6	6	42038	42043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021872	T	6	6	42052	42057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021872	A	6	6	42097	42102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021872	TAA	2	6	42120	42125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021872	T	6	6	42864	42869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021872	TA	3	6	42920	42925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021872	GAA	2	6	44694	44699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021872	AAT	2	6	46759	46764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021872	T	6	6	46920	46925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021872	TC	3	6	47203	47208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021872	T	6	6	47217	47222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021872	CCT	2	6	47663	47668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021872	TCC	2	6	49914	49919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021872	TA	3	6	49920	49925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021872	A	6	6	49940	49945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021872	CTT	2	6	49980	49985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021872	CTG	2	6	50062	50067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021872	AGA	2	6	50095	50100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021872	TCA	2	6	50134	50139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021872	TCC	2	6	50145	50150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_021872	ATT	2	6	50164	50169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021872	AAT	2	6	50170	50175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021872	ATT	2	6	50180	50185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021872	T	6	6	50184	50189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021872	TTGA	2	8	50205	50212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021872	ATTA	2	8	50221	50228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021872	ATT	2	6	50233	50238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021872	TGA	2	6	50242	50247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021872	ATA	2	6	50259	50264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021872	ATT	2	6	50284	50289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021872	TTTAA	2	10	50298	50307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021872	T	8	8	50329	50336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021872	T	7	7	50338	50344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021872	T	6	6	50351	50356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021872	ATA	2	6	50381	50386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021872	ATATT	2	10	50721	50730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021872	GAG	2	6	50736	50741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021872	ATTAA	2	10	52998	53007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021872	A	6	6	53009	53014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021872	T	6	6	53049	53054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021872	GGA	2	6	54260	54265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021872	A	7	7	54284	54290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_021872	T	7	7	98422	98428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021872	CAA	2	6	98486	98491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_021872	CATAC	2	10	98502	98511	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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473	NC_021872	CTT	2	6	145829	145834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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