MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 8516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021839	AT	3	6	1013090	1013095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021839	TGA	2	6	1013195	1013200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021839	ACA	2	6	1013211	1013216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_021839	GAA	2	6	1013219	1013224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021839	AATT	2	8	1013239	1013246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021839	CG	3	6	1013310	1013315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_021839	AAG	2	6	1013341	1013346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021839	ACA	2	6	1013427	1013432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_021839	TTAA	2	8	1013460	1013467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021839	AAC	2	6	1013538	1013543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_021839	ACA	2	6	1013584	1013589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_021839	A	8	8	1013742	1013749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021839	CAT	2	6	1013761	1013766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_021839	AATG	2	8	1014026	1014033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021839	ACC	2	6	1014041	1014046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_021839	AGCC	2	8	1014081	1014088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_021839	A	7	7	1014161	1014167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021839	CTG	2	6	1014182	1014187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_021839	T	6	6	1014228	1014233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021839	A	7	7	1014281	1014287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021839	AGG	2	6	1014297	1014302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021839	T	6	6	1014303	1014308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021839	A	6	6	1015672	1015677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021839	T	7	7	1015702	1015708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021839	TAA	2	6	1016356	1016361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_021839	CTA	2	6	1016387	1016392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_021839	AAAG	2	8	1016404	1016411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021839	TCC	2	6	1016856	1016861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_021839	TAT	2	6	1016903	1016908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021839	AAG	2	6	1016938	1016943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021839	ACTTG	2	10	1016950	1016959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3032	NC_021839	GGA	2	6	1017002	1017007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021839	TCC	2	6	1017910	1017915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_021839	AGGA	2	8	1017945	1017952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021839	ACAA	2	8	1017963	1017970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_021839	CAT	2	6	1017978	1017983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021839	A	6	6	1017989	1017994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021839	ATG	2	6	1018001	1018006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021839	AAAGA	2	10	1019445	1019454	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021839	T	6	6	1019741	1019746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021839	T	7	7	1019776	1019782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_021839	GCA	2	6	1019802	1019807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_021839	TGC	2	6	1019832	1019837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_021839	A	6	6	1019871	1019876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021839	ATT	2	6	1020387	1020392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021839	CCTA	2	8	1021874	1021881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_021839	TAT	2	6	1021912	1021917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021839	ATT	2	6	1021954	1021959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021839	AT	3	6	1021964	1021969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_021839	A	6	6	1021993	1021998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021839	AGG	2	6	1022049	1022054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021839	CAAT	2	8	1022739	1022746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_021839	AAT	2	6	1022980	1022985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021839	ATT	2	6	1022992	1022997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_021839	GA	3	6	1023010	1023015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021839	A	6	6	1023988	1023993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021839	A	6	6	1024030	1024035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_021839	TAAGTA	2	12	1024056	1024067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021839	TCC	2	6	1024184	1024189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_021839	CCT	2	6	1024347	1024352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_021839	TAC	2	6	1024380	1024385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_021839	TAA	2	6	1024417	1024422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021839	TCC	2	6	1028389	1028394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_021839	T	6	6	1028395	1028400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021839	TA	3	6	1028407	1028412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021839	GTT	2	6	1028416	1028421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_021839	TACTA	2	10	1028428	1028437	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3068	NC_021839	AAT	2	6	1028440	1028445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021839	TAAAA	2	10	1028473	1028482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021839	AAG	2	6	1028483	1028488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021839	GAG	2	6	1028489	1028494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021839	TAT	2	6	1029487	1029492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021839	A	7	7	1029578	1029584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021839	GGT	2	6	1029613	1029618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021839	TAA	3	9	1029623	1029631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_021839	GGGA	2	8	1029640	1029647	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021839	CTT	2	6	1030586	1030591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_021839	TAA	2	6	1032672	1032677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021839	ATA	2	6	1032679	1032684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021839	ATTA	2	8	1033976	1033983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_021839	TTTG	2	8	1034429	1034436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021839	TAT	2	6	1034483	1034488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021839	TGT	2	6	1034513	1034518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021839	AAC	2	6	1034531	1034536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_021839	TATG	2	8	1034837	1034844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021839	ATTTA	2	10	1034846	1034855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021839	CA	3	6	1034865	1034870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_021839	TG	3	6	1034874	1034879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021839	AGG	2	6	1035441	1035446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021839	T	7	7	1036167	1036173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021839	A	6	6	1036190	1036195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021839	GAAT	2	8	1036270	1036277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021839	TAAA	2	8	1036345	1036352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021839	TTA	3	9	1037355	1037363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021839	GAT	2	6	1037413	1037418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021839	TAA	2	6	1038731	1038736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021839	A	6	6	1038744	1038749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021839	G	6	6	1038751	1038756	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021839	GAT	2	6	1038802	1038807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021839	TAA	2	6	1038817	1038822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021839	ATT	2	6	1038832	1038837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021839	AC	3	6	1038839	1038844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_021839	A	6	6	1038855	1038860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021839	CGT	2	6	1040172	1040177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_021839	GC	3	6	1040183	1040188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_021839	T	6	6	1040190	1040195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021839	TATTAA	2	12	1040249	1040260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021839	AGG	2	6	1040867	1040872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021839	T	6	6	1041501	1041506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021839	TAA	2	6	1041513	1041518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021839	TA	3	6	1042098	1042103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021839	T	7	7	1043794	1043800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021839	A	6	6	1043831	1043836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021839	T	6	6	1044760	1044765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021839	T	6	6	1044791	1044796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021839	AAAG	2	8	1044811	1044818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021839	A	6	6	1044834	1044839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021839	TAC	2	6	1044891	1044896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_021839	ATA	2	6	1045007	1045012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_021839	TTG	2	6	1047134	1047139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021839	GAG	2	6	1047143	1047148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021839	TAA	2	6	1048470	1048475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021839	TCA	2	6	1048502	1048507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_021839	AG	3	6	1048530	1048535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021839	GTG	2	6	1048542	1048547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021839	TTTC	2	8	1048559	1048566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_021839	TAA	2	6	1048593	1048598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021839	T	6	6	1048606	1048611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021839	ATTG	2	8	1048637	1048644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021839	ATT	2	6	1048686	1048691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_021839	GGA	2	6	1049651	1049656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021839	AGG	2	6	1051636	1051641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3134	NC_021839	TG	3	6	1052511	1052516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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