MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 8516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	GCG	2	6	24	29	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021839	AAG	2	6	54	59	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021839	CTT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021839	AAAG	2	8	101	108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021839	CGG	2	6	198	203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021839	GGA	2	6	230	235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021839	AGT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021839	TTG	2	6	415	420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021839	AAGGT	2	10	528	537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021839	TACT	2	8	540	547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021839	CACG	2	8	561	568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021839	TC	3	6	634	639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021839	ACC	2	6	813	818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021839	AT	3	6	834	839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021839	AGC	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021839	TGG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021839	AAG	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021839	TAGGCG	2	12	1187	1198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021839	ACA	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021839	AGTG	2	8	1300	1307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021839	GGAA	2	8	1354	1361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021839	AGT	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021839	GAG	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021839	GA	3	6	1475	1480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021839	GA	3	6	1554	1559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021839	CGG	2	6	1712	1717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021839	GA	3	6	1810	1815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021839	TAGG	2	8	1928	1935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021839	GAG	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021839	TGG	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021839	TAC	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021839	CCT	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021839	ATGG	2	8	2111	2118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021839	GGT	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021839	TCG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021839	CGT	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021839	GAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021839	AC	3	6	2485	2490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021839	GTT	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021839	TG	3	6	2536	2541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021839	C	6	6	2577	2582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_021839	TTC	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021839	GAT	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021839	ATCG	2	8	2689	2696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021839	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021839	TCT	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021839	GA	3	6	2756	2761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021839	CAA	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021839	ATT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021839	T	7	7	2931	2937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021839	ATAA	2	8	2949	2956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021839	TAGG	2	8	2965	2972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021839	AGTCAA	2	12	3001	3012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021839	A	6	6	3021	3026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021839	TGA	2	6	3510	3515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021839	AGG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021839	ACA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021839	T	6	6	7582	7587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021839	A	7	7	7611	7617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021839	TGA	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021839	GAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021839	TA	5	10	9162	9171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021839	AGG	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021839	AGG	2	6	10278	10283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021839	AAT	2	6	11468	11473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021839	TGAA	2	8	12954	12961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021839	T	6	6	12987	12992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021839	AT	3	6	12999	13004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021839	TGA	2	6	13060	13065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021839	GAA	2	6	13069	13074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021839	AG	4	8	13095	13102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021839	T	7	7	13289	13295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021839	A	6	6	13315	13320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021839	AGG	2	6	13337	13342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021839	CAA	2	6	13343	13348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021839	AGA	2	6	17115	17120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021839	TTATAT	2	12	17787	17798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021839	T	6	6	17815	17820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021839	GGCAT	2	10	17821	17830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021839	T	6	6	18274	18279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021839	AGG	2	6	18298	18303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021839	GGC	2	6	18306	18311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021839	TGC	2	6	18322	18327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021839	ATT	2	6	18888	18893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021839	GTT	2	6	18901	18906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021839	TTA	2	6	18907	18912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021839	AAT	2	6	19397	19402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021839	AT	3	6	19431	19436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021839	AGG	2	6	19509	19514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021839	GT	3	6	19951	19956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021839	AGG	2	6	19975	19980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021839	T	6	6	20855	20860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021839	TTG	2	6	20904	20909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021839	ACAA	2	8	21450	21457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021839	A	6	6	21474	21479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021839	TAT	2	6	21483	21488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021839	GGA	2	6	21490	21495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021839	T	6	6	21904	21909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021839	AAGG	2	8	21993	22000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021839	A	7	7	22704	22710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021839	AGA	2	6	22725	22730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021839	TCTT	2	8	22812	22819	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021839	T	9	9	22831	22839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021839	AAAT	2	8	22846	22853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021839	AAG	2	6	22858	22863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021839	AGC	2	6	24149	24154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021839	AT	3	6	24155	24160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021839	TGC	2	6	24168	24173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021839	TTC	2	6	24174	24179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021839	TGT	2	6	24184	24189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021839	ATA	2	6	24239	24244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021839	TC	3	6	25282	25287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021839	TTA	2	6	25288	25293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021839	ATT	2	6	25333	25338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021839	AT	3	6	25345	25350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021839	T	6	6	32301	32306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021839	CTT	2	6	32342	32347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021839	A	6	6	32432	32437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021839	T	6	6	32513	32518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021839	AATT	2	8	32519	32526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021839	T	6	6	36144	36149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021839	AGG	2	6	36253	36258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021839	CG	3	6	39897	39902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021839	T	7	7	39911	39917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021839	AGTGA	2	10	39937	39946	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021839	TAAAA	2	10	40515	40524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021839	A	6	6	40521	40526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021839	AGA	2	6	40529	40534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021839	CGAA	2	8	40551	40558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021839	T	7	7	42053	42059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021839	CACT	2	8	42089	42096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021839	A	7	7	42101	42107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021839	A	6	6	42153	42158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021839	TCT	2	6	42168	42173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021839	ATT	2	6	42180	42185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021839	ATG	2	6	42250	42255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021839	T	6	6	43806	43811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021839	A	6	6	43825	43830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021839	TAT	2	6	43838	43843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021839	ATTT	2	8	43849	43856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021839	TAAA	2	8	43879	43886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021839	GA	4	8	43889	43896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021839	TAA	2	6	45591	45596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021839	TAA	2	6	45668	45673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021839	AAT	2	6	45674	45679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021839	A	6	6	45706	45711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021839	AAT	2	6	45715	45720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021839	A	6	6	47449	47454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021839	T	7	7	47492	47498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021839	CTA	2	6	47572	47577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021839	AC	3	6	47607	47612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_021839	TTTG	2	8	50488	50495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_021839	AGG	2	6	50560	50565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_021839	CTT	2	6	55859	55864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_021839	CTA	2	6	57984	57989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_021839	CAT	2	6	58894	58899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_021839	T	6	6	60334	60339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_021839	T	7	7	144925	144931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_021839	ATTG	2	8	151736	151743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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