MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 8604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021837	ATA	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021837	CGC	2	6	61	66	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021837	CAAC	2	8	81	88	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021837	ACC	2	6	169	174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021837	ATA	2	6	230	235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021837	TCC	2	6	287	292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021837	TTC	2	6	344	349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021837	TAA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021837	CTG	2	6	379	384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021837	TTG	2	6	550	555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021837	CAT	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021837	TTA	2	6	639	644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021837	CAAAA	2	10	700	709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021837	A	7	7	706	712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021837	AGT	2	6	2193	2198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021837	GCTAT	2	10	2271	2280	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021837	T	6	6	2303	2308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021837	AAATT	2	10	2725	2734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021837	CAAA	2	8	2742	2749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021837	TCCA	2	8	2800	2807	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021837	A	6	6	2942	2947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021837	ATT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021837	TTC	2	6	3840	3845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021837	GGA	2	6	3881	3886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021837	TCT	2	6	5343	5348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021837	CCT	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021837	ATTC	2	8	5870	5877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021837	AAT	2	6	5897	5902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021837	TTTC	2	8	7761	7768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021837	ATT	2	6	7847	7852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021837	T	6	6	7899	7904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021837	GAAA	2	8	7913	7920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021837	TTTA	2	8	7995	8002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021837	A	6	6	8007	8012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021837	TCT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021837	TAA	2	6	8019	8024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021837	A	6	6	8040	8045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021837	TTAT	2	8	8074	8081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021837	A	6	6	8947	8952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021837	TAT	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021837	A	6	6	9718	9723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021837	TAA	2	6	9732	9737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021837	TAG	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021837	TCC	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021837	TAT	2	6	10356	10361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021837	A	6	6	10425	10430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021837	ATT	2	6	10486	10491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021837	A	7	7	10495	10501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021837	GTTT	2	8	10521	10528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021837	T	6	6	10526	10531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021837	ATTT	2	8	10535	10542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021837	AAT	2	6	10549	10554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021837	TGC	2	6	10647	10652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021837	TAC	2	6	10691	10696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021837	TTG	2	6	10703	10708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021837	CAA	2	6	10783	10788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021837	ATTT	2	8	10836	10843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021837	CCT	2	6	10844	10849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021837	TTTA	2	8	10852	10859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021837	AG	3	6	11103	11108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021837	TCT	2	6	11215	11220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021837	A	7	7	11262	11268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021837	CTT	2	6	11321	11326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021837	A	7	7	11397	11403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021837	CTA	2	6	11412	11417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021837	CCG	2	6	12389	12394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021837	TCT	2	6	12403	12408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021837	TTA	3	9	12411	12419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021837	TA	3	6	12418	12423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021837	TGT	2	6	12436	12441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021837	CTA	2	6	12442	12447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021837	CCCT	2	8	13794	13801	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_021837	TAT	2	6	15805	15810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021837	GCT	2	6	16716	16721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021837	C	6	6	19398	19403	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_021837	TCA	2	6	19452	19457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021837	TAG	2	6	21391	21396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021837	ATATT	2	10	21397	21406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021837	TAG	2	6	21427	21432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021837	GCTA	2	8	21442	21449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021837	T	6	6	23012	23017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021837	CCT	2	6	23257	23262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021837	TAA	2	6	23282	23287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021837	TAAC	2	8	23289	23296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021837	TATAA	2	10	23302	23311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021837	T	6	6	24453	24458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021837	TTA	2	6	25095	25100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021837	A	7	7	25105	25111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021837	T	6	6	25132	25137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021837	T	7	7	25148	25154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021837	GA	3	6	25157	25162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021837	TAC	2	6	25196	25201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021837	TTA	2	6	25224	25229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021837	A	7	7	25229	25235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021837	TAA	2	6	27035	27040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021837	CTA	2	6	27054	27059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021837	A	6	6	28010	28015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021837	TCA	2	6	28031	28036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021837	T	6	6	28051	28056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021837	TA	3	6	29815	29820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021837	CCT	2	6	31865	31870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021837	ATT	2	6	31902	31907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021837	AAT	2	6	31915	31920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021837	AAT	2	6	31955	31960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021837	T	6	6	31998	32003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021837	GAG	2	6	32042	32047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021837	CCAA	2	8	32958	32965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021837	A	8	8	33766	33773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021837	CCT	2	6	33984	33989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_021837	TACCAT	2	12	34005	34016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021837	GATTG	2	10	34672	34681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021837	TATT	2	8	34722	34729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021837	A	6	6	34745	34750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021837	TCAC	2	8	34778	34785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021837	ATTGT	2	10	35175	35184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021837	TTCC	2	8	35201	35208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021837	CAAT	2	8	35284	35291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021837	TCC	2	6	35800	35805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_021837	A	6	6	37093	37098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021837	TCC	2	6	38842	38847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021837	CGTTT	2	10	39516	39525	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021837	TAT	2	6	39593	39598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021837	TGAA	2	8	39604	39611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021837	TA	3	6	39762	39767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021837	A	6	6	39778	39783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021837	AGT	2	6	39790	39795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021837	ATTT	2	8	40215	40222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021837	TTG	2	6	40235	40240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021837	TAT	2	6	40365	40370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021837	AGG	2	6	40385	40390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021837	TTG	2	6	40420	40425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021837	ATTT	2	8	40892	40899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021837	TTG	2	6	40912	40917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021837	AAT	2	6	40929	40934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021837	TAC	2	6	40975	40980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021837	GTT	2	6	41005	41010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021837	CTA	2	6	41012	41017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021837	CATAG	2	10	41022	41031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021837	AAAAT	2	10	41186	41195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021837	TAA	2	6	41213	41218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021837	A	6	6	41291	41296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021837	GAT	2	6	41376	41381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021837	AAT	2	6	41404	41409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021837	ACC	2	6	41416	41421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_021837	CAA	2	6	41424	41429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021837	T	7	7	41496	41502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021837	AT	3	6	41563	41568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021837	A	7	7	41574	41580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021837	CATC	2	8	42625	42632	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021837	AT	3	6	42638	42643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_021837	TAT	2	6	139537	139542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_021837	TAC	2	6	139556	139561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_021837	A	7	7	139584	139590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_021837	ATCAC	2	10	139642	139651	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
442	NC_021837	A	7	7	141309	141315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_021837	T	7	7	141328	141334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_021837	ACT	2	6	141359	141364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_021837	ATT	2	6	141369	141374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_021837	ATA	2	6	141388	141393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_021837	ACA	2	6	141394	141399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_021837	ATT	2	6	142976	142981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_021837	A	7	7	143427	143433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_021837	CCT	2	6	144249	144254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
451	NC_021837	TA	3	6	144280	144285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_021837	A	7	7	144296	144302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021837	AT	3	6	144316	144321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_021837	ACA	2	6	144332	144337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_021837	A	6	6	144357	144362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_021837	TAA	2	6	144806	144811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_021837	AGG	2	6	145682	145687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_021837	GA	3	6	149396	149401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
461	NC_021837	TTA	2	6	152117	152122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_021837	A	6	6	152482	152487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_021837	AATTT	2	10	152807	152816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_021837	T	6	6	152848	152853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_021837	AAT	2	6	152948	152953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_021837	ATTT	2	8	153409	153416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_021837	T	6	6	153414	153419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_021837	TG	3	6	153440	153445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
469	NC_021837	TAT	2	6	153455	153460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_021837	TTCT	2	8	153488	153495	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
471	NC_021837	A	6	6	153509	153514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_021837	AAC	2	6	153520	153525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_021837	CTT	2	6	153794	153799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_021837	CTT	2	6	153802	153807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_021837	TATT	2	8	153824	153831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_021837	A	6	6	153832	153837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_021837	TCC	2	6	154108	154113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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480	NC_021837	AAT	2	6	154279	154284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_021837	TTG	2	6	154289	154294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
482	NC_021837	TCATT	2	10	154374	154383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
483	NC_021837	A	6	6	154403	154408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_021837	A	6	6	161241	161246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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