MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 12028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021829	AAT	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021829	ACA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021829	ATA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021829	CAT	2	6	62	67	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021829	TTA	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021829	CCA	2	6	88	93	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021829	TAGT	2	8	124	131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021829	CAT	2	6	166	171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021829	AAT	2	6	248	253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021829	T	9	9	275	283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021829	ACAA	2	8	292	299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021829	TAA	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021829	ATGCAC	2	12	1964	1975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021829	GCA	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021829	GAT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021829	CATGTA	2	12	2056	2067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021829	ATT	2	6	2136	2141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021829	TGA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021829	ATTC	2	8	2172	2179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021829	CCT	2	6	2185	2190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021829	T	6	6	2196	2201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021829	ATAA	2	8	2266	2273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021829	T	6	6	2304	2309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021829	ATT	2	6	2311	2316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021829	AT	3	6	2325	2330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021829	ATA	2	6	2342	2347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021829	TA	3	6	2377	2382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021829	ATA	2	6	2422	2427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021829	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021829	A	6	6	2450	2455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021829	AAT	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021829	T	6	6	2491	2496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021829	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021829	A	7	7	2559	2565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021829	A	9	9	2590	2598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021829	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021829	A	6	6	2653	2658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021829	CGA	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021829	CGT	2	6	2675	2680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021829	TCA	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021829	TCC	2	6	3081	3086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021829	ATT	2	6	3103	3108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021829	AGG	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021829	ATT	2	6	3205	3210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021829	AAT	2	6	3212	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021829	A	7	7	3225	3231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021829	CAT	2	6	3247	3252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021829	TTA	2	6	3348	3353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021829	GAT	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021829	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021829	ATGC	2	8	4214	4221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021829	TTA	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021829	TAT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021829	GCTA	2	8	4258	4265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021829	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021829	CAT	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021829	CCTC	2	8	5031	5038	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_021829	AAT	2	6	5057	5062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021829	GGT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021829	ATTCA	2	10	5418	5427	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021829	A	6	6	5430	5435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021829	T	6	6	5454	5459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021829	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021829	TAT	2	6	5509	5514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021829	TA	3	6	8813	8818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021829	CA	3	6	8825	8830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021829	ATT	2	6	8845	8850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021829	ACA	2	6	8928	8933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021829	ATA	2	6	8949	8954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021829	TTC	2	6	10601	10606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021829	AATTT	2	10	10613	10622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021829	CAA	2	6	10650	10655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021829	TGCT	2	8	10722	10729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021829	ATA	2	6	10756	10761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021829	AGA	2	6	10765	10770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021829	TCC	2	6	12370	12375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_021829	TAAAC	2	10	12394	12403	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021829	A	8	8	13027	13034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021829	ATT	2	6	13071	13076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021829	AATG	2	8	13079	13086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021829	TAC	2	6	13124	13129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021829	ATA	2	6	13131	13136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021829	TCA	2	6	13187	13192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021829	ACC	2	6	14777	14782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021829	AAT	2	6	14824	14829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021829	TCT	2	6	14862	14867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021829	A	6	6	15322	15327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021829	TTG	2	6	15356	15361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021829	TCT	2	6	18017	18022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021829	TTA	2	6	18049	18054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021829	ATA	3	9	18062	18070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021829	CAC	2	6	18085	18090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021829	TAA	2	6	18092	18097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021829	CTTT	2	8	18528	18535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021829	AGT	2	6	18536	18541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021829	CAC	2	6	19739	19744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021829	CAAA	2	8	22377	22384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021829	T	6	6	24173	24178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021829	AAG	2	6	24239	24244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021829	TTAA	2	8	24249	24256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021829	CAT	2	6	24273	24278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021829	ATT	2	6	24366	24371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021829	T	6	6	25298	25303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021829	AT	3	6	28666	28671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021829	ACA	2	6	31836	31841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021829	AATT	2	8	31985	31992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021829	AT	3	6	32012	32017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021829	ATA	2	6	32036	32041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021829	ATT	2	6	34119	34124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021829	A	8	8	36536	36543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021829	TAT	2	6	36551	36556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021829	AAC	2	6	36557	36562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021829	CTT	2	6	36619	36624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021829	TAAA	2	8	36631	36638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021829	AGAT	2	8	36649	36656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021829	T	6	6	36669	36674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021829	TAC	2	6	36712	36717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021829	TGT	2	6	36730	36735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021829	TTC	2	6	36739	36744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021829	TATT	2	8	36851	36858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021829	ATTAGG	2	12	36862	36873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021829	T	7	7	36879	36885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021829	GAG	2	6	36888	36893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021829	GTT	2	6	36944	36949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021829	TCA	2	6	36970	36975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021829	CTT	2	6	36989	36994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021829	TC	3	6	37007	37012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021829	AAT	2	6	37035	37040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021829	CA	3	6	37046	37051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021829	AGTG	2	8	37069	37076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021829	TCA	2	6	37171	37176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021829	TAA	2	6	37265	37270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021829	ATA	2	6	37294	37299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021829	CATG	2	8	37337	37344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021829	AAG	2	6	37412	37417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021829	GGA	2	6	37450	37455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021829	ATA	2	6	37468	37473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021829	CAT	2	6	37529	37534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021829	T	6	6	37577	37582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021829	ATTT	2	8	37619	37626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021829	CTT	2	6	38509	38514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021829	ATA	2	6	38523	38528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021829	TAA	2	6	38535	38540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021829	CTC	2	6	38573	38578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_021829	TTGT	2	8	38599	38606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021829	ATT	2	6	38607	38612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021829	GTC	2	6	38614	38619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021829	TCT	2	6	38652	38657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021829	TA	3	6	38663	38668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_021829	ATAGA	2	10	111869	111878	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_021829	AGG	2	6	112941	112946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_021829	ATA	2	6	116655	116660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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