MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 6448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021235	ACCTT	2	10	1209804	1209813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4002	NC_021235	TAT	2	6	1209823	1209828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021235	TAA	2	6	1209866	1209871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021235	TAA	2	6	1209917	1209922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021235	TTAG	2	8	1209934	1209941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021235	TTG	2	6	1209956	1209961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021235	TTAC	2	8	1209995	1210002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_021235	TAA	2	6	1210046	1210051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021235	T	8	8	1210055	1210062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021235	ATCA	2	8	1210116	1210123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_021235	CCA	2	6	1210130	1210135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_021235	GAA	2	6	1212371	1212376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_021235	CACC	2	8	1212418	1212425	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4014	NC_021235	ACC	2	6	1212427	1212432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_021235	TGC	2	6	1212522	1212527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_021235	GGA	2	6	1212555	1212560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021235	AAC	2	6	1213792	1213797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_021235	TTAA	2	8	1213801	1213808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021235	TTTA	2	8	1213849	1213856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021235	CTAA	2	8	1213869	1213876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_021235	CCG	2	6	1213905	1213910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_021235	GCT	2	6	1213929	1213934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_021235	TTAT	2	8	1213942	1213949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021235	AT	3	6	1213986	1213991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021235	TAAC	2	8	1214022	1214029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_021235	GGA	2	6	1214034	1214039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021235	GGGA	2	8	1215934	1215941	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021235	GCC	2	6	1215964	1215969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_021235	CTT	2	6	1216852	1216857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_021235	A	6	6	1216880	1216885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021235	TCC	2	6	1218002	1218007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_021235	ATT	2	6	1218027	1218032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021235	TTA	2	6	1218036	1218041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021235	A	6	6	1218068	1218073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021235	TCC	2	6	1222529	1222534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_021235	TCC	2	6	1223339	1223344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_021235	TAT	2	6	1223355	1223360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021235	TA	3	6	1223369	1223374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021235	TTA	2	6	1223397	1223402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021235	TAAAA	2	10	1223435	1223444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021235	TAA	2	6	1223483	1223488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021235	ACTA	2	8	1223493	1223500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_021235	TAT	2	6	1223525	1223530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021235	AT	3	6	1223529	1223534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021235	AAT	2	6	1223541	1223546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021235	AGG	2	6	1223553	1223558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021235	A	6	6	1225951	1225956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021235	TCGC	2	8	1225981	1225988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_021235	ATGTT	2	10	1225998	1226007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021235	TTAT	2	8	1226937	1226944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021235	TAA	2	6	1230252	1230257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021235	CAC	2	6	1230331	1230336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_021235	A	6	6	1230338	1230343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_021235	TCC	2	6	1236398	1236403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_021235	A	7	7	1236412	1236418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021235	GA	3	6	1236476	1236481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021235	CCA	2	6	1236487	1236492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_021235	CGT	3	9	1236549	1236557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_021235	C	6	6	1236808	1236813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4060	NC_021235	A	6	6	1236825	1236830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021235	ACC	2	6	1236834	1236839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_021235	ATT	2	6	1238452	1238457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021235	A	7	7	1238528	1238534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_021235	TAATT	2	10	1238595	1238604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021235	T	6	6	1238707	1238712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021235	TTA	2	6	1238714	1238719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021235	AGG	2	6	1238721	1238726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021235	AGG	2	6	1239590	1239595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_021235	A	7	7	1240475	1240481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021235	GAC	2	6	1240488	1240493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021235	T	6	6	1240506	1240511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021235	CACT	2	8	1240556	1240563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_021235	TCC	2	6	1241429	1241434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_021235	A	6	6	1241474	1241479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021235	CAA	2	6	1241540	1241545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021235	G	6	6	1241554	1241559	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021235	ATTA	2	8	1241561	1241568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021235	A	7	7	1241617	1241623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021235	GTAAT	2	10	1241629	1241638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021235	AATT	2	8	1241668	1241675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021235	ACC	2	6	1241713	1241718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_021235	T	7	7	1243173	1243179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021235	GGA	2	6	1243188	1243193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021235	CAG	2	6	1243509	1243514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_021235	CCA	2	6	1243531	1243536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_021235	A	6	6	1246538	1246543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021235	A	6	6	1246597	1246602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021235	GCC	2	6	1246798	1246803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_021235	CTT	2	6	1246833	1246838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_021235	GTC	2	6	1247326	1247331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_021235	CCT	2	6	1248646	1248651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_021235	TGATA	2	10	1248656	1248665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021235	ATG	2	6	1248676	1248681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021235	ATCC	2	8	1249172	1249179	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_021235	ATTA	2	8	1249211	1249218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021235	AAG	2	6	1249219	1249224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021235	GTT	2	6	1249231	1249236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_021235	T	6	6	1249235	1249240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021235	AAT	2	6	1249245	1249250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021235	TGAT	2	8	1249301	1249308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021235	CCA	2	6	1249321	1249326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_021235	AAG	2	6	1249336	1249341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021235	ATA	2	6	1249377	1249382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021235	TGGG	2	8	1251437	1251444	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021235	A	7	7	1251462	1251468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021235	TTA	2	6	1251500	1251505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021235	CAAC	2	8	1251535	1251542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_021235	GAA	2	6	1251569	1251574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021235	AGG	2	6	1251626	1251631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021235	CACT	2	8	1251640	1251647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_021235	TAGG	2	8	1253625	1253632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021235	A	7	7	1253640	1253646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021235	AGCC	2	8	1253901	1253908	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_021235	ATC	2	6	1257322	1257327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_021235	CTC	2	6	1259547	1259552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_021235	TAT	2	6	1259563	1259568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021235	ACC	2	6	1259580	1259585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_021235	A	7	7	1259591	1259597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021235	ACC	2	6	1259666	1259671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_021235	TCCT	2	8	1259694	1259701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_021235	TCC	2	6	1259984	1259989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_021235	ATT	2	6	1260048	1260053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021235	CCTT	2	8	1260955	1260962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_021235	ACA	2	6	1261036	1261041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_021235	ATA	2	6	1261048	1261053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021235	TCC	2	6	1261078	1261083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_021235	TGG	2	6	1261095	1261100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021235	T	6	6	1261133	1261138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021235	ACTTT	2	10	1263928	1263937	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4130	NC_021235	TTCCC	2	10	1263940	1263949	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4131	NC_021235	ATTA	2	8	1263979	1263986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_021235	GAT	2	6	1263997	1264002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021235	T	7	7	1264002	1264008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021235	CCG	2	6	1265417	1265422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4142	NC_021235	ATTT	2	8	1267150	1267157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_021235	ATT	2	6	1299643	1299648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_021235	ACA	2	6	1300424	1300429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_021235	TG	3	6	1300478	1300483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_021235	TCCC	2	8	1304086	1304093	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4264	NC_021235	TCATC	2	10	1304094	1304103	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4266	NC_021235	TAG	2	6	1306365	1306370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_021235	TGT	2	6	1306459	1306464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4270	NC_021235	TTTAC	2	10	1307108	1307117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4280	NC_021235	TTAA	2	8	1311542	1311549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4281	NC_021235	ATT	3	9	1311561	1311569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4287	NC_021235	TAT	2	6	1314473	1314478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4288	NC_021235	A	7	7	1315135	1315141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4301	NC_021235	GTG	2	6	1320461	1320466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4380	NC_021235	CAGTAA	2	12	1352379	1352390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4381	NC_021235	CTG	2	6	1352431	1352436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4382	NC_021235	GCA	2	6	1352505	1352510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4383	NC_021235	TAT	2	6	1362013	1362018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_021235	ATTTC	2	10	1362036	1362045	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4385	NC_021235	TAC	2	6	1362056	1362061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4386	NC_021235	A	7	7	1362117	1362123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_021235	A	8	8	1362138	1362145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_021235	TAG	2	6	1362172	1362177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_021235	TTTC	2	8	1362562	1362569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4390	NC_021235	CATT	2	8	1362580	1362587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4391	NC_021235	CAA	2	6	1362634	1362639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4392	NC_021235	CTTT	2	8	1365396	1365403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4393	NC_021235	A	7	7	1365421	1365427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_021235	TCA	2	6	1365434	1365439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4395	NC_021235	A	7	7	1365475	1365481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4396	NC_021235	CCT	2	6	1366066	1366071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4397	NC_021235	T	6	6	1366077	1366082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4398	NC_021235	TAA	2	6	1366091	1366096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4498	NC_021235	AAT	2	6	1416066	1416071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_021235	AAC	2	6	1416072	1416077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_021235	AATC	2	8	1416090	1416097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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