MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 6448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021235	CTTT	2	8	1417080	1417087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_021235	ATG	2	6	1417133	1417138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021235	AACC	2	8	1417413	1417420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_021235	GTAC	2	8	1417454	1417461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_021235	AGG	2	6	1417501	1417506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021235	AAT	2	6	1418934	1418939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021235	TC	4	8	1420409	1420416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_021235	TAT	2	6	1420441	1420446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_021235	TGAT	2	8	1420487	1420494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021235	TAA	2	6	1420500	1420505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_021235	A	6	6	1420504	1420509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021235	A	7	7	1420517	1420523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021235	GCTA	2	8	1420535	1420542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_021235	A	7	7	1420581	1420587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021235	ATCG	2	8	1420602	1420609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_021235	GAA	2	6	1420620	1420625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021235	ACC	2	6	1420648	1420653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_021235	ACG	2	6	1420704	1420709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_021235	TAAG	2	8	1420722	1420729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021235	TTA	2	6	1420803	1420808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021235	ATC	2	6	1420854	1420859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_021235	ACT	2	6	1423070	1423075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_021235	GAT	2	6	1423077	1423082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_021235	TTC	2	6	1423144	1423149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_021235	TA	3	6	1423160	1423165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_021235	A	6	6	1425847	1425852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_021235	TTA	2	6	1426376	1426381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021235	CCT	2	6	1430712	1430717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_021235	ACC	2	6	1430772	1430777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_021235	T	6	6	1430803	1430808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_021235	GCT	2	6	1430862	1430867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_021235	AGT	2	6	1430870	1430875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_021235	TAC	2	6	1430891	1430896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_021235	ACT	2	6	1430912	1430917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_021235	TGCT	2	8	1431873	1431880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4536	NC_021235	GTAA	2	8	1431942	1431949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021235	AAC	2	6	1432789	1432794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_021235	CTT	2	6	1433105	1433110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_021235	GTAA	2	8	1434076	1434083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021235	CGA	2	6	1434103	1434108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_021235	TTAC	2	8	1434127	1434134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4542	NC_021235	CCT	2	6	1434602	1434607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_021235	ACC	2	6	1434610	1434615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_021235	CTT	2	6	1434623	1434628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_021235	CA	3	6	1434678	1434683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_021235	CCG	2	6	1436151	1436156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_021235	AAGC	2	8	1436168	1436175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4548	NC_021235	GAA	2	6	1436177	1436182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_021235	GTGC	2	8	1436185	1436192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_021235	TCC	2	6	1436200	1436205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_021235	CCGG	2	8	1436213	1436220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_021235	CCG	2	6	1436222	1436227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_021235	CCA	2	6	1437742	1437747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_021235	A	7	7	1438547	1438553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4556	NC_021235	CCT	2	6	1439384	1439389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_021235	CCG	2	6	1442842	1442847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_021235	CGG	2	6	1442860	1442865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4560	NC_021235	TTC	2	6	1443262	1443267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_021235	TG	3	6	1444935	1444940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_021235	ACC	2	6	1444951	1444956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_021235	CAG	2	6	1445414	1445419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_021235	CGA	2	6	1446173	1446178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_021235	GC	3	6	1446179	1446184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_021235	TCC	2	6	1446218	1446223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_021235	CTT	2	6	1446471	1446476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_021235	AC	3	6	1447006	1447011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_021235	GAAA	2	8	1447028	1447035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021235	A	6	6	1447046	1447051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_021235	CA	4	8	1447060	1447067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_021235	TTTC	2	8	1447164	1447171	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4573	NC_021235	CCCG	2	8	1447196	1447203	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4574	NC_021235	CCAT	2	8	1448154	1448161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_021235	TCC	2	6	1450010	1450015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4577	NC_021235	A	6	6	1455138	1455143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_021235	T	6	6	1455167	1455172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_021235	ACTA	2	8	1455915	1455922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4580	NC_021235	ACTA	2	8	1455933	1455940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_021235	CCA	2	6	1455959	1455964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_021235	CATT	2	8	1457971	1457978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_021235	TAAA	2	8	1457983	1457990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021235	CGG	2	6	1458020	1458025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4586	NC_021235	CCT	2	6	1458403	1458408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_021235	CATAG	2	10	1458434	1458443	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4588	NC_021235	CAC	2	6	1458488	1458493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_021235	CGA	2	6	1458926	1458931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4591	NC_021235	CTC	2	6	1461688	1461693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_021235	TAT	2	6	1461712	1461717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_021235	TCT	2	6	1461724	1461729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4596	NC_021235	TCA	2	6	1461791	1461796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4598	NC_021235	T	6	6	1463584	1463589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021235	AC	3	6	1463605	1463610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_021235	TGCT	2	8	1463623	1463630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_021235	CCT	2	6	1464619	1464624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_021235	TCC	2	6	1465135	1465140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_021235	TCC	2	6	1467308	1467313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_021235	ATG	2	6	1467324	1467329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021235	GCAA	2	8	1467346	1467353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_021235	AGG	2	6	1467393	1467398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021235	TTC	2	6	1467466	1467471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_021235	AGTG	2	8	1467604	1467611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_021235	A	6	6	1467751	1467756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_021235	TCC	2	6	1469494	1469499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_021235	A	6	6	1469508	1469513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_021235	CTG	2	6	1469603	1469608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_021235	CCT	2	6	1469640	1469645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_021235	TAC	3	9	1469681	1469689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_021235	TAT	2	6	1469710	1469715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021235	A	8	8	1469741	1469748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4618	NC_021235	GAT	2	6	1469762	1469767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4620	NC_021235	T	7	7	1470324	1470330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_021235	TGG	2	6	1470376	1470381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021235	TTC	2	6	1475176	1475181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_021235	CAT	2	6	1475191	1475196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4625	NC_021235	AGGT	2	8	1475238	1475245	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021235	C	6	6	1476052	1476057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4627	NC_021235	CTT	2	6	1477078	1477083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_021235	GTT	2	6	1477084	1477089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_021235	TAA	2	6	1477095	1477100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_021235	ATT	2	6	1477805	1477810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_021235	ATG	2	6	1477813	1477818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_021235	GTA	2	6	1477836	1477841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_021235	A	6	6	1477858	1477863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_021235	ACCA	2	8	1478528	1478535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4635	NC_021235	GGCAC	2	10	1478543	1478552	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4757	NC_021235	ACC	2	6	1516618	1516623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4758	NC_021235	GTG	2	6	1516632	1516637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4763	NC_021235	TCA	2	6	1516922	1516927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4767	NC_021235	AAC	2	6	1517145	1517150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4770	NC_021235	CTGT	2	8	1517483	1517490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4894	NC_021235	TGT	2	6	1542460	1542465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4897	NC_021235	AGA	2	6	1544139	1544144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4898	NC_021235	GAG	2	6	1544201	1544206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4899	NC_021235	C	6	6	1544932	1544937	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4900	NC_021235	CCT	2	6	1546168	1546173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4901	NC_021235	TTAG	2	8	1546183	1546190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4902	NC_021235	TAAC	2	8	1546204	1546211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4903	NC_021235	TA	3	6	1546212	1546217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4904	NC_021235	ACTA	2	8	1546218	1546225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4925	NC_021235	ACTT	2	8	1559004	1559011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4928	NC_021235	TGA	2	6	1559134	1559139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4929	NC_021235	TGA	2	6	1559213	1559218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4998	NC_021235	GGTGA	2	10	1585398	1585407	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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