MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 12343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020558	AGG	2	6	317762	317767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020558	TAG	2	6	318463	318468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020558	T	6	6	318469	318474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020558	CA	3	6	318517	318522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_020558	AAT	2	6	318541	318546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020558	AGA	2	6	319029	319034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020558	TCT	2	6	319044	319049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_020558	CTT	2	6	319838	319843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_020558	AG	3	6	319864	319869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020558	GTA	2	6	319912	319917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020558	TA	3	6	319916	319921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020558	T	6	6	319929	319934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020558	ATTGT	2	10	319951	319960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020558	A	6	6	320465	320470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020558	T	7	7	320516	320522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020558	A	6	6	320538	320543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020558	ACT	2	6	320591	320596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_020558	TA	3	6	320608	320613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020558	GCATAG	2	12	320660	320671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1520	NC_020558	GAA	2	6	320698	320703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020558	A	6	6	321648	321653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020558	GTT	2	6	321666	321671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020558	T	7	7	321678	321684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020558	TA	4	8	321711	321718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020558	AG	3	6	321730	321735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020558	AGG	2	6	321777	321782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020558	T	6	6	322216	322221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020558	TTTA	2	8	322241	322248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020558	GAT	2	6	322253	322258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020558	TAT	2	6	322293	322298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020558	GATA	2	8	322317	322324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020558	GAA	2	6	322342	322347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020558	GAT	2	6	322380	322385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020558	AG	3	6	322391	322396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020558	A	6	6	322438	322443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020558	T	7	7	322691	322697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020558	AGT	2	6	322699	322704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020558	AT	3	6	322705	322710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_020558	TAT	2	6	322743	322748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020558	AGGG	2	8	322767	322774	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020558	AGG	2	6	322826	322831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020558	TTA	2	6	322881	322886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020558	AGTT	2	8	322894	322901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020558	ACA	2	6	324097	324102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_020558	AAC	2	6	324141	324146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_020558	AGA	2	6	324197	324202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020558	A	6	6	324264	324269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020558	GCA	2	6	324300	324305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020558	TAG	2	6	324325	324330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020558	CGAA	2	8	324340	324347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_020558	ACC	2	6	324452	324457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_020558	AATC	2	8	324536	324543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_020558	GCG	2	6	324557	324562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_020558	GAT	2	6	324593	324598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020558	CTA	2	6	324693	324698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_020558	GCA	2	6	324701	324706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_020558	AC	3	6	324720	324725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_020558	CCG	2	6	326044	326049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_020558	TTG	2	6	326054	326059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020558	TGG	2	6	326060	326065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020558	AT	3	6	326077	326082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020558	ATTA	2	8	326862	326869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020558	T	6	6	326919	326924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020558	A	6	6	326968	326973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020558	A	6	6	326994	326999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020558	ATC	2	6	329028	329033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_020558	AAT	2	6	329048	329053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020558	A	6	6	329059	329064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020558	TTA	3	9	329083	329091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020558	ATT	3	9	329135	329143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020558	AAAAT	2	10	329146	329155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020558	TAA	2	6	329156	329161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020558	GTA	2	6	329238	329243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020558	ATC	2	6	329850	329855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_020558	GTT	2	6	329910	329915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020558	TGT	2	6	329919	329924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020558	T	6	6	329924	329929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020558	GCT	2	6	329959	329964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_020558	ATT	2	6	329987	329992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020558	CAAA	2	8	330038	330045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_020558	TA	3	6	330047	330052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020558	GTT	2	6	330388	330393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020558	TAG	2	6	330435	330440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020558	CAT	2	6	330442	330447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1586	NC_020558	T	6	6	330463	330468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_020558	GAT	3	9	330532	330540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020558	TCT	2	6	330544	330549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_020558	T	8	8	330549	330556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_020558	T	6	6	330597	330602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020558	TAT	2	6	330606	330611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_020558	TAA	2	6	330660	330665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020558	GGT	2	6	330695	330700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_020558	TAG	2	6	330746	330751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_020558	T	6	6	330757	330762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020558	AAAT	2	8	330767	330774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020558	ATAGA	2	10	330781	330790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020558	TTA	2	6	330822	330827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020558	TAG	2	6	330873	330878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020558	AAC	2	6	330889	330894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_020558	CAG	2	6	330909	330914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_020558	GAT	2	6	330971	330976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020558	AGA	2	6	330985	330990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020558	AAG	2	6	330996	331001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020558	AAGC	2	8	331014	331021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_020558	GAA	2	6	331058	331063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020558	AAAC	2	8	331112	331119	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_020558	CAG	2	6	331140	331145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_020558	GAC	2	6	331172	331177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_020558	A	6	6	331187	331192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020558	AAT	2	6	331373	331378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020558	AT	3	6	331377	331382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020558	TCCAA	2	10	331436	331445	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1617	NC_020558	GGA	2	6	331468	331473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020558	AGA	2	6	331519	331524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020558	GC	3	6	331566	331571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_020558	AACTT	2	10	331667	331676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1621	NC_020558	A	6	6	331699	331704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1623	NC_020558	CGA	2	6	331758	331763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1625	NC_020558	GTA	2	6	331860	331865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020558	GAAA	2	8	331870	331877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020558	GAA	2	6	331888	331893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020558	AAT	2	6	331955	331960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020558	AAT	2	6	332195	332200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020558	A	6	6	332222	332227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020558	AT	3	6	332316	332321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020558	AAT	2	6	332324	332329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020558	GAT	2	6	332413	332418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020558	AAC	2	6	332456	332461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_020558	ATA	2	6	332721	332726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_020558	AAT	2	6	332876	332881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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