MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 12343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020558	T	7	7	245543	245549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020558	A	6	6	245567	245572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020558	AGG	2	6	245589	245594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020558	CAA	2	6	245595	245600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020558	TAG	2	6	246180	246185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020558	AAAGGA	2	12	246196	246207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020558	ACAA	2	8	247651	247658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_020558	GCTT	2	8	247666	247673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_020558	TTG	2	6	248662	248667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020558	AGT	2	6	248750	248755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020558	GAA	2	6	248946	248951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020558	GAG	2	6	249018	249023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020558	AGA	2	6	249071	249076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020558	ATG	2	6	249688	249693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020558	A	6	6	249708	249713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020558	TTATAT	2	12	249739	249750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020558	T	6	6	249767	249772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020558	GGCAT	2	10	249773	249782	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_020558	GAA	3	9	249814	249822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020558	AGAA	2	8	249885	249892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020558	GAA	2	6	249907	249912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020558	ACAT	2	8	249934	249941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_020558	T	6	6	250226	250231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020558	AGG	2	6	250250	250255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020558	GGC	2	6	250258	250263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_020558	TGC	2	6	250274	250279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_020558	A	7	7	250294	250300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020558	TACT	2	8	250316	250323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_020558	GAA	4	12	250406	250417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020558	A	6	6	250426	250431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020558	AAAACA	2	12	250436	250447	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1032	NC_020558	TAG	2	6	250479	250484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020558	ATT	2	6	250833	250838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020558	GTT	2	6	250846	250851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020558	AT	3	6	251376	251381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020558	AGG	2	6	251454	251459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020558	A	7	7	251473	251479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020558	AAG	2	6	251487	251492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020558	CAG	2	6	251508	251513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_020558	CAT	2	6	251569	251574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_020558	TTA	2	6	251622	251627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020558	TGT	2	6	251632	251637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020558	CGTT	2	8	251657	251664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_020558	TCA	2	6	251670	251675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_020558	CCA	2	6	251684	251689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_020558	A	6	6	251705	251710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020558	CAAA	2	8	251742	251749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_020558	GT	3	6	251896	251901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020558	AGG	2	6	251920	251925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020558	T	6	6	252800	252805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020558	TTG	2	6	252849	252854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020558	ACAA	2	8	253395	253402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_020558	A	6	6	253419	253424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020558	TAT	2	6	253428	253433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020558	GGA	2	6	253435	253440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020558	TTTA	2	8	253850	253857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020558	T	8	8	253907	253914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020558	ACA	2	6	254598	254603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_020558	T	6	6	254618	254623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020558	ATT	2	6	254639	254644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020558	TTTA	2	8	254680	254687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020558	TCGTA	2	10	254698	254707	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_020558	A	6	6	254713	254718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020558	GAT	2	6	254746	254751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020558	AAC	2	6	254756	254761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_020558	ATT	2	6	254765	254770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020558	GGA	2	6	254783	254788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020558	TGA	2	6	254815	254820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020558	TTC	2	6	254834	254839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_020558	A	6	6	254858	254863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020558	TAT	2	6	254950	254955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020558	TGA	2	6	255011	255016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020558	TGA	2	6	255051	255056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020558	AT	3	6	255087	255092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020558	AAAG	2	8	255190	255197	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020558	TAT	2	6	255205	255210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020558	TTTA	2	8	255224	255231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020558	AGA	2	6	255254	255259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020558	A	6	6	255279	255284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020558	T	6	6	255285	255290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020558	ATA	2	6	255323	255328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020558	GAA	2	6	255347	255352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020558	A	6	6	255364	255369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020558	AGA	2	6	255382	255387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020558	AG	3	6	255410	255415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020558	AAT	2	6	255450	255455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020558	TTA	2	6	255466	255471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020558	GAA	2	6	255865	255870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020558	TAAA	2	8	255944	255951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020558	A	6	6	255960	255965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020558	A	6	6	255972	255977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020558	A	6	6	256186	256191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020558	TGA	2	6	256280	256285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020558	TA	3	6	256315	256320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020558	AAG	2	6	256422	256427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020558	TAA	2	6	256437	256442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020558	TAA	2	6	256459	256464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020558	TTTC	2	8	256479	256486	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_020558	AAGG	2	8	256538	256545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020558	GAA	2	6	257080	257085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020558	TATTT	2	10	257125	257134	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020558	A	7	7	257244	257250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020558	AGA	2	6	257265	257270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020558	TCTT	2	8	257349	257356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_020558	T	7	7	257368	257374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020558	AAG	2	6	257395	257400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020558	ATT	2	6	258158	258163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020558	GCA	2	6	258359	258364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_020558	ATG	2	6	258532	258537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020558	CTT	2	6	258625	258630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_020558	AGA	2	6	258755	258760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020558	CAA	2	6	258818	258823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_020558	AAG	2	6	258847	258852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020558	ATT	2	6	258897	258902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020558	AGTT	2	8	258931	258938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020558	A	6	6	258984	258989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020558	GCTTG	2	10	259023	259032	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_020558	ATT	2	6	259140	259145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020558	ACT	2	6	259165	259170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1121	NC_020558	CAA	2	6	259346	259351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_020558	A	6	6	259350	259355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020558	TCG	2	6	259454	259459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_020558	ATT	2	6	259473	259478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020558	ATG	2	6	259579	259584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020558	AAGAAA	2	12	259585	259596	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020558	CAT	2	6	259601	259606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1129	NC_020558	ATT	2	6	259656	259661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020558	CTT	2	6	259676	259681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_020558	TCG	2	6	259733	259738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_020558	CAA	2	6	259851	259856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_020558	AGT	2	6	259874	259879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020558	T	6	6	259896	259901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020558	CAAA	2	8	259932	259939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_020558	CGT	2	6	259965	259970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_020558	TGG	2	6	259988	259993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_020558	TTC	2	6	304629	304634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_020558	GTA	2	6	304664	304669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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