MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 12343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020558	TCGG	2	8	2497072	2497079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11002	NC_020558	CTTC	2	8	2497155	2497162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11003	NC_020558	TTG	3	9	2497171	2497179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_020558	TCT	2	6	2497196	2497201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_020558	TTCC	2	8	2497221	2497228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11006	NC_020558	GCCA	2	8	2497260	2497267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_020558	CTAA	2	8	2497268	2497275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_020558	AAT	2	6	2497333	2497338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_020558	AAT	2	6	2497351	2497356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_020558	TAA	2	6	2497464	2497469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_020558	TCA	2	6	2497491	2497496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_020558	TGC	2	6	2497594	2497599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_020558	GCT	2	6	2497643	2497648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_020558	AG	3	6	2497699	2497704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_020558	CCA	2	6	2497751	2497756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11016	NC_020558	ATAA	2	8	2497799	2497806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_020558	T	6	6	2497810	2497815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_020558	ATGATT	2	12	2497831	2497842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_020558	AT	3	6	2497928	2497933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_020558	A	7	7	2497959	2497965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_020558	TGGAA	2	10	2497980	2497989	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_020558	T	6	6	2497991	2497996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_020558	AAGT	2	8	2502617	2502624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_020558	GC	3	6	2502683	2502688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11025	NC_020558	A	6	6	2502689	2502694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_020558	A	7	7	2502765	2502771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_020558	ATTAG	2	10	2502777	2502786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_020558	TTA	2	6	2503669	2503674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_020558	GGA	2	6	2503741	2503746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_020558	AAT	2	6	2504636	2504641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_020558	AAG	2	6	2506985	2506990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_020558	CAT	2	6	2509107	2509112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_020558	CTC	2	6	2509915	2509920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11034	NC_020558	TCC	2	6	2510451	2510456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11035	NC_020558	CGC	2	6	2510463	2510468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_020558	ACC	2	6	2510479	2510484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11037	NC_020558	TCT	2	6	2510519	2510524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_020558	GC	3	6	2510536	2510541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11039	NC_020558	T	6	6	2510583	2510588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_020558	TTTG	2	8	2510608	2510615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_020558	TTCAT	2	10	2510712	2510721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11042	NC_020558	CAA	2	6	2510836	2510841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_020558	TTC	2	6	2510869	2510874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_020558	TTC	2	6	2510943	2510948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_020558	A	6	6	2511003	2511008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11047	NC_020558	TTC	2	6	2511068	2511073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_020558	AAT	2	6	2511096	2511101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_020558	CCA	2	6	2511102	2511107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11050	NC_020558	ACA	2	6	2511183	2511188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_020558	TGGAG	2	10	2511261	2511270	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_020558	ATT	2	6	2511338	2511343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_020558	TCA	2	6	2511544	2511549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_020558	ATCA	2	8	2511561	2511568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11055	NC_020558	CAAA	2	8	2511592	2511599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11056	NC_020558	ATT	2	6	2511629	2511634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_020558	AC	3	6	2512125	2512130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11058	NC_020558	CA	3	6	2512136	2512141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_020558	ATC	3	9	2512179	2512187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_020558	GGCT	2	8	2512201	2512208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11061	NC_020558	CAAT	2	8	2512216	2512223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11062	NC_020558	CGT	2	6	2512383	2512388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_020558	CCT	2	6	2512697	2512702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11064	NC_020558	TTATA	2	10	2512731	2512740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_020558	CTTA	2	8	2512747	2512754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11066	NC_020558	CTA	2	6	2512799	2512804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_020558	TC	3	6	2512812	2512817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_020558	TTA	2	6	2512865	2512870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_020558	ACG	2	6	2512878	2512883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_020558	ACG	2	6	2512892	2512897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_020558	T	6	6	2512902	2512907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_020558	AG	3	6	2512913	2512918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_020558	CTG	2	6	2512925	2512930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_020558	A	6	6	2512940	2512945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_020558	AAAT	2	8	2513073	2513080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_020558	GGT	2	6	2513084	2513089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_020558	ATT	2	6	2513124	2513129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_020558	TTTTA	2	10	2513145	2513154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_020558	TTG	2	6	2513337	2513342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_020558	AGCG	2	8	2513361	2513368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11082	NC_020558	ATTAT	2	10	2513393	2513402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_020558	AAG	2	6	2513445	2513450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_020558	TGAT	2	8	2513457	2513464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_020558	GAA	2	6	2513465	2513470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_020558	A	7	7	2513469	2513475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_020558	TCG	2	6	2513521	2513526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_020558	ATCA	2	8	2513536	2513543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11089	NC_020558	GTTC	2	8	2513546	2513553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11090	NC_020558	AAT	2	6	2514881	2514886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_020558	TAC	2	6	2514893	2514898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11093	NC_020558	CTA	2	6	2514909	2514914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_020558	CTG	2	6	2514949	2514954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_020558	AAT	2	6	2515001	2515006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_020558	TAA	2	6	2515014	2515019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_020558	A	7	7	2515018	2515024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_020558	CAA	2	6	2515028	2515033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_020558	CACCC	2	10	2515958	2515967	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11100	NC_020558	TTA	2	6	2515974	2515979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_020558	TAC	2	6	2516002	2516007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_020558	ATA	2	6	2516023	2516028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_020558	ATT	2	6	2516035	2516040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_020558	A	7	7	2516053	2516059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_020558	AT	3	6	2516093	2516098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_020558	CGA	2	6	2516126	2516131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_020558	CCTT	2	8	2516134	2516141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11108	NC_020558	GCA	2	6	2516176	2516181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_020558	A	7	7	2516195	2516201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_020558	CAGG	2	8	2516210	2516217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11111	NC_020558	AAT	2	6	2516277	2516282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_020558	GTT	2	6	2516413	2516418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_020558	CT	3	6	2516428	2516433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11114	NC_020558	AGA	2	6	2516443	2516448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_020558	T	6	6	2516477	2516482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_020558	TCGA	2	8	2516493	2516500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11117	NC_020558	ATC	2	6	2516557	2516562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_020558	GAA	2	6	2516583	2516588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_020558	G	6	6	2516608	2516613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_020558	CA	3	6	2516649	2516654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11121	NC_020558	AAC	2	6	2516681	2516686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_020558	GT	3	6	2516700	2516705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_020558	CTC	2	6	2516735	2516740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11124	NC_020558	ACG	2	6	2516784	2516789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_020558	CGA	2	6	2516864	2516869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11127	NC_020558	TCCA	2	8	2517071	2517078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11128	NC_020558	AGG	2	6	2517115	2517120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_020558	GTA	2	6	2517203	2517208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_020558	CCA	2	6	2517211	2517216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11131	NC_020558	CCT	2	6	2517220	2517225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11132	NC_020558	CCTA	2	8	2517255	2517262	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11133	NC_020558	TC	3	6	2517375	2517380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11134	NC_020558	GCC	2	6	2517472	2517477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11137	NC_020558	TC	3	6	2517710	2517715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11138	NC_020558	TC	3	6	2517730	2517735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11139	NC_020558	TAC	2	6	2517770	2517775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11140	NC_020558	TTCC	2	8	2517829	2517836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11141	NC_020558	CACT	2	8	2517883	2517890	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11142	NC_020558	TGT	2	6	2517982	2517987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11144	NC_020558	CTT	2	6	2518090	2518095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11145	NC_020558	CCA	2	6	2518132	2518137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11148	NC_020558	TGG	2	6	2518371	2518376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11150	NC_020558	CGTG	2	8	2518622	2518629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11151	NC_020558	AGTA	2	8	2518643	2518650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11152	NC_020558	TTACC	2	10	2518651	2518660	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11153	NC_020558	CAA	2	6	2518770	2518775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11161	NC_020558	TCC	2	6	2519194	2519199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11162	NC_020558	CTT	2	6	2519358	2519363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11163	NC_020558	GTT	2	6	2519434	2519439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11165	NC_020558	GAT	2	6	2519497	2519502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11166	NC_020558	ATAA	2	8	2519520	2519527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11209	NC_020558	GTT	2	6	2522319	2522324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11212	NC_020558	T	7	7	2522378	2522384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11213	NC_020558	TTG	2	6	2522387	2522392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11215	NC_020558	CTG	2	6	2522527	2522532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11221	NC_020558	AATG	2	8	2522781	2522788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11223	NC_020558	TAT	2	6	2522823	2522828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11226	NC_020558	T	6	6	2522984	2522989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11227	NC_020558	ATA	2	6	2522991	2522996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11234	NC_020558	CGCT	2	8	2523231	2523238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11237	NC_020558	CAA	2	6	2523363	2523368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11238	NC_020558	CA	3	6	2523416	2523421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11239	NC_020558	GC	3	6	2523440	2523445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11240	NC_020558	TGG	2	6	2523502	2523507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11242	NC_020558	ATT	2	6	2523548	2523553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11243	NC_020558	ATG	2	6	2523576	2523581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11244	NC_020558	AATC	2	8	2523605	2523612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11245	NC_020558	AGC	2	6	2523616	2523621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11246	NC_020558	TAA	2	6	2523691	2523696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11247	NC_020558	AAC	2	6	2523788	2523793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11248	NC_020558	TTGG	2	8	2523801	2523808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11249	NC_020558	ATC	2	6	2523837	2523842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11250	NC_020558	AGA	2	6	2523847	2523852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11251	NC_020558	GAT	2	6	2523881	2523886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11252	NC_020558	A	7	7	2523980	2523986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11253	NC_020558	CGG	2	6	2523994	2523999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11254	NC_020558	AGTA	2	8	2524120	2524127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11255	NC_020558	A	6	6	2524168	2524173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_020558	CAC	2	6	2524188	2524193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11257	NC_020558	TAA	2	6	2524204	2524209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11258	NC_020558	TTG	2	6	2524284	2524289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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