MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 12343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020558	A	6	6	2270020	2270025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_020558	T	7	7	2270952	2270958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_020558	TTC	2	6	2272969	2272974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_020558	A	7	7	2272990	2272996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020558	T	6	6	2275916	2275921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_020558	GAAAA	2	10	2275946	2275955	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_020558	TCA	2	6	2275959	2275964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_020558	A	6	6	2275964	2275969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_020558	TGG	2	6	2275988	2275993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_020558	TAA	2	6	2275995	2276000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_020558	CCT	2	6	2276705	2276710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_020558	TC	3	6	2276732	2276737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10013	NC_020558	ATA	2	6	2276744	2276749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_020558	A	9	9	2276749	2276757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_020558	TCT	2	6	2276784	2276789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_020558	CTT	2	6	2276792	2276797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_020558	TTA	2	6	2276832	2276837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_020558	T	7	7	2276844	2276850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_020558	A	6	6	2276874	2276879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_020558	TCC	2	6	2278170	2278175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_020558	T	6	6	2278202	2278207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_020558	A	6	6	2279127	2279132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_020558	GTT	2	6	2280567	2280572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_020558	CTT	2	6	2281964	2281969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_020558	TCC	2	6	2282463	2282468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_020558	ATT	2	6	2282477	2282482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_020558	TA	3	6	2282516	2282521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_020558	T	8	8	2282533	2282540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_020558	T	6	6	2282553	2282558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020558	A	7	7	2282570	2282576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_020558	AATG	2	8	2282580	2282587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020558	TGC	2	6	2282592	2282597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_020558	AAC	2	6	2282604	2282609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_020558	A	7	7	2282645	2282651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020558	AAT	2	6	2282656	2282661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020558	AAAC	2	8	2282668	2282675	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10037	NC_020558	CAA	2	6	2282697	2282702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_020558	AGG	2	6	2282713	2282718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_020558	TGA	2	6	2282737	2282742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_020558	A	7	7	2282749	2282755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_020558	ATTA	2	8	2282767	2282774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_020558	CAT	2	6	2282777	2282782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_020558	CAAA	2	8	2282819	2282826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10044	NC_020558	A	6	6	2282824	2282829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_020558	ATTT	2	8	2283929	2283936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_020558	A	6	6	2283983	2283988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_020558	GGC	2	6	2284019	2284024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_020558	CGC	2	6	2284101	2284106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_020558	GACAT	2	10	2284114	2284123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10050	NC_020558	TTATC	2	10	2284130	2284139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10051	NC_020558	ATC	2	6	2284167	2284172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_020558	A	6	6	2284188	2284193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_020558	CACC	2	8	2284247	2284254	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10054	NC_020558	ATT	2	6	2284275	2284280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_020558	CGA	2	6	2284286	2284291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_020558	AGG	2	6	2284321	2284326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_020558	A	6	6	2284327	2284332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_020558	GAC	2	6	2285465	2285470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_020558	ATT	3	9	2285567	2285575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_020558	AGA	2	6	2285617	2285622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_020558	AAC	2	6	2285660	2285665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_020558	CAA	2	6	2285690	2285695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_020558	CA	3	6	2285713	2285718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10064	NC_020558	TAA	2	6	2285720	2285725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020558	T	6	6	2285754	2285759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_020558	TA	3	6	2286981	2286986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_020558	T	6	6	2286989	2286994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_020558	ATT	2	6	2287010	2287015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020558	T	8	8	2287014	2287021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_020558	ATT	2	6	2287140	2287145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_020558	T	6	6	2287144	2287149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_020558	A	6	6	2287199	2287204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_020558	CGG	2	6	2287244	2287249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_020558	ATA	2	6	2287333	2287338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_020558	ATTA	2	8	2287356	2287363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_020558	ACT	2	6	2287524	2287529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_020558	CAA	2	6	2287610	2287615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_020558	GAT	2	6	2287645	2287650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_020558	ATT	2	6	2287715	2287720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_020558	AT	3	6	2287724	2287729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_020558	TGG	2	6	2287810	2287815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_020558	ACC	2	6	2287832	2287837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10083	NC_020558	CCG	2	6	2287863	2287868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10084	NC_020558	A	6	6	2287899	2287904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_020558	A	7	7	2287906	2287912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_020558	TCAA	2	8	2287952	2287959	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10087	NC_020558	CAGG	2	8	2288033	2288040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10088	NC_020558	CGA	2	6	2288117	2288122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_020558	AAT	2	6	2288149	2288154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_020558	TGG	2	6	2288168	2288173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_020558	TAA	3	9	2288285	2288293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_020558	CCG	2	6	2288324	2288329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_020558	A	6	6	2288371	2288376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_020558	TTA	2	6	2288386	2288391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020558	CAGG	2	8	2288503	2288510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10096	NC_020558	AAT	2	6	2288570	2288575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_020558	GTT	2	6	2288706	2288711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_020558	CT	3	6	2288721	2288726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_020558	AGA	2	6	2288736	2288741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_020558	T	6	6	2288770	2288775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_020558	TCGA	2	8	2288786	2288793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_020558	ATC	2	6	2288850	2288855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_020558	GAA	2	6	2288876	2288881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020558	G	6	6	2288901	2288906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_020558	CA	3	6	2288942	2288947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10106	NC_020558	AAC	2	6	2288974	2288979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_020558	GT	3	6	2288993	2288998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_020558	CTC	2	6	2289028	2289033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_020558	ACG	2	6	2289077	2289082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_020558	CGA	2	6	2289157	2289162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_020558	ACC	2	6	2289272	2289277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_020558	TCCA	2	8	2289364	2289371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_020558	AGG	2	6	2289408	2289413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_020558	GTA	2	6	2289496	2289501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_020558	CCA	2	6	2289504	2289509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_020558	CCT	2	6	2289513	2289518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_020558	CCTA	2	8	2289548	2289555	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10118	NC_020558	TC	3	6	2289668	2289673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_020558	GCC	2	6	2289765	2289770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_020558	CTC	2	6	2289813	2289818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_020558	CT	3	6	2289923	2289928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_020558	TC	3	6	2290003	2290008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_020558	TC	3	6	2290023	2290028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_020558	TAC	2	6	2290063	2290068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_020558	TTCC	2	8	2290122	2290129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10126	NC_020558	CACT	2	8	2290176	2290183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10127	NC_020558	TGT	2	6	2290275	2290280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_020558	CGCCTA	2	12	2290285	2290296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10129	NC_020558	CTT	2	6	2290383	2290388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_020558	CCA	2	6	2290425	2290430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_020558	TGG	2	6	2290580	2290585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_020558	AT	3	6	2290644	2290649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_020558	TGG	2	6	2290664	2290669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_020558	GA	3	6	2290844	2290849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_020558	CGTG	2	8	2290915	2290922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10136	NC_020558	AGTA	2	8	2290936	2290943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_020558	TTACC	2	10	2290944	2290953	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10138	NC_020558	CAA	2	6	2291063	2291068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10143	NC_020558	AAG	2	6	2291414	2291419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10146	NC_020558	TCC	2	6	2291488	2291493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10147	NC_020558	CTT	2	6	2291652	2291657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10243	NC_020558	T	7	7	2312235	2312241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_020558	CTT	2	6	2314407	2314412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10246	NC_020558	A	6	6	2314436	2314441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_020558	CTT	2	6	2314472	2314477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_020558	A	8	8	2315734	2315741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_020558	AT	3	6	2315829	2315834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_020558	CATT	2	8	2315877	2315884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10251	NC_020558	CTT	2	6	2315913	2315918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_020558	T	7	7	2315945	2315951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_020558	GAC	2	6	2315968	2315973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10255	NC_020558	CAA	2	6	2316067	2316072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10256	NC_020558	T	6	6	2317173	2317178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_020558	T	6	6	2317207	2317212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_020558	AGG	2	6	2317213	2317218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_020558	T	6	6	2317892	2317897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_020558	CCT	2	6	2318146	2318151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10261	NC_020558	AT	3	6	2318608	2318613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10264	NC_020558	ATGC	2	8	2318851	2318858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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