MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 12268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020557	A	7	7	2515602	2515608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_020557	AT	3	6	2515642	2515647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_020557	CGA	2	6	2515675	2515680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_020557	CCTT	2	8	2515683	2515690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11005	NC_020557	GCA	2	6	2515725	2515730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_020557	A	7	7	2515744	2515750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_020557	CAGG	2	8	2515759	2515766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_020557	AAT	2	6	2515826	2515831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_020557	GTT	2	6	2515962	2515967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_020557	CT	3	6	2515977	2515982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11011	NC_020557	AGA	2	6	2515992	2515997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_020557	T	6	6	2516026	2516031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_020557	TCGA	2	8	2516042	2516049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11014	NC_020557	ATC	2	6	2516106	2516111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_020557	GAA	2	6	2516132	2516137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_020557	G	6	6	2516157	2516162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_020557	CA	3	6	2516198	2516203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11018	NC_020557	AAC	2	6	2516230	2516235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_020557	GT	3	6	2516249	2516254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_020557	CTC	2	6	2516284	2516289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_020557	ACG	2	6	2516333	2516338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_020557	CGA	2	6	2516413	2516418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_020557	ACC	2	6	2516528	2516533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_020557	TCCA	2	8	2516620	2516627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11025	NC_020557	AGG	2	6	2516664	2516669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_020557	GTA	2	6	2516752	2516757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_020557	CCA	2	6	2516760	2516765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11028	NC_020557	CCT	2	6	2516769	2516774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_020557	CCTA	2	8	2516804	2516811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11030	NC_020557	TC	3	6	2516924	2516929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11031	NC_020557	GCC	2	6	2517021	2517026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_020557	CTC	2	6	2517069	2517074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_020557	CT	3	6	2517179	2517184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_020557	TC	3	6	2517259	2517264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11035	NC_020557	TC	3	6	2517279	2517284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_020557	TAC	2	6	2517319	2517324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_020557	TTCC	2	8	2517378	2517385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11038	NC_020557	CACT	2	8	2517432	2517439	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11039	NC_020557	TGT	2	6	2517531	2517536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_020557	CGCCTA	2	12	2517541	2517552	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11041	NC_020557	CTT	2	6	2517639	2517644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_020557	CCA	2	6	2517681	2517686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11043	NC_020557	TGG	2	6	2517836	2517841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_020557	AT	3	6	2517900	2517905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_020557	TGG	2	6	2517920	2517925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_020557	GA	3	6	2518100	2518105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_020557	CGTG	2	8	2518171	2518178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11048	NC_020557	AGTA	2	8	2518192	2518199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_020557	TTACC	2	10	2518200	2518209	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11050	NC_020557	CAA	2	6	2518319	2518324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_020557	ACT	2	6	2518383	2518388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_020557	TCC	2	6	2518504	2518509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11053	NC_020557	CCG	2	6	2518536	2518541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11054	NC_020557	CTTT	2	8	2518630	2518637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11055	NC_020557	AAG	2	6	2518669	2518674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_020557	CTT	2	6	2518679	2518684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_020557	TCGC	2	8	2518704	2518711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11058	NC_020557	TCC	2	6	2518743	2518748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11059	NC_020557	CTT	2	6	2518907	2518912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_020557	GTT	2	6	2518983	2518988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_020557	GAT	2	6	2519010	2519015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_020557	GAT	2	6	2519046	2519051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_020557	ATAA	2	8	2519069	2519076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_020557	TGG	2	6	2519133	2519138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_020557	CCT	2	6	2519163	2519168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_020557	ATT	2	6	2519222	2519227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_020557	AGAA	2	8	2519243	2519250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_020557	AG	3	6	2519391	2519396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_020557	AGA	2	6	2519422	2519427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_020557	TTTCCT	2	12	2519443	2519454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_020557	AGG	2	6	2519460	2519465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_020557	CGG	2	6	2519533	2519538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_020557	GTG	2	6	2519587	2519592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_020557	GT	3	6	2519602	2519607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_020557	GT	3	6	2519771	2519776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_020557	ATG	2	6	2519796	2519801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_020557	TCC	2	6	2519822	2519827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_020557	CACGA	2	10	2519920	2519929	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11079	NC_020557	GAC	2	6	2519933	2519938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_020557	CAC	2	6	2519946	2519951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11081	NC_020557	TTC	2	6	2520021	2520026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_020557	GCA	2	6	2520140	2520145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_020557	AG	3	6	2520260	2520265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_020557	TCC	2	6	2520285	2520290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11085	NC_020557	CTC	2	6	2520331	2520336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_020557	GC	4	8	2520418	2520425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_020557	GCT	2	6	2520475	2520480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_020557	TTC	2	6	2520548	2520553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_020557	AAC	2	6	2520557	2520562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_020557	CTT	2	6	2520584	2520589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_020557	GCG	2	6	2520597	2520602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_020557	CTG	2	6	2520643	2520648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_020557	CAGG	2	8	2520871	2520878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11094	NC_020557	TCC	2	6	2520931	2520936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11095	NC_020557	GTTC	2	8	2520937	2520944	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11096	NC_020557	CGC	2	6	2520964	2520969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11097	NC_020557	CT	3	6	2520997	2521002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11098	NC_020557	TTGAAT	2	12	2521015	2521026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_020557	AATTA	2	10	2521079	2521088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_020557	GTTT	2	8	2521092	2521099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_020557	TCT	3	9	2521168	2521176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_020557	TTG	2	6	2521205	2521210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_020557	GT	3	6	2521819	2521824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_020557	GAT	2	6	2521834	2521839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_020557	G	6	6	2521857	2521862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_020557	GTT	2	6	2521868	2521873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_020557	AT	4	8	2521900	2521907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_020557	TAA	2	6	2521915	2521920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_020557	T	7	7	2521927	2521933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_020557	TTG	2	6	2521936	2521941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_020557	CTTG	2	8	2522051	2522058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11112	NC_020557	CTG	2	6	2522076	2522081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_020557	GGTA	2	8	2522084	2522091	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_020557	ATTT	2	8	2522104	2522111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_020557	TTC	2	6	2522137	2522142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_020557	TAT	2	6	2522145	2522150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_020557	CTG	2	6	2522172	2522177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_020557	AATG	2	8	2522330	2522337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_020557	ATT	2	6	2522351	2522356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_020557	TAT	2	6	2522372	2522377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_020557	GAA	2	6	2522416	2522421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_020557	T	6	6	2522523	2522528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_020557	T	6	6	2522533	2522538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_020557	ATA	2	6	2522540	2522545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_020557	AT	3	6	2522555	2522560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_020557	AGG	2	6	2522664	2522669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_020557	ACT	2	6	2522695	2522700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_020557	CAA	2	6	2522704	2522709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11129	NC_020557	TGA	2	6	2522718	2522723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_020557	GGAT	2	8	2522742	2522749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11395	NC_020557	A	6	6	2600767	2600772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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