MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 12268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020557	TCGA	2	8	2288386	2288393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10002	NC_020557	ATC	2	6	2288450	2288455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_020557	GAA	2	6	2288476	2288481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_020557	G	6	6	2288501	2288506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020557	CA	3	6	2288542	2288547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10006	NC_020557	AAC	2	6	2288574	2288579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_020557	GT	3	6	2288593	2288598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_020557	CTC	2	6	2288628	2288633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_020557	ACG	2	6	2288677	2288682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_020557	CGA	2	6	2288757	2288762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_020557	ACC	2	6	2288872	2288877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_020557	TCCA	2	8	2288964	2288971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10013	NC_020557	AGG	2	6	2289008	2289013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_020557	GTA	2	6	2289096	2289101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_020557	CCA	2	6	2289104	2289109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10016	NC_020557	CCT	2	6	2289113	2289118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_020557	CCTA	2	8	2289148	2289155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_020557	TC	3	6	2289268	2289273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_020557	GCC	2	6	2289365	2289370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_020557	CTC	2	6	2289413	2289418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_020557	CT	3	6	2289523	2289528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_020557	TC	3	6	2289603	2289608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_020557	TC	3	6	2289623	2289628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_020557	TAC	2	6	2289663	2289668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_020557	TTCC	2	8	2289722	2289729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10026	NC_020557	CACT	2	8	2289776	2289783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_020557	TGT	2	6	2289875	2289880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_020557	CGCCTA	2	12	2289885	2289896	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_020557	CTT	2	6	2289983	2289988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_020557	CCA	2	6	2290025	2290030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_020557	TGG	2	6	2290180	2290185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020557	AT	3	6	2290244	2290249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_020557	TGG	2	6	2290264	2290269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020557	GA	3	6	2290444	2290449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020557	CGTG	2	8	2290515	2290522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10036	NC_020557	AGTA	2	8	2290536	2290543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_020557	TTACC	2	10	2290544	2290553	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10038	NC_020557	CAA	2	6	2290663	2290668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_020557	ACT	2	6	2290727	2290732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_020557	TCC	2	6	2290848	2290853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_020557	CCG	2	6	2290880	2290885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_020557	CTTT	2	8	2290974	2290981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_020557	AAG	2	6	2291013	2291018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_020557	CTT	2	6	2291023	2291028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_020557	TCGC	2	8	2291048	2291055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10046	NC_020557	TCC	2	6	2291087	2291092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_020557	CTT	2	6	2291251	2291256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_020557	GTT	2	6	2291327	2291332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_020557	GAT	2	6	2291354	2291359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_020557	GAT	2	6	2291390	2291395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_020557	ATAA	2	8	2291413	2291420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_020557	TGG	2	6	2291477	2291482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_020557	CCT	2	6	2291507	2291512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10054	NC_020557	ATT	2	6	2291566	2291571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_020557	AGAA	2	8	2291587	2291594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_020557	AG	3	6	2291735	2291740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_020557	AGA	2	6	2291766	2291771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_020557	TTTCCT	2	12	2291787	2291798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_020557	AGG	2	6	2291804	2291809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_020557	CGG	2	6	2291877	2291882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_020557	GTG	2	6	2291931	2291936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_020557	GT	3	6	2291946	2291951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020557	GT	3	6	2292115	2292120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_020557	ATG	2	6	2292140	2292145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020557	TCC	2	6	2292166	2292171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_020557	CACGA	2	10	2292264	2292273	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10067	NC_020557	GAC	2	6	2292277	2292282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_020557	CAC	2	6	2292290	2292295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_020557	TTC	2	6	2292365	2292370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_020557	GCA	2	6	2292484	2292489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_020557	AG	3	6	2292604	2292609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_020557	TCC	2	6	2292629	2292634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10073	NC_020557	CTC	2	6	2292675	2292680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_020557	GC	4	8	2292762	2292769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10075	NC_020557	GCT	2	6	2292819	2292824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_020557	TTC	2	6	2292892	2292897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_020557	AAC	2	6	2292901	2292906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_020557	CTT	2	6	2292928	2292933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_020557	GCG	2	6	2292941	2292946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_020557	CTG	2	6	2292987	2292992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_020557	CAGG	2	8	2293215	2293222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10082	NC_020557	TCC	2	6	2293275	2293280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10083	NC_020557	GTTC	2	8	2293281	2293288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10084	NC_020557	CGC	2	6	2293308	2293313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10085	NC_020557	CT	3	6	2293341	2293346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10086	NC_020557	TTGAAT	2	12	2293359	2293370	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_020557	AATTA	2	10	2293423	2293432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_020557	GTTT	2	8	2293436	2293443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_020557	TCT	3	9	2293512	2293520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_020557	TTG	2	6	2293549	2293554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_020557	T	6	6	2293632	2293637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_020557	A	6	6	2293649	2293654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_020557	CCT	2	6	2294476	2294481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_020557	AGA	2	6	2294509	2294514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020557	CAAA	3	12	2294521	2294532	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10096	NC_020557	A	6	6	2294530	2294535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_020557	A	6	6	2295945	2295950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_020557	AATA	2	8	2296468	2296475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_020557	TAC	2	6	2296482	2296487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_020557	ATT	2	6	2297003	2297008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_020557	TTTC	2	8	2298289	2298296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_020557	CA	3	6	2300200	2300205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_020557	T	7	7	2300208	2300214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020557	CTTTC	2	10	2300541	2300550	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10105	NC_020557	GCT	2	6	2300559	2300564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_020557	T	7	7	2300564	2300570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_020557	TTA	2	6	2300579	2300584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_020557	ACT	2	6	2300614	2300619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_020557	GA	3	6	2300626	2300631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_020557	AAT	2	6	2300633	2300638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_020557	A	6	6	2300649	2300654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_020557	ATA	2	6	2300681	2300686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_020557	CAT	2	6	2300722	2300727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_020557	AAC	2	6	2300733	2300738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_020557	A	6	6	2300752	2300757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_020557	GT	3	6	2300770	2300775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_020557	CGA	2	6	2302166	2302171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_020557	CTT	2	6	2303262	2303267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_020557	ATA	2	6	2303301	2303306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_020557	AAC	2	6	2303315	2303320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_020557	T	7	7	2303371	2303377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020557	AAT	2	6	2303453	2303458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_020557	GAT	2	6	2303468	2303473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_020557	T	12	12	2304709	2304720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_020557	TTC	2	6	2304722	2304727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_020557	T	6	6	2304739	2304744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_020557	AAGTT	2	10	2304768	2304777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_020557	T	7	7	2304785	2304791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_020557	A	6	6	2304797	2304802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_020557	TAA	2	6	2304811	2304816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10389	NC_020557	TGTA	2	8	2364554	2364561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10390	NC_020557	A	7	7	2364626	2364632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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