MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 9709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020450	ACA	2	6	1283978	1283983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_020450	AATTT	2	10	1284008	1284017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_020450	TTC	2	6	1284045	1284050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_020450	TAA	2	6	1284061	1284066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_020450	AAT	2	6	1284086	1284091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_020450	ATA	2	6	1284123	1284128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_020450	A	7	7	1284144	1284150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_020450	GAG	2	6	1284151	1284156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_020450	T	6	6	1285676	1285681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_020450	TTA	2	6	1285731	1285736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_020450	TTC	2	6	1285798	1285803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_020450	ATA	2	6	1285906	1285911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_020450	TA	3	6	1285910	1285915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020450	ATC	2	6	1286628	1286633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_020450	CAA	2	6	1286658	1286663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_020450	TAT	3	9	1286719	1286727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_020450	ATA	2	6	1286735	1286740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_020450	CAT	2	6	1286753	1286758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_020450	TAA	2	6	1286827	1286832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_020450	AT	3	6	1286915	1286920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_020450	A	6	6	1286934	1286939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020450	TA	3	6	1289018	1289023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020450	ATT	2	6	1289036	1289041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_020450	TATT	3	12	1289080	1289091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_020450	A	6	6	1290102	1290107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_020450	ATG	2	6	1290119	1290124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_020450	TAT	2	6	1290129	1290134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_020450	TAAT	2	8	1290149	1290156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_020450	CTG	2	6	1290168	1290173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_020450	ATT	2	6	1290202	1290207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_020450	A	7	7	1291760	1291766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_020450	T	6	6	1291784	1291789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_020450	A	7	7	1292967	1292973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_020450	ATTT	2	8	1292988	1292995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_020450	T	6	6	1292993	1292998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_020450	TA	3	6	1293013	1293018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_020450	A	6	6	1293031	1293036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_020450	ACT	2	6	1293045	1293050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_020450	TAT	2	6	1293057	1293062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_020450	CTTC	2	8	1293105	1293112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_020450	CTC	2	6	1293113	1293118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_020450	T	6	6	1294164	1294169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_020450	T	6	6	1294176	1294181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_020450	TAA	2	6	1294194	1294199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_020450	CCT	2	6	1294242	1294247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_020450	TAA	2	6	1294251	1294256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020450	A	7	7	1294255	1294261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_020450	TCT	2	6	1294278	1294283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_020450	GAT	2	6	1294294	1294299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_020450	TTA	2	6	1294327	1294332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_020450	TCAT	2	8	1294351	1294358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_020450	A	6	6	1294363	1294368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_020450	T	6	6	1294374	1294379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020450	GTT	2	6	1294383	1294388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_020450	ATT	2	6	1294416	1294421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_020450	T	6	6	1294439	1294444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_020450	ATT	2	6	1294454	1294459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_020450	T	6	6	1294466	1294471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_020450	TAT	2	6	1294509	1294514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_020450	TAA	2	6	1297675	1297680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_020450	TAA	2	6	1297686	1297691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_020450	ATG	2	6	1297704	1297709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_020450	ATA	2	6	1297743	1297748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_020450	TAAAA	2	10	1298491	1298500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_020450	CAC	2	6	1298515	1298520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_020450	T	6	6	1298526	1298531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_020450	TG	3	6	1301297	1301302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_020450	AAG	2	6	1301329	1301334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_020450	CCT	2	6	1301431	1301436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_020450	T	6	6	1301436	1301441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_020450	A	6	6	1301448	1301453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_020450	AAT	2	6	1301486	1301491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_020450	A	7	7	1301495	1301501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020450	TAT	2	6	1301510	1301515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_020450	TGT	2	6	1301566	1301571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5077	NC_020450	AAT	2	6	1301703	1301708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_020450	TTCT	2	8	1301717	1301724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_020450	T	7	7	1301738	1301744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_020450	T	7	7	1303283	1303289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_020450	AAT	2	6	1306045	1306050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_020450	TTA	2	6	1306272	1306277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_020450	A	8	8	1306281	1306288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_020450	TA	3	6	1306312	1306317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_020450	TTTTG	2	10	1306338	1306347	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_020450	ACA	2	6	1306364	1306369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_020450	TTA	2	6	1308595	1308600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_020450	AGG	2	6	1308606	1308611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_020450	A	6	6	1308836	1308841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_020450	ATT	2	6	1312468	1312473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_020450	TGT	2	6	1312476	1312481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020450	AT	3	6	1312534	1312539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_020450	TTA	2	6	1312567	1312572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020450	TAA	2	6	1312587	1312592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_020450	ATTA	2	8	1312602	1312609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_020450	ATT	2	6	1312618	1312623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_020450	ATT	2	6	1312632	1312637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_020450	AAAT	2	8	1312652	1312659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_020450	TTA	2	6	1312673	1312678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_020450	A	8	8	1312702	1312709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_020450	CTT	2	6	1312723	1312728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_020450	AT	3	6	1312733	1312738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_020450	ATTT	2	8	1312763	1312770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_020450	ATT	2	6	1312811	1312816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_020450	TAA	2	6	1312869	1312874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_020450	ATTATA	2	12	1312892	1312903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_020450	A	8	8	1313653	1313660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020450	TAC	2	6	1313661	1313666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_020450	GTA	2	6	1313681	1313686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_020450	ATA	2	6	1313704	1313709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_020450	TGAT	2	8	1313753	1313760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_020450	ATA	2	6	1313818	1313823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_020450	TAT	2	6	1313906	1313911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_020450	TAAA	2	8	1313978	1313985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_020450	A	7	7	1313983	1313989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_020450	T	6	6	1314007	1314012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_020450	AAT	2	6	1314017	1314022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_020450	CT	3	6	1315743	1315748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_020450	T	6	6	1315802	1315807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_020450	CGATT	2	10	1315823	1315832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5126	NC_020450	CTT	2	6	1315838	1315843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_020450	TTTC	2	8	1315910	1315917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_020450	GCA	2	6	1315999	1316004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_020450	T	6	6	1316018	1316023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_020450	AGAT	2	8	1316064	1316071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_020450	TA	4	8	1316076	1316083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_020450	CTT	2	6	1316138	1316143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_020450	CTT	2	6	1316171	1316176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_020450	CTT	2	6	1316196	1316201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_020450	CTAT	2	8	1316230	1316237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5136	NC_020450	TGT	2	6	1316268	1316273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_020450	AAT	2	6	1316304	1316309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_020450	AT	3	6	1316372	1316377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_020450	TCA	2	6	1316429	1316434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_020450	AAT	2	6	1316447	1316452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_020450	TAA	2	6	1316457	1316462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_020450	CAA	2	6	1316500	1316505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5143	NC_020450	TTC	2	6	1316536	1316541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5144	NC_020450	TTTC	2	8	1316607	1316614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5148	NC_020450	ATC	2	6	1316753	1316758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5152	NC_020450	TCA	2	6	1316981	1316986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_020450	T	6	6	1317308	1317313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_020450	AGTA	2	8	1317318	1317325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_020450	A	6	6	1320394	1320399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_020450	ACA	2	6	1320673	1320678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_020450	CCT	2	6	1320690	1320695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5256	NC_020450	A	7	7	1320732	1320738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_020450	T	6	6	1320751	1320756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_020450	TTC	2	6	1320821	1320826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_020450	T	7	7	1320835	1320841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_020450	TTG	2	6	1320923	1320928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_020450	ATTC	2	8	1320952	1320959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5264	NC_020450	T	6	6	1321022	1321027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5404	NC_020450	A	6	6	1354026	1354031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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