MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 1614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020130	TGA	2	6	185654	185659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020130	TA	3	6	185674	185679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020130	ATA	2	6	185687	185692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020130	ACC	2	6	185693	185698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_020130	AGCAT	2	10	185738	185747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1506	NC_020130	CTA	2	6	185751	185756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020130	T	7	7	185774	185780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020130	TA	3	6	185799	185804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020130	TTTA	2	8	185834	185841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020130	A	6	6	185854	185859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020130	TTA	2	6	185861	185866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020130	ATA	2	6	185878	185883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020130	ATA	2	6	185912	185917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020130	AT	3	6	185926	185931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020130	TTA	2	6	185966	185971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020130	GTA	2	6	185975	185980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020130	AAG	2	6	185996	186001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020130	ATT	2	6	186040	186045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020130	TAAA	2	8	186093	186100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020130	TAGG	2	8	186122	186129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020130	TAGG	2	8	186164	186171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020130	CGG	2	6	186178	186183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_020130	T	6	6	186605	186610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020130	AT	3	6	186646	186651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020130	TA	3	6	186697	186702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020130	TAT	2	6	186719	186724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020130	CA	8	16	187638	187653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_020130	CT	8	16	187654	187669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_020130	T	8	8	187692	187699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020130	TCT	2	6	187704	187709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_020130	TAT	2	6	187773	187778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020130	TAT	2	6	187785	187790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020130	AGA	2	6	187836	187841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020130	TAA	2	6	187858	187863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020130	TTTTA	2	10	187870	187879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020130	TTA	2	6	187924	187929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020130	T	8	8	187945	187952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020130	A	7	7	187967	187973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_020130	AGCA	2	8	187993	188000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_020130	TAT	2	6	188008	188013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020130	AT	3	6	188026	188031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020130	AT	3	6	188051	188056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020130	TAT	2	6	188075	188080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020130	AT	3	6	188083	188088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020130	TA	3	6	188089	188094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020130	T	6	6	188118	188123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020130	CT	3	6	188176	188181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_020130	TA	3	6	188182	188187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020130	TTG	2	6	188201	188206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020130	ACT	2	6	188207	188212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_020130	T	7	7	188308	188314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020130	T	6	6	188347	188352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020130	ACT	2	6	188353	188358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_020130	TA	4	8	189814	189821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020130	A	6	6	189821	189826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020130	T	6	6	189844	189849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020130	GTT	2	6	189858	189863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020130	AGT	2	6	189864	189869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020130	AAT	2	6	189870	189875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020130	TAAT	2	8	189910	189917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020130	TAA	2	6	189967	189972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020130	AAT	2	6	189986	189991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020130	TA	3	6	190042	190047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020130	TAG	2	6	190055	190060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020130	TAAAG	2	10	190061	190070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020130	AGA	2	6	190089	190094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020130	GA	4	8	190093	190100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020130	ATG	2	6	190118	190123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020130	TTA	2	6	190136	190141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020130	AAT	2	6	190158	190163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020130	TA	3	6	190186	190191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020130	TA	3	6	190213	190218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020130	AGT	2	6	190233	190238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020130	TCTA	2	8	190241	190248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_020130	TTCTT	2	10	190289	190298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1576	NC_020130	CTT	2	6	190319	190324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_020130	TAT	2	6	192454	192459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020130	T	6	6	192479	192484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020130	AT	3	6	192567	192572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020130	TTA	2	6	192584	192589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020130	T	7	7	192594	192600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020130	A	6	6	192604	192609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020130	TAT	2	6	192610	192615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020130	TA	3	6	192617	192622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020130	ATA	2	6	192627	192632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020130	T	6	6	192642	192647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020130	A	7	7	192656	192662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020130	TAA	2	6	192667	192672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020130	TA	3	6	192679	192684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020130	TA	3	6	192694	192699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020130	AT	3	6	192708	192713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020130	T	7	7	192726	192732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020130	A	6	6	192738	192743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_020130	AAT	2	6	192811	192816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020130	T	6	6	192868	192873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020130	A	6	6	192900	192905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_020130	TA	3	6	192918	192923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_020130	TTG	2	6	192946	192951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020130	AG	3	6	192966	192971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020130	TCT	2	6	193543	193548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_020130	T	7	7	193578	193584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020130	TAT	2	6	193609	193614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020130	AG	4	8	193616	193623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020130	TAT	3	9	193652	193660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020130	TAAT	2	8	193665	193672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020130	ATTA	2	8	193694	193701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020130	A	6	6	193764	193769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020130	ATT	2	6	193777	193782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020130	T	7	7	193808	193814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020130	AGA	2	6	193823	193828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020130	AGA	2	6	194528	194533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020130	ATA	2	6	194539	194544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020130	TAAC	2	8	194545	194552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_020130	CTTAT	2	10	194577	194586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.