MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 1614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020130	AT	3	6	110441	110446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020130	AT	6	12	110449	110460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020130	TAA	2	6	110487	110492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020130	TAAT	2	8	110498	110505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020130	TAT	2	6	110507	110512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020130	TA	3	6	110526	110531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020130	T	7	7	110541	110547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020130	TG	3	6	110564	110569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020130	TAA	2	6	110584	110589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020130	TAT	2	6	110599	110604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020130	AT	3	6	110603	110608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020130	GT	4	8	110644	110651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020130	ATTT	2	8	110660	110667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020130	TTA	2	6	110680	110685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020130	TG	19	38	111271	111308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020130	CGT	2	6	111345	111350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_020130	ATA	2	6	111374	111379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020130	TAA	2	6	111389	111394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020130	A	6	6	111426	111431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020130	T	7	7	111436	111442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020130	GTA	2	6	111473	111478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020130	ATGT	2	8	111508	111515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020130	ACA	2	6	111528	111533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_020130	AAGG	2	8	111539	111546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020130	ATAA	2	8	111549	111556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020130	AAC	2	6	111560	111565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_020130	TTA	2	6	111600	111605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020130	ATA	2	6	111624	111629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020130	A	7	7	111635	111641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020130	A	6	6	111681	111686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020130	ACT	2	6	111709	111714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_020130	TA	3	6	111725	111730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020130	ATA	2	6	111749	111754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020130	TA	6	12	111753	111764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020130	ACA	2	6	111782	111787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020130	T	6	6	111817	111822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020130	TAT	2	6	111844	111849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020130	AAAT	2	8	111895	111902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020130	CT	3	6	111972	111977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_020130	CTT	2	6	111999	112004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_020130	TAA	2	6	112068	112073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020130	ATA	2	6	112098	112103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020130	CTAT	2	8	112107	112114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_020130	CAAT	2	8	112137	112144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_020130	A	6	6	112161	112166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020130	GTC	2	6	112181	112186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_020130	ATTT	2	8	112218	112225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020130	A	7	7	112236	112242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020130	TAA	2	6	112254	112259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020130	TAA	2	6	112271	112276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020130	GTT	2	6	112321	112326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020130	TAA	2	6	112328	112333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020130	A	6	6	112332	112337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020130	ATA	2	6	112418	112423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020130	TTA	2	6	112426	112431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020130	ATTT	2	8	112437	112444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020130	TTCT	2	8	112478	112485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_020130	A	6	6	112496	112501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020130	TAA	2	6	112533	112538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020130	AGTT	2	8	112569	112576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020130	GTT	2	6	112587	112592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020130	ATA	2	6	112652	112657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020130	TA	4	8	112685	112692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020130	A	6	6	112732	112737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020130	AAT	2	6	112773	112778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020130	T	6	6	112778	112783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020130	A	8	8	112787	112794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020130	TAT	2	6	112829	112834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020130	CAT	2	6	112883	112888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_020130	TCA	2	6	114278	114283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_020130	A	6	6	114308	114313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020130	TAT	2	6	114337	114342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020130	TA	4	8	114410	114417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020130	A	7	7	114453	114459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020130	AAAG	2	8	114468	114475	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020130	AT	3	6	114476	114481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020130	CTA	2	6	114486	114491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_020130	TA	3	6	114490	114495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020130	TCT	2	6	114506	114511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_020130	TA	3	6	114533	114538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020130	TA	4	8	114540	114547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020130	A	13	13	114592	114604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020130	AT	3	6	114621	114626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020130	TTA	2	6	114630	114635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020130	AAC	2	6	114658	114663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_020130	TCT	2	6	114668	114673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_020130	T	7	7	114687	114693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020130	ATA	2	6	115569	115574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020130	TTA	2	6	117098	117103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020130	TAT	2	6	117108	117113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020130	T	7	7	117119	117125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020130	TAT	2	6	117145	117150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020130	TTA	2	6	117151	117156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020130	ATG	2	6	117169	117174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020130	TCTTT	2	10	117175	117184	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_020130	T	7	7	117188	117194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020130	AGT	2	6	117215	117220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020130	AT	3	6	117234	117239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020130	TATC	2	8	117250	117257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_020130	TTA	2	6	117276	117281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020130	ATT	2	6	117330	117335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020130	ATC	2	6	117383	117388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_020130	TAT	2	6	117396	117401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020130	ATA	2	6	117404	117409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020130	GA	3	6	117414	117419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020130	ATT	3	9	117420	117428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020130	T	7	7	117442	117448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020130	AT	3	6	117490	117495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020130	TGT	2	6	117536	117541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020130	AT	3	6	117554	117559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020130	GT	3	6	121033	121038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020130	ATTTT	2	10	121046	121055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020130	T	6	6	121052	121057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020130	AT	3	6	121059	121064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020130	ATATT	2	10	121073	121082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020130	TTTA	2	8	121086	121093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020130	TAA	2	6	121112	121117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020130	T	6	6	121149	121154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020130	GATA	2	8	121174	121181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020130	A	6	6	121181	121186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020130	GAA	2	6	121187	121192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020130	GTA	2	6	121218	121223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020130	T	6	6	121230	121235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020130	A	6	6	121239	121244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020130	ATA	2	6	121294	121299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020130	TCTA	2	8	121310	121317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_020130	ATA	2	6	121319	121324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020130	AGT	2	6	121384	121389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020130	AGG	2	6	121393	121398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020130	T	6	6	121399	121404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020130	TTG	2	6	121434	121439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020130	AAT	2	6	121442	121447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020130	AT	3	6	121464	121469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020130	TAT	2	6	121476	121481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020130	AT	3	6	121486	121491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020130	AGA	2	6	121522	121527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020130	ATG	2	6	121564	121569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020130	AT	3	6	121577	121582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_020130	ATA	2	6	121590	121595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_020130	TTAT	2	8	121626	121633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_020130	TAT	2	6	121637	121642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_020130	T	6	6	121644	121649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_020130	T	6	6	121662	121667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_020130	TAT	2	6	121714	121719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1147	NC_020130	A	6	6	121758	121763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1150	NC_020130	TTC	2	6	121825	121830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1151	NC_020130	T	6	6	121835	121840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1157	NC_020130	ACA	2	6	125223	125228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1164	NC_020130	A	7	7	126889	126895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1176	NC_020130	A	7	7	128853	128859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1177	NC_020130	T	7	7	128860	128866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1182	NC_020130	T	7	7	128917	128923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1183	NC_020130	ATA	2	6	128935	128940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_020130	TAATG	2	10	136361	136370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_020130	T	6	6	137826	137831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_020130	AT	3	6	138014	138019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_020130	AT	3	6	138053	138058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_020130	TAT	3	9	138056	138064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_020130	GAA	2	6	138070	138075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_020130	T	8	8	138085	138092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_020130	TAT	2	6	138099	138104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_020130	TTAA	2	8	138120	138127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_020130	AGAT	2	8	176642	176649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_020130	ACG	2	6	176733	176738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_020130	TA	3	6	178182	178187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_020130	TA	3	6	178200	178205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1429	NC_020130	TAAT	2	8	178322	178329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1462	NC_020130	TA	3	6	183581	183586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_020130	AT	3	6	183599	183604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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